286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2976 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2976  urea amidolyase related protein  100 
 
 		 298 aa  560  1e-158  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3556  urea amidolyase related protein  55.24 
 
 		 308 aa  256  3e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.392081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2975  allophanate hydrolase  52.14 
 
 		 288 aa  251  8.000000000000001e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0524316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06210  biotin-dependent carboxylase-like protein  53.71 
 
 		 290 aa  249  5e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.447378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1968  allophanate hydrolase subunit 2  54.23 
 
 		 286 aa  247  2e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.138307  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2196  urea amidolyase related protein  54.88 
 
 		 293 aa  247  2e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.859253  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2601  urea amidolyase-like protein  57.19 
 
 		 312 aa  242  7e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.983467 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0098  urea amidolyase related protein  57.82 
 
 		 312 aa  241  1e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0095  urea amidolyase related protein  56.12 
 
 		 311 aa  239  5e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000550439 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7094  allophanate hydrolase subunit 2  48.88 
 
 		 325 aa  237  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.169878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00380  biotin-dependent carboxylase-like protein  54.04 
 
 		 285 aa  236  3e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.301441 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1379  urea amidolyase related protein  53 
 
 		 282 aa  231  2e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0813478  normal  0.896147 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0869  hypothetical protein  48.34 
 
 		 549 aa  228  1e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2450  allophanate hydrolase subunit 2  48.98 
 
 		 553 aa  217  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.76901  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0095  urea amidolyase related protein  46.71 
 
 		 555 aa  215  7e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5727  allophanate hydrolase subunit 2  47.95 
 
 		 531 aa  213  3.9999999999999995e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.506367  normal  0.818149 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2921  urea amidolyase related protein  45.16 
 
 		 309 aa  210  3e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0092  urea amidolyase related protein  52.9 
 
 		 282 aa  209  4e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10267  hypothetical protein  44.48 
 
 		 300 aa  209  5e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.368185  normal  0.239017 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0175  urea amidolyase related protein  46.6 
 
 		 562 aa  207  1e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0378  urea amidolyase related protein  46.26 
 
 		 298 aa  207  2e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00676966 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3511  allophanate hydrolase subunit 2  49.15 
 
 		 539 aa  205  7e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.80956  normal  0.701023 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4802  urea amidolyase related protein  52.26 
 
 		 288 aa  203  4e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.467113 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0257  urea amidolyase related protein  45.7 
 
 		 292 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.170917 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6834  urea amidolyase related protein  53.19 
 
 		 285 aa  200  1.9999999999999998e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0267  allophanate hydrolase subunit 2  45.7 
 
 		 292 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0277  urea amidolyase related protein  45.7 
 
 		 292 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.957119  normal  0.165219 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0100  Allophanate hydrolase subunit 2  43.03 
 
 		 564 aa  199  3.9999999999999996e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.368046  normal  0.0250714 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2769  urea amidolyase related protein  47.44 
 
 		 571 aa  199  6e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0149332  hitchhiker  0.000017266 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3520  Allophanate hydrolase subunit 2  47.55 
 
 		 510 aa  199  6e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5847  hypothetical protein  44.78 
 
 		 541 aa  197  2.0000000000000003e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0879773  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5380  allophanate hydrolase, putative  42.71 
 
 		 539 aa  196  3e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0499  Urea amidolyase-related protein  42.42 
 
 		 534 aa  195  6e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1267  urea amidolyase related protein  47.22 
 
 		 288 aa  194  2e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3293  urea amidolyase related protein  43.88 
 
 		 536 aa  193  3e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1256  urea amidolyase related protein  41.7 
 
 		 310 aa  193  3e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0977176  normal  0.848518 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3109  urea amidolyase related protein  40.2 
 
 		 314 aa  192  7e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0303  urea amidolyase related protein  44.48 
 
 		 314 aa  189  5.999999999999999e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1137  urea amidolyase related protein  42.55 
 
 		 309 aa  189  7e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.878292  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0322  allophanate hydrolase subunit 2  43.75 
 
 		 522 aa  187  2e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.751903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0022  Urea carboxylase  42.09 
 
 		 310 aa  187  2e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00319916 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5816  urea amidolyase related protein  43.97 
 
 		 344 aa  186  5e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.174826  normal  0.0709434 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1227  urea amidolyase related protein  39.2 
 
 		 314 aa  186  6e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1168  urea amidolyase related protein  40.07 
 
 		 316 aa  184  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000170574  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1116  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  40.07 
 
 		 316 aa  184  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000309284  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3590  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  39.72 
 
 		 316 aa  182  5.0000000000000004e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19250  biotin-dependent carboxylase-like protein  44.44 
 
 		 585 aa  182  5.0000000000000004e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6385  allophanate hydrolase subunit 2  40.19 
 
 		 355 aa  176  6e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3033  urea amidolyase related protein  40.52 
 
 		 355 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.74353 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1985  allophanate hydrolase domain-containing protein  37.41 
 
 		 322 aa  174  1.9999999999999998e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2949  urea amidolyase related protein  39.74 
 
 		 356 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.485355  normal  0.639437 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0082  urea amidolyase related protein  43.96 
 
 		 539 aa  173  2.9999999999999996e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3083  urea amidolyase related protein  39.41 
 
 		 356 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00672  predicted enzyme subunit  39.79 
 
 		 310 aa  172  5e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2924  urea amidolyase related protein  39.79 
 
 		 310 aa  172  5e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.126507  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0760  allophanate hydrolase, subunit 2  39.79 
 
 		 310 aa  172  5e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2943  urea amidolyase related protein  39.79 
 
 		 310 aa  172  5e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00661  hypothetical protein  39.79 
 
 		 310 aa  172  5e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2337  urea amidolyase related protein  39.93 
 
 		 323 aa  172  5.999999999999999e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0802  allophanate hydrolase, subunit 2  39.43 
 
 		 310 aa  172  7.999999999999999e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.316983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0737  allophanate hydrolase, subunit 2  39.43 
 
 		 310 aa  171  1e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2424  allophanate hydrolase subunit 2  39.54 
 
 		 355 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3038  urea amidolyase related protein  39.54 
 
 		 355 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000164  allophanate hydrolase subunit 2  37.93 
 
 		 311 aa  171  1e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.732807  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3057  urea amidolyase related protein  39.54 
 
 		 355 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.027939 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1535  urea amidolyase related protein  42.71 
 
 		 339 aa  171  2e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0888352 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0477  allophanate hydrolase, subunit 2  42.76 
 
 		 330 aa  170  3e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.230499  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0727  allophanate hydrolase, subunit 2  39.07 
 
 		 310 aa  169  4e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.25799  normal  0.390135 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0629  allophanate hydrolase, subunit 2  39.79 
 
 		 310 aa  169  4e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05797  allophanate hydrolase, subunit 2  37.1 
 
 		 312 aa  169  7e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2373  urea amidolyase related protein  40.6 
 
 		 349 aa  168  1e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.586718  normal  0.68742 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3742  urea amidolyase related protein  37.18 
 
 		 350 aa  168  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.485682 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1973  urea amidolyase related protein  40.74 
 
 		 348 aa  167  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0088  allophanate hydrolase subunit 2  40.48 
 
 		 339 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.419671  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0011  UreA amidolyase related protein  34.2 
 
 		 328 aa  166  4e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000028869 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2112  allophanate hydrolase, subunit 2  37.58 
 
 		 371 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3310  allophanate hydrolase, subunit 2  37.58 
 
 		 371 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0448  urea amidolyase-like protein  37.58 
 
 		 359 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3368  allophanate hydrolase, subunit 2  37.58 
 
 		 371 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2980  allophanate hydrolase, subunit 2  37.58 
 
 		 371 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.409998  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0253  allophanate hydrolase, subunit 2  37.58 
 
 		 359 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0265  allophanate hydrolase, subunit 2  37.58 
 
 		 359 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0143689  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0870  allophanate hydrolase subunit 2  38.65 
 
 		 310 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.25979 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0836  allophanate hydrolase subunit 2  38.65 
 
 		 310 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.631798  hitchhiker  0.00120762 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0773  allophanate hydrolase subunit 2  38.65 
 
 		 310 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.905688 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0194  Urea amidolyase-related protein  36.89 
 
 		 350 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0760  allophanate hydrolase, subunit 2  38.65 
 
 		 310 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0821  allophanate hydrolase, subunit 2  38.65 
 
 		 310 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0263857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0594  urea amidolyase related protein  44.74 
 
 		 289 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.184258  normal  0.502162 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1596  urea amidolyase related protein  34.28 
 
 		 334 aa  163  3e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2904  urea amidolyase related protein  36.54 
 
 		 350 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.293477 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1407  allophanate hydrolase subunit 2  39.37 
 
 		 304 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0718  hypothetical protein  36.33 
 
 		 309 aa  162  7e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00184612  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0544  putative allophanate hydrolase  32.99 
 
 		 549 aa  161  1e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00179093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1215  urea amidolyase related protein  37.99 
 
 		 310 aa  161  1e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.478811  normal  0.0330317 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1815  urea amidolyase related protein  42.21 
 
 		 339 aa  160  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.22285  normal  0.131642 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1949  urea amidolyase related protein  35.62 
 
 		 328 aa  160  2e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000276448  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0229  urea amidolyase-related protein  39.03 
 
 		 359 aa  159  4e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0533  urea amidolyase related protein  44.67 
 
 		 518 aa  159  5e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.384607  normal  0.0140832 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2957  urea amidolyase related protein  38.16 
 
 		 336 aa  158  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>