20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2960 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2960  hypothetical protein  100 
 
 		 158 aa  282  1.0000000000000001e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.51807  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0112  hypothetical protein  55.84 
 
 		 161 aa  124  6e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0095  hypothetical protein  48.61 
 
 		 160 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0104  hypothetical protein  48.61 
 
 		 160 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.199717 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0737  hypothetical protein  52.41 
 
 		 161 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0085  hypothetical protein  48.61 
 
 		 160 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.296406 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1532  hypothetical protein  56.34 
 
 		 163 aa  115  3e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0624636  hitchhiker  0.00770701 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0664  hypothetical protein  41.4 
 
 		 157 aa  110  8.000000000000001e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0288472 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4044  protein of unknown function DUF456  47.44 
 
 		 159 aa  107  9.000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3993  hypothetical protein  41.25 
 
 		 166 aa  101  4e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16000  Protein of unknown function (DUF456)  46.58 
 
 		 166 aa  101  4e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.148783  normal  0.0914905 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27270  Protein of unknown function (DUF456)  43.54 
 
 		 170 aa  99.4  2e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.236002  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1686  protein of unknown function DUF456  43.45 
 
 		 158 aa  92.4  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0492481  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3772  protein of unknown function DUF456  41.94 
 
 		 167 aa  90.5  8e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0722  hypothetical protein  46.15 
 
 		 159 aa  90.1  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1497  hypothetical protein  44 
 
 		 220 aa  80.5  0.000000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19890  hypothetical protein  38.17 
 
 		 165 aa  78.6  0.00000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.649353  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2540  protein of unknown function DUF456  52.85 
 
 		 164 aa  70.1  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.658317  normal  0.52211 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4908  hypothetical protein  47.75 
 
 		 161 aa  67.4  0.00000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.417496  decreased coverage  0.00174056 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28240  hypothetical protein  48.55 
 
 		 160 aa  65.9  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>