More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3023 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_3023  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  100 
 
 
314 aa  617  1e-176  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2218  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  62.5 
 
 
354 aa  322  4e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20720  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  56.64 
 
 
325 aa  318  9e-86  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.14446  normal  0.252754 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28080  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  57.65 
 
 
354 aa  314  9.999999999999999e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.640026  normal  0.438535 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2944  Prolipoprotein diacylglyceryltransferase-like protein  60.9 
 
 
372 aa  313  1.9999999999999998e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0870252  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5705  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  52.27 
 
 
388 aa  312  4.999999999999999e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2870  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  54.64 
 
 
498 aa  310  2e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00175644  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1455  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  56.9 
 
 
322 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5699  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  53.58 
 
 
371 aa  302  6.000000000000001e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.116082  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1076  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  55.71 
 
 
333 aa  298  9e-80  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0236556  normal  0.51143 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2569  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  54.85 
 
 
295 aa  296  2e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000200473  hitchhiker  0.00320491 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1218  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  52.9 
 
 
285 aa  294  1e-78  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3073  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  54.74 
 
 
347 aa  294  2e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000171179  hitchhiker  0.000454743 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2491  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.53 
 
 
344 aa  293  3e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3214  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  54.67 
 
 
323 aa  291  9e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1502  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  56.21 
 
 
303 aa  291  9e-78  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2962  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50.96 
 
 
334 aa  287  2e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.464449 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3064  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.51 
 
 
865 aa  285  8e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.333242  normal  0.223199 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3048  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  53.43 
 
 
954 aa  284  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.814492  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3107  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  53.43 
 
 
954 aa  284  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.851617  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4475  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  51.89 
 
 
345 aa  281  8.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00262186  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1983  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  59.93 
 
 
292 aa  280  2e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2945  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  52.23 
 
 
585 aa  280  2e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.214407  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10990  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  53.95 
 
 
327 aa  279  4e-74  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.175815  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2819  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50.87 
 
 
820 aa  272  5.000000000000001e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.200403  normal  0.775609 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12920  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  52.65 
 
 
290 aa  268  7e-71  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.870796  normal  0.137466 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1685  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.97 
 
 
396 aa  268  7e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000186875 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3597  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  52.81 
 
 
767 aa  267  2e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.136017  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1690  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.85 
 
 
409 aa  264  1e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.268506  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3170  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50.93 
 
 
372 aa  259  4e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.129029  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3169  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50.17 
 
 
378 aa  258  1e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.131558 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3340  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  52.17 
 
 
301 aa  256  3e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.469594  normal  0.470788 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3394  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  51.99 
 
 
390 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.45327 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0462  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.65 
 
 
342 aa  251  1e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.285848  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11630  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.47 
 
 
468 aa  247  1e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.102821 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2513  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50.19 
 
 
362 aa  247  2e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3014  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.45 
 
 
409 aa  245  6e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0478204 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4457  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.13 
 
 
319 aa  245  6e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0207952  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1169  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.49 
 
 
356 aa  240  2e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.760314  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4470  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.67 
 
 
293 aa  231  1e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4301  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.67 
 
 
293 aa  231  1e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.693008  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4201  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.67 
 
 
293 aa  231  1e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0626  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.62 
 
 
327 aa  224  1e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.467167  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0804  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  42.31 
 
 
305 aa  223  4e-57  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1934  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50.42 
 
 
387 aa  219  5e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0138413  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1139  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.72 
 
 
282 aa  210  2e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14920  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  38.49 
 
 
307 aa  206  6e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.13542  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0481  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  41.07 
 
 
315 aa  201  9.999999999999999e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.04165  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0984  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  36.12 
 
 
320 aa  162  1e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0195  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  34.75 
 
 
297 aa  160  3e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.337573  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3339  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.23 
 
 
276 aa  160  3e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4306  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.23 
 
 
290 aa  159  6e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0465  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  38.41 
 
 
299 aa  156  4e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4345  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  38.52 
 
 
285 aa  155  9e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2864  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  37.78 
 
 
305 aa  154  2e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.375352  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2585  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  37.29 
 
 
293 aa  153  5e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.221457  normal  0.189717 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0737  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  34.62 
 
 
257 aa  148  9e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1230  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  37.98 
 
 
289 aa  148  1.0000000000000001e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0607531 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1792  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  35.04 
 
 
303 aa  147  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05151  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  34.67 
 
 
303 aa  147  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.404739 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1279  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.82 
 
 
250 aa  147  3e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1736  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  37.14 
 
 
280 aa  146  4.0000000000000006e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0556739  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1192  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  35.04 
 
 
279 aa  146  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0909  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.47 
 
 
292 aa  146  4.0000000000000006e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.173456  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1165  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  35.04 
 
 
279 aa  146  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1967  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.45 
 
 
282 aa  146  5e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.394112  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04851  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.34 
 
 
297 aa  146  5e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2716  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.68 
 
 
251 aa  145  7.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000613339  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0626  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  36.68 
 
 
292 aa  145  8.000000000000001e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0767  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.33 
 
 
293 aa  145  9e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0790  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.33 
 
 
293 aa  145  9e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05241  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.21 
 
 
297 aa  145  1e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0904  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  36.05 
 
 
293 aa  144  2e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1553  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  38.21 
 
 
288 aa  144  2e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.880731 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0460  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  31.23 
 
 
297 aa  142  7e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.262365  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0720  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  34.59 
 
 
263 aa  142  8e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0760049  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05161  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  31.09 
 
 
297 aa  142  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.889276  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06631  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  35.27 
 
 
304 aa  140  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1408  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.31 
 
 
289 aa  139  6e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.997076  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3170  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  34.94 
 
 
270 aa  138  8.999999999999999e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04611  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.98 
 
 
303 aa  134  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0868  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  39.06 
 
 
291 aa  133  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.514857  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0473  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.62 
 
 
357 aa  129  5.0000000000000004e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0590188  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2986  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.46 
 
 
269 aa  129  7.000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0528161  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0639  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.79 
 
 
261 aa  128  1.0000000000000001e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.875971  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1554  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.3 
 
 
271 aa  126  5e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000775379  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0627  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  38.1 
 
 
290 aa  126  6e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.616827  normal  0.157864 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0370  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  31.87 
 
 
275 aa  124  2e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0785  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  30.4 
 
 
279 aa  119  4.9999999999999996e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.577083  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0802  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  30.4 
 
 
279 aa  119  4.9999999999999996e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1327  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  29.88 
 
 
278 aa  116  3.9999999999999997e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000868448  normal 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C63  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.08 
 
 
268 aa  114  2.0000000000000002e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5281  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  30.47 
 
 
270 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.514764  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5266  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  30.04 
 
 
270 aa  113  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4855  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  30.04 
 
 
270 aa  114  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5247  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  30.04 
 
 
270 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2374  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  30.38 
 
 
257 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5011  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  30.04 
 
 
270 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5391  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  30.04 
 
 
270 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5676  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  30.47 
 
 
270 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>