More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3245 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3245  phage integrase family protein  100 
 
 		 312 aa  608  1e-173  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.676462  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09860  tyrosine recombinase XerC subunit  56.66 
 
 		 329 aa  340  2e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0989  integrase family protein  61.69 
 
 		 292 aa  335  3.9999999999999995e-91  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0618431 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3115  integrase family protein  60.19 
 
 		 336 aa  329  3e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0082342  normal  0.151412 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2471  tyrosine recombinase XerC subunit  58.75 
 
 		 308 aa  325  6e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0340389  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1990  site-specific tyrosine recombinase XerC  57.67 
 
 		 300 aa  323  3e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2036  site-specific tyrosine recombinase XerC  57.67 
 
 		 300 aa  323  3e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0541579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1970  site-specific tyrosine recombinase XerC  57.67 
 
 		 300 aa  321  8e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.397741 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2207  site-specific tyrosine recombinase XerC  58.75 
 
 		 319 aa  318  1e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.787262  normal  0.257716 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5914  integrase family protein  59.42 
 
 		 325 aa  313  1.9999999999999998e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000658468  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4135  site-specific tyrosine recombinase XerC  57 
 
 		 300 aa  312  4.999999999999999e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.383086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1317  phage integrase family protein  55.87 
 
 		 325 aa  311  6.999999999999999e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3995  integrase family protein  65.02 
 
 		 311 aa  311  7.999999999999999e-84  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2210  integrase family protein  56.16 
 
 		 295 aa  310  2e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000241024 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2194  integrase family protein  54.98 
 
 		 317 aa  307  2.0000000000000002e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.103281  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1654  integrase family protein  59.2 
 
 		 298 aa  300  3e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2102  integrase family protein  59.32 
 
 		 304 aa  298  8e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.167189  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12908  site-specific tyrosine recombinase XerC  56.52 
 
 		 298 aa  295  5e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000436053  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1481  integrase family protein  58.92 
 
 		 308 aa  293  3e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.141471  normal  0.0727308 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23640  tyrosine recombinase XerC subunit  53.36 
 
 		 310 aa  286  2.9999999999999996e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.154193  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1547  phage integrase family protein  54.74 
 
 		 336 aa  285  8e-76  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.268843 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0674  site-specific tyrosine recombinase XerC  57.05 
 
 		 303 aa  278  7e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2509  integrase family protein  56.39 
 
 		 380 aa  276  5e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.593152  normal  0.73908 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10100  site-specific recombinase XerD  50.15 
 
 		 332 aa  265  8.999999999999999e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11170  site-specific recombinase XerD  49.85 
 
 		 336 aa  264  2e-69  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0225756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1208  integrase family protein  50.85 
 
 		 363 aa  262  6.999999999999999e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0235  integrase family protein  53.22 
 
 		 289 aa  252  5.000000000000001e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0485  site-specific tyrosine recombinase XerC  44.69 
 
 		 322 aa  252  7e-66  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.853028 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1159  integrase family protein  54.73 
 
 		 344 aa  246  3e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.226555 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09270  tyrosine recombinase XerC subunit  48.75 
 
 		 346 aa  245  9e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.111586  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0251  site-specific tyrosine recombinase XerC  42.69 
 
 		 355 aa  241  1e-62  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00631913  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1178  integrase family protein  54.72 
 
 		 329 aa  237  2e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.801835  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3583  phage integrase  49.53 
 
 		 385 aa  226  5.0000000000000005e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0602  phage integrase family protein  46.41 
 
 		 317 aa  223  2e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00243284  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1982  tyrosine recombinase XerC  37.83 
 
 		 298 aa  221  9e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026523  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2346  tyrosine recombinase XerC  43.05 
 
 		 302 aa  219  3e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.126195  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_623  site-specific recombinase  38.8 
 
 		 307 aa  214  9.999999999999999e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0341  tyrosine recombinase XerC  42.04 
 
 		 317 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000100724  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0716  tyrosine recombinase XerC  38.8 
 
 		 307 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.841608  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1521  tyrosine recombinase XerD  41.43 
 
 		 346 aa  213  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.531713  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  42.47 
 
 		 295 aa  214  1.9999999999999998e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1501  tyrosine recombinase XerD subunit  40.47 
 
 		 295 aa  213  2.9999999999999995e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  39.33 
 
 		 296 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3654  site-specific tyrosine recombinase XerC  39.18 
 
 		 301 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1525  integrase family protein  44.02 
 
 		 327 aa  212  5.999999999999999e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.206219  hitchhiker  0.00883097 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0842  hypothetical protein  39.86 
 
 		 290 aa  212  5.999999999999999e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3873  site-specific tyrosine recombinase XerC  39.18 
 
 		 299 aa  212  7e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00557083  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1225  integrase family protein  38.69 
 
 		 301 aa  211  1e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.103765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  35.79 
 
 		 295 aa  210  2e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1932  tyrosine recombinase XerD  47.06 
 
 		 310 aa  210  2e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  39.6 
 
 		 299 aa  211  2e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0651  tyrosine recombinase XerC subunit  38.13 
 
 		 307 aa  211  2e-53  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0185  site-specific tyrosine recombinase XerC  42 
 
 		 299 aa  209  3e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0623  site-specific recombinase  41.94 
 
 		 332 aa  210  3e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3590  site-specific tyrosine recombinase XerC  39.18 
 
 		 299 aa  209  4e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0796955  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0222  integrase/recombinase XerC  41.67 
 
 		 299 aa  209  5e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  39 
 
 		 296 aa  209  5e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3878  site-specific tyrosine recombinase XerC  39.18 
 
 		 299 aa  209  5e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000107327  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  39 
 
 		 296 aa  209  5e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3572  site-specific tyrosine recombinase XerC  39.18 
 
 		 299 aa  209  6e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000685052  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3843  site-specific tyrosine recombinase XerC  39.18 
 
 		 299 aa  209  6e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1524  integrase family protein  37.75 
 
 		 300 aa  208  7e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.681425  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1099  tyrosine recombinase XerD  39.67 
 
 		 296 aa  208  7e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3682  site-specific tyrosine recombinase XerC  39.18 
 
 		 299 aa  208  8e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.245295  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3969  site-specific tyrosine recombinase XerC  39.18 
 
 		 299 aa  208  8e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000391393  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  40.73 
 
 		 298 aa  208  8e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  38.67 
 
 		 296 aa  207  1e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1028  tyrosine recombinase XerD subunit  43.52 
 
 		 313 aa  208  1e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00856798  unclonable  0.00000000634873 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  38.67 
 
 		 296 aa  207  2e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  38.67 
 
 		 296 aa  207  2e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  38.67 
 
 		 296 aa  207  2e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  38.67 
 
 		 296 aa  207  2e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  38.67 
 
 		 296 aa  207  2e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  38 
 
 		 296 aa  207  2e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  38.67 
 
 		 296 aa  207  2e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  36.75 
 
 		 297 aa  207  2e-52  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1520  tyrosine recombinase XerD  41.18 
 
 		 362 aa  206  3e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000383292 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1314  site-specific tyrosine recombinase XerC  38.49 
 
 		 299 aa  206  3e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  unclonable  8.39468e-26 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1320  tyrosine recombinase XerD  43.14 
 
 		 302 aa  206  4e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2483  site-specific tyrosine recombinase XerC  38.49 
 
 		 299 aa  205  7e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000855714  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1312  tyrosine recombinase XerC  38.28 
 
 		 298 aa  205  9e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.199373  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1337  tyrosine recombinase XerC  38.28 
 
 		 298 aa  205  9e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0149085  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3929  site-specific tyrosine recombinase XerC  38.14 
 
 		 299 aa  204  2e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2052  tyrosine recombinase XerD  39.4 
 
 		 296 aa  204  2e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6023  site-specific tyrosine recombinase XerC  43.67 
 
 		 303 aa  204  2e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3042  tyrosine recombinase XerD subunit  42.24 
 
 		 294 aa  202  4e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000138339  normal  0.959316 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1001  integrase family protein  40.42 
 
 		 333 aa  203  4e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  39.8 
 
 		 294 aa  202  5e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  42.61 
 
 		 294 aa  202  5e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_998  integrase/recombinase  37.42 
 
 		 302 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1202  tyrosine recombinase XerC  42.18 
 
 		 304 aa  200  1.9999999999999998e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.910177  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1383  integrase family protein  44.68 
 
 		 307 aa  200  3e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69710  site-specific tyrosine recombinase XerC  42.33 
 
 		 303 aa  199  7e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.737312  normal  0.478185 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0285  tyrosine recombinase XerC  42.42 
 
 		 302 aa  199  7e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0235  Integrase  40 
 
 		 308 aa  198  7.999999999999999e-50  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.386202  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3474  site-specific tyrosine recombinase XerC  43.14 
 
 		 296 aa  198  9e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.486058 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0676  tyrosine recombinase XerD subunit  35.76 
 
 		 296 aa  198  9e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1003  tyrosine recombinase XerD subunit  36.33 
 
 		 302 aa  198  1.0000000000000001e-49  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.497558  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1383  integrase family protein  39.41 
 
 		 299 aa  198  1.0000000000000001e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00162011  normal  0.640047 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0242  site-specific tyrosine recombinase XerC  40.67 
 
 		 299 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.322874  normal  0.826572 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>