More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3240 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3240  ribosome recycling factor  100 
 
 		 185 aa  377  1e-104  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0997  ribosome recycling factor  65.41 
 
 		 185 aa  253  9e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.168842  normal  0.480698 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1539  ribosome recycling factor  65.41 
 
 		 185 aa  251  6e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.34519 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1866  ribosome recycling factor  62.16 
 
 		 185 aa  250  9.000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0861324 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1418  ribosome recycling factor  63.24 
 
 		 185 aa  245  2e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.441102 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1532  ribosome recycling factor  60.54 
 
 		 185 aa  243  9e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0437112 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1387  ribosome recycling factor  61.08 
 
 		 185 aa  242  1.9999999999999999e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000002033 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1007  ribosome recycling factor  62.16 
 
 		 185 aa  241  6e-63  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2504  ribosome recycling factor  62.16 
 
 		 185 aa  239  1e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.599102  normal  0.470707 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1183  ribosome recycling factor  59.46 
 
 		 185 aa  239  2e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11220  ribosome recycling factor  59.78 
 
 		 186 aa  236  2e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0977787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3988  ribosome recycling factor  58.38 
 
 		 185 aa  231  3e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.556234  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06770  ribosome recycling factor  57.3 
 
 		 185 aa  231  3e-60  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.000531316  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1370  ribosome recycling factor  57.84 
 
 		 185 aa  231  4.0000000000000004e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.102814  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0679  ribosome recycling factor  57.84 
 
 		 185 aa  229  1e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.445733  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1325  ribosome recycling factor  57.84 
 
 		 185 aa  226  2e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23580  ribosome recycling factor  56.76 
 
 		 185 aa  225  3e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.275445 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1233  ribosome recycling factor  56.76 
 
 		 185 aa  224  5.0000000000000005e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.408531  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0241  ribosome recycling factor  55.14 
 
 		 185 aa  224  5.0000000000000005e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2201  ribosome recycling factor  58.38 
 
 		 185 aa  224  7e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.29734 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3579  ribosome recycling factor  54.05 
 
 		 185 aa  221  3e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09920  ribosome recycling factor  55.14 
 
 		 185 aa  221  4e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.95344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1164  ribosome recycling factor  52.97 
 
 		 185 aa  221  4.9999999999999996e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.10149  normal  0.221517 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3110  ribosome recycling factor  55.14 
 
 		 185 aa  220  8e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000000193761  hitchhiker  0.00426294 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1487  ribosome recycling factor  58.38 
 
 		 185 aa  219  1.9999999999999999e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.632003 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5908  ribosome recycling factor  53.51 
 
 		 185 aa  217  8.999999999999998e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.107758  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10150  ribosome recycling factor  57.46 
 
 		 188 aa  213  9.999999999999999e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.775897  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1674  ribosome recycling factor  52.43 
 
 		 185 aa  212  1.9999999999999998e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3407  ribosome recycling factor  57.3 
 
 		 185 aa  211  4.9999999999999996e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0276302  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1985  ribosome recycling factor  51.35 
 
 		 185 aa  207  9e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2004  ribosome recycling factor  51.35 
 
 		 185 aa  207  9e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2050  ribosome recycling factor  51.35 
 
 		 185 aa  207  9e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.774761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2221  ribosome recycling factor  52.43 
 
 		 185 aa  207  9e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0750591  normal  0.159368 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4123  ribosome recycling factor  50.27 
 
 		 185 aa  206  1e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12896  ribosome recycling factor  51.35 
 
 		 185 aa  206  2e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.460587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0806  ribosome recycling factor  52.49 
 
 		 184 aa  206  2e-52  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2111  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 185 aa  205  4e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0077  ribosome recycling factor  49.19 
 
 		 185 aa  196  1.0000000000000001e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.010398  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1144  ribosome recycling factor  50.27 
 
 		 185 aa  196  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000279866  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1813  ribosome recycling factor  50.85 
 
 		 184 aa  193  1e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000182094  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0885  ribosome recycling factor  49.19 
 
 		 185 aa  192  3e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000127588  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1035  ribosome recycling factor  48.65 
 
 		 185 aa  191  4e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000462528  unclonable  0.0000000105333 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1658  ribosome recycling factor  48.37 
 
 		 184 aa  191  6e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.375108  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0407  ribosome recycling factor  48.07 
 
 		 183 aa  188  4e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00332415  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3865  ribosome recycling factor  48.65 
 
 		 185 aa  187  5e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00928808  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3871  ribosome recycling factor  48.65 
 
 		 185 aa  187  5e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0168076  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3706  ribosome recycling factor  48.11 
 
 		 185 aa  187  5.999999999999999e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0497206  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1975  ribosome recycling factor  45.95 
 
 		 184 aa  187  8e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.552095  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3922  ribosome recycling factor  48.11 
 
 		 185 aa  187  1e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0969461  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1401  ribosome recycling factor  50 
 
 		 186 aa  186  2e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.100309  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2036  ribosome recycling factor  48.11 
 
 		 186 aa  185  3e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3565  ribosome recycling factor  47.57 
 
 		 185 aa  184  4e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.603259  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3583  ribosome recycling factor  47.57 
 
 		 185 aa  184  4e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1321  ribosome recycling factor  47.57 
 
 		 185 aa  185  4e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.198825  hitchhiker  0.00000000000000123018 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3836  ribosome recycling factor  47.57 
 
 		 185 aa  184  4e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.64109e-62 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3647  ribosome recycling factor  47.03 
 
 		 185 aa  184  6e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0174734  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0629  ribosome recycling factor  52.3 
 
 		 190 aa  184  9e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.701086  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3675  ribosome recycling factor  47.57 
 
 		 185 aa  183  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.979275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3962  ribosome recycling factor  47.57 
 
 		 185 aa  183  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.60954  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2476  ribosome recycling factor  46.49 
 
 		 185 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000697706  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3514  ribosome recycling factor  47.03 
 
 		 185 aa  182  2.0000000000000003e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.763665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07680  ribosome recycling factor  45.41 
 
 		 185 aa  179  1e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029169  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0216  ribosome recycling factor  47.13 
 
 		 185 aa  179  2.9999999999999997e-44  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3210  ribosome recycling factor  47.03 
 
 		 185 aa  177  4.999999999999999e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000238814  hitchhiker  0.0000000602253 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1512  ribosome recycling factor  46.49 
 
 		 185 aa  177  1e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00300903  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2753  ribosome recycling factor  44.86 
 
 		 185 aa  176  2e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.63878  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0581  ribosome recycling factor  43.48 
 
 		 184 aa  176  2e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0445  ribosome recycling factor  44.25 
 
 		 185 aa  176  2e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00199228  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1488  ribosome recycling factor  45.41 
 
 		 185 aa  175  3e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0169142 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4958  ribosome recycling factor  43.48 
 
 		 192 aa  175  3e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.759908  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1003  ribosome recycling factor  45.98 
 
 		 183 aa  175  4e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000111257  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0629  ribosome recycling factor  47.22 
 
 		 187 aa  174  5e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.418172 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1345  ribosome recycling factor  44.57 
 
 		 184 aa  174  6e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00867514  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1319  ribosome recycling factor  44.57 
 
 		 184 aa  174  6e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.362878  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1918  ribosome recycling factor  43.78 
 
 		 185 aa  173  9.999999999999999e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1676  ribosome recycling factor  43.78 
 
 		 185 aa  173  9.999999999999999e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1422  ribosome recycling factor  43.24 
 
 		 187 aa  174  9.999999999999999e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0768793  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0065  ribosome recycling factor  45.56 
 
 		 182 aa  173  9.999999999999999e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.759475  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1670  ribosome recycling factor  43.78 
 
 		 185 aa  173  1.9999999999999998e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2560  ribosome recycling factor  47.51 
 
 		 181 aa  172  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3730  ribosome recycling factor  43.78 
 
 		 185 aa  171  5e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000151569  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3546  ribosome recycling factor  46.96 
 
 		 181 aa  171  6.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1282  ribosome recycling factor  42.7 
 
 		 185 aa  169  2e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000366075  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2882  ribosome recycling factor  45.65 
 
 		 185 aa  169  2e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000396733  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1142  ribosome recycling factor  44.86 
 
 		 185 aa  169  2e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000869669  normal  0.111417 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0507  ribosome recycling factor  45 
 
 		 182 aa  168  3e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0010  ribosome recycling factor  43.65 
 
 		 192 aa  169  3e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0696052  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1351  hypothetical protein  44.44 
 
 		 186 aa  168  3e-41  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2632  ribosome recycling factor  45.41 
 
 		 185 aa  168  5e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000751677  normal  0.363086 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3158  ribosome recycling factor  44.86 
 
 		 185 aa  167  7e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000691666  normal  0.144971 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1918  ribosome recycling factor  40.54 
 
 		 185 aa  167  8e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.36169e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0475  ribosome recycling factor  47.03 
 
 		 185 aa  167  8e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.840836  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2112  ribosome recycling factor  45.86 
 
 		 186 aa  167  8e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2472  ribosome recycling factor  44.32 
 
 		 185 aa  167  1e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07611  ribosome recycling factor  47.98 
 
 		 173 aa  166  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0633499 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2919  ribosome recycling factor  43.48 
 
 		 186 aa  166  2e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.174611 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1128  ribosome recycling factor  42.93 
 
 		 184 aa  166  2e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.440044  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3278  ribosome recycling factor  45.41 
 
 		 185 aa  166  2e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000213543  hitchhiker  0.000283754 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0826  ribosome recycling factor  41.85 
 
 		 184 aa  166  2.9999999999999998e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000458151  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1944  ribosome recycling factor  41.44 
 
 		 184 aa  165  2.9999999999999998e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.757618 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>