13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2928 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2928  hypothetical protein  100 
 
 		 107 aa  204  4e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03559  predicted inner membrane protein  36.62 
 
 		 120 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.795651  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0028  conserved hypothetical protein  36.62 
 
 		 120 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3888  hypothetical protein  36.62 
 
 		 120 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4183  hypothetical protein  36.62 
 
 		 120 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0025  hypothetical protein  36.62 
 
 		 120 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4041  hypothetical protein  36.62 
 
 		 120 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.796724 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4243  hypothetical protein  36.62 
 
 		 120 aa  45.4  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5107  hypothetical protein  36.62 
 
 		 120 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.315324 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03502  hypothetical protein  36.62 
 
 		 120 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.760134  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0020  hypothetical protein  38.27 
 
 		 118 aa  42.7  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3057  hypothetical protein  40 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.269842  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26240  protein of unknown function DUF  62.5 
 
 		 104 aa  40.4  0.009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>