85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3221 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_3221  saccharopine dehydrogenase  100 
 
 
407 aa  830  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4946  saccharopine dehydrogenase  77.24 
 
 
407 aa  622  1e-177  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5327  saccharopine dehydrogenase  77.24 
 
 
407 aa  621  1e-177  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0356987  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5034  saccharopine dehydrogenase  77.24 
 
 
407 aa  622  1e-177  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1950  hypothetical protein  69.85 
 
 
408 aa  565  1e-160  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275408  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4677  Saccharopine dehydrogenase  70.91 
 
 
401 aa  536  1e-151  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3295  Saccharopine dehydrogenase  66.18 
 
 
403 aa  518  1e-146  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.886794  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1201  saccharopine dehydrogenase  33.17 
 
 
402 aa  209  1e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.150944  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2539  saccharopine dehydrogenase  31.76 
 
 
398 aa  206  4e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2320  Saccharopine dehydrogenase  31.96 
 
 
396 aa  206  8e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1535  Saccharopine dehydrogenase  32.28 
 
 
396 aa  198  1e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.82797 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2516  saccharopine dehydrogenase  31.99 
 
 
396 aa  197  3e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.558897  normal  0.297438 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0572  saccharopine dehydrogenase  32.37 
 
 
398 aa  197  3e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0902  saccharopine dehydrogenase  30.77 
 
 
397 aa  197  4e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  1.68136e-06 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2607  saccharopine dehydrogenase  30.02 
 
 
398 aa  196  5e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1597  Acyl carrier protein (ACP)  31.78 
 
 
399 aa  196  9e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.30891  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2095  saccharopine dehydrogenase-like protein  30.2 
 
 
399 aa  194  2e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1676  Saccharopine dehydrogenase  30.02 
 
 
398 aa  191  2e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0203222  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0148  Saccharopine dehydrogenase  31.23 
 
 
409 aa  191  2e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003102  carboxynorspermidine dehydrogenase putative  30.88 
 
 
414 aa  191  2e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.185885  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0186  saccharopine dehydrogenase  31.16 
 
 
401 aa  191  3e-47  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1790  saccharopine dehydrogenase  30.75 
 
 
401 aa  191  3e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02740  hypothetical protein  30.88 
 
 
417 aa  189  9e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0208  saccharopine dehydrogenase  30.68 
 
 
401 aa  187  3e-46  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.69447  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0165  saccharopine dehydrogenase  30.68 
 
 
401 aa  187  3e-46  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1555  Saccharopine dehydrogenase  30.56 
 
 
401 aa  187  4e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  1.42738e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03351  Carboxynorspermidine dehydrogenase  30.73 
 
 
400 aa  186  4e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00142848  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0748  saccharopine dehydrogenase  30.49 
 
 
400 aa  186  5e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0747  saccharopine dehydrogenase  30.92 
 
 
403 aa  186  5e-46  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  4.18334e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4440  saccharopine dehydrogenase  29.78 
 
 
401 aa  186  6e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1307  Saccharopine dehydrogenase  31.92 
 
 
399 aa  185  1e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.84986e-15 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6504  Saccharopine dehydrogenase  32.23 
 
 
395 aa  185  1e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.752719  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2137  saccharopine dehydrogenase  28.98 
 
 
414 aa  183  5e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0299628  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2918  Saccharopine dehydrogenase  31.36 
 
 
398 aa  182  6e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1181  saccharopine dehydrogenase  30.39 
 
 
394 aa  182  7e-45  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.886294  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1128  Saccharopine dehydrogenase  30.71 
 
 
399 aa  182  9e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.785881  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1231  hypothetical protein  29.45 
 
 
414 aa  182  9e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  1.292e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0415  saccharopine dehydrogenase  30.92 
 
 
405 aa  181  3e-44  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2142  Saccharopine dehydrogenase  30.02 
 
 
404 aa  181  3e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3052  saccharopine dehydrogenase  29.73 
 
 
399 aa  180  4e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0352  hypothetical protein  29.43 
 
 
413 aa  179  8e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0458  saccharopine dehydrogenase  29.47 
 
 
401 aa  178  1e-43  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0999  saccharopine dehydrogenase  28.29 
 
 
405 aa  178  1e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0445398  hitchhiker  0.00533099 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0125  Saccharopine dehydrogenase  30.96 
 
 
403 aa  179  1e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0285  saccharopine dehydrogenase  29.95 
 
 
404 aa  178  2e-43  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0061  saccharopine dehydrogenase  30.19 
 
 
403 aa  177  3e-43  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2289  saccharopine dehydrogenase  28.61 
 
 
405 aa  177  3e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.772575  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0438  saccharopine dehydrogenase  28.95 
 
 
426 aa  176  5e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0417875  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0677  saccharopine dehydrogenase  28.92 
 
 
397 aa  176  5e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.10466 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3519  Saccharopine dehydrogenase  30.22 
 
 
405 aa  176  6e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.368548  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1081  saccharopine dehydrogenase  28.4 
 
 
399 aa  176  9e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.706576  normal  0.0928318 
 
 
-
 
NC_004310  BR0335  hypothetical protein  29.19 
 
 
413 aa  175  1e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2888  Saccharopine dehydrogenase  29.34 
 
 
403 aa  172  9e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.120454 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0981  saccharopine dehydrogenase  30.11 
 
 
398 aa  169  6e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0620633  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4157  saccharopine dehydrogenase  29.19 
 
 
413 aa  167  4e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.152115  normal  0.83779 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1922  saccharopine dehydrogenase  28.24 
 
 
392 aa  165  1e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00339893 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1380  saccharopine dehydrogenase  28.61 
 
 
412 aa  157  4e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000104449  normal  0.291708 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0988  saccharopine dehydrogenase  28.71 
 
 
413 aa  156  6e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  5.77497e-06 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2884  saccharopine dehydrogenase  29.19 
 
 
412 aa  153  6e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2928  saccharopine dehydrogenase  28.23 
 
 
414 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2764  saccharopine dehydrogenase  28.23 
 
 
414 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.114818  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5844  hypothetical protein  27.27 
 
 
413 aa  149  1e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2955  saccharopine dehydrogenase  29.93 
 
 
407 aa  148  2e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2844  saccharopine dehydrogenase  30 
 
 
399 aa  147  4e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.241943 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2125  saccharopine dehydrogenase  30 
 
 
399 aa  146  5e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.530272  normal  0.238501 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1475  saccharopine dehydrogenase family protein  28.71 
 
 
412 aa  141  2e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0126  saccharopine dehydrogenase  28.71 
 
 
412 aa  141  2e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.281282 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0028  saccharopine dehydrogenase  25.6 
 
 
412 aa  135  2e-30  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0914  putative saccharopine dehydrogenase family protein  26.18 
 
 
424 aa  134  2e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.867111  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1715  saccharopine dehydrogenase  25.83 
 
 
422 aa  134  4e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  6.59439e-10  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1501  saccharopine dehydrogenase  25.65 
 
 
424 aa  133  7e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1202  saccharopine dehydrogenase  26.02 
 
 
403 aa  101  3e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1835  Saccharopine dehydrogenase  25.73 
 
 
398 aa  99.8  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.257501  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2976  saccharopine dehydrogenase  23.63 
 
 
415 aa  63.5  6e-09  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.809568  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0384  Saccharopine dehydrogenase  25 
 
 
384 aa  61.6  3e-08  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0854083  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1254  Saccharopine dehydrogenase  23.53 
 
 
385 aa  60.8  4e-08  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1441  hypothetical protein  20.56 
 
 
394 aa  51.2  3e-05  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1242  saccharopine dehydrogenase  21.29 
 
 
394 aa  50.8  5e-05  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1219  saccharopine dehydrogenase, NADP+, L-lysine forming; L-lysine dehydrogenase  20.75 
 
 
394 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.182404  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1241  hypothetical protein  20.75 
 
 
394 aa  47.4  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1416  hypothetical protein  20.75 
 
 
394 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.572078 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1342  hypothetical protein  20.75 
 
 
394 aa  47.4  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1217  saccharopine dehydrogenase, NADP+, L-lysine forming; L-lysine dehydrogenase  20.75 
 
 
394 aa  47.4  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1482  hypothetical protein  20.3 
 
 
394 aa  47  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1941  Saccharopine dehydrogenase  24.41 
 
 
446 aa  45.1  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>