177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3262 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3262  amidohydrolase  100 
 
 		 361 aa  722    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5929  amidohydrolase  57.75 
 
 		 356 aa  370  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.117607  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2226  amidohydrolase  55.93 
 
 		 360 aa  362  4e-99  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000139869 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2486  amidohydrolase  53.11 
 
 		 360 aa  358  9.999999999999999e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.445092  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11020  amidohydrolase, imidazolonepropionase  50.7 
 
 		 366 aa  354  1e-96  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.161229  normal  0.0546284 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4010  amidohydrolase  54.57 
 
 		 361 aa  342  5e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1281  amidohydrolase  53.99 
 
 		 364 aa  340  2e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.413404 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12929  hypothetical protein  52.54 
 
 		 370 aa  339  5e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0687  normal  0.519945 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3462  amidohydrolase 3  54.4 
 
 		 365 aa  338  9.999999999999999e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1960  amidohydrolase  53.8 
 
 		 368 aa  332  9e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2006  amidohydrolase  53.8 
 
 		 368 aa  332  9e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0811412  normal  0.722686 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1940  amidohydrolase  53.53 
 
 		 368 aa  330  2e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.864175 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09720  Pro-Hyp dipeptidase  53.98 
 
 		 354 aa  327  1.0000000000000001e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.885607 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2182  amidohydrolase  51.81 
 
 		 360 aa  327  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.322343  normal  0.931322 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1397  amidohydrolase  51.53 
 
 		 359 aa  322  4e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.503845  decreased coverage  0.00549847 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23760  amidohydrolase, imidazolonepropionase  51.24 
 
 		 378 aa  321  9.999999999999999e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.318525 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4181  amidohydrolase  52.79 
 
 		 362 aa  313  3.9999999999999997e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1612  amidohydrolase  48.96 
 
 		 358 aa  301  1e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0569822  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1166  amidohydrolase  48.77 
 
 		 373 aa  300  3e-80  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1469  amidohydrolase  49.56 
 
 		 362 aa  290  2e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.145414 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1562  amidohydrolase 3  47.75 
 
 		 362 aa  288  9e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.345787  normal  0.0640888 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3142  amidohydrolase  48.88 
 
 		 359 aa  278  1e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000508689  normal  0.129698 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1191  amidohydrolase  49.02 
 
 		 359 aa  276  3e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.251504  normal  0.0810275 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09960  amidohydrolase, imidazolonepropionase  49.46 
 
 		 388 aa  276  3e-73  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0916327  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2082  amidohydrolase  47.09 
 
 		 357 aa  276  5e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1302  amidohydrolase  47.49 
 
 		 359 aa  259  4e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2244  amidohydrolase  46.46 
 
 		 367 aa  257  2e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.244187  normal  0.209508 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0984  amidohydrolase  41.11 
 
 		 358 aa  231  1e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000000713577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1219  amidohydrolase  27.75 
 
 		 390 aa  102  1e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.82253  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2609  amidohydrolase  27.91 
 
 		 396 aa  99.8  6e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3036  amidohydrolase  25.51 
 
 		 407 aa  97.1  4e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04041  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  28.01 
 
 		 430 aa  96.7  5e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0087  amidohydrolase  27.22 
 
 		 423 aa  96.7  6e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0161193  normal  0.19517 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4565  amidohydrolase  27.41 
 
 		 423 aa  96.3  8e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.244661  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1348  putative Xaa-Pro dipeptidase  25.69 
 
 		 434 aa  94.4  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2646  amidohydrolase  27.22 
 
 		 407 aa  93.6  5e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2716  amidohydrolase  26.8 
 
 		 407 aa  91.7  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2719  amidohydrolase  27.34 
 
 		 440 aa  91.7  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4215  amidohydrolase  27.39 
 
 		 412 aa  90.5  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2992  amidohydrolase  24.68 
 
 		 433 aa  90.5  4e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4277  amidohydrolase  25.91 
 
 		 431 aa  89.4  9e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0333  amidohydrolase  25.71 
 
 		 407 aa  87.8  3e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3749  amidohydrolase  27.15 
 
 		 408 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.468026  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3822  amidohydrolase  27.15 
 
 		 408 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3761  amidohydrolase  27.15 
 
 		 408 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.225154  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0432  amidohydrolase  27.93 
 
 		 421 aa  86.7  6e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5427  amidohydrolase  28.37 
 
 		 432 aa  85.5  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.726254  normal  0.0808338 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3715  amidohydrolase  31.28 
 
 		 417 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.355417  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3788  amidohydrolase  31.28 
 
 		 417 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.463322  normal  0.142834 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3728  amidohydrolase  31.28 
 
 		 417 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1062  amidohydrolase  26.42 
 
 		 426 aa  85.1  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.574986 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13368  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  26.23 
 
 		 426 aa  84.7  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.256749  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0913  amidohydrolase  27.93 
 
 		 438 aa  84  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887966  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2437  amidohydrolase  26.4 
 
 		 411 aa  82.8  0.000000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3237  amidohydrolase  26.23 
 
 		 404 aa  82.8  0.000000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.136124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2466  amidohydrolase  31.06 
 
 		 424 aa  82.8  0.000000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.357249  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0159  amidohydrolase  29.86 
 
 		 415 aa  81.3  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2825  amidohydrolase  27.32 
 
 		 433 aa  81.3  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.886429  normal  0.061566 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0801  amidohydrolase  24.37 
 
 		 437 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4292  amidohydrolase  27.35 
 
 		 402 aa  81.6  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.756284 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0420  amidohydrolase  29.85 
 
 		 418 aa  81.6  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3368  amidohydrolase  31.36 
 
 		 414 aa  81.3  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.929128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3308  amidohydrolase  28.12 
 
 		 419 aa  80.5  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692035  normal  0.417277 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2334  amidohydrolase  27.25 
 
 		 455 aa  80.5  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1408  amidohydrolase  29.06 
 
 		 402 aa  79.7  0.00000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.321357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4188  amidohydrolase  30.21 
 
 		 421 aa  79.3  0.00000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2711  amidohydrolase  23.55 
 
 		 400 aa  79  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.959959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1826  Pro-Hyp dipeptidase  26.11 
 
 		 426 aa  78.2  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4855  amidohydrolase  24.47 
 
 		 403 aa  78.2  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.165345  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3741  amidohydrolase  23.73 
 
 		 444 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0626  amidohydrolase  27.43 
 
 		 433 aa  77.8  0.0000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.151482 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3982  amidohydrolase  26.45 
 
 		 445 aa  77  0.0000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2978  amidohydrolase  29.21 
 
 		 429 aa  76.3  0.0000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01184  conserved hypothetical protein  24.86 
 
 		 445 aa  75.9  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2771  amidohydrolase  22.89 
 
 		 413 aa  75.5  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2115  amidohydrolase  25.89 
 
 		 426 aa  75.5  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00030  conserved hypothetical protein  26.94 
 
 		 443 aa  74.7  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.215737 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2318  amidohydrolase  24.43 
 
 		 428 aa  75.1  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246502  normal  0.0431533 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2515  amidohydrolase  26.8 
 
 		 426 aa  74.7  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1413  amidohydrolase  28.68 
 
 		 423 aa  74.7  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4304  amidohydrolase  25.94 
 
 		 470 aa  74.7  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2224  amidohydrolase  28.27 
 
 		 459 aa  74.7  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.331693  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18800  amidohydrolase, imidazolonepropionase  28.92 
 
 		 416 aa  73.6  0.000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0282711  normal  0.197659 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0935  amidohydrolase  26.21 
 
 		 428 aa  73.2  0.000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.755972  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2646  amidohydrolase  26.93 
 
 		 391 aa  72.8  0.000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3194  hypothetical protein  25.25 
 
 		 447 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.352282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2208  amidohydrolase  27.53 
 
 		 440 aa  72.4  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00166067 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3671  amidohydrolase  30.24 
 
 		 428 aa  72.8  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1967  amidohydrolase  25.87 
 
 		 405 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0915842 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0479  amidohydrolase  22.49 
 
 		 401 aa  72  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2823  amidohydrolase  26.63 
 
 		 422 aa  70.1  0.00000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.750141  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1549  amidohydrolase  25.98 
 
 		 413 aa  70.1  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64121  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0681  amidohydrolase  25.13 
 
 		 432 aa  70.5  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.312549  normal  0.59002 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0434  putative secreted hydrolase  23.99 
 
 		 430 aa  69.3  0.00000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0268  putative Xaa-Pro dipeptidase  24.57 
 
 		 451 aa  68.6  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.309565  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3597  amidohydrolase  33.17 
 
 		 445 aa  68.6  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2139  amidohydrolase  29.69 
 
 		 408 aa  67.8  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.018924 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5618  amidohydrolase  28.57 
 
 		 422 aa  67.8  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.313113  normal  0.102085 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2941  amidohydrolase  26.57 
 
 		 390 aa  66.2  0.0000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.270763  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1959  amidohydrolase  30.51 
 
 		 409 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>