273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2880 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1613  cobyric acid synthase CobQ  74.01 
 
 		 527 aa  661    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0360  cobyric acid synthase  74.08 
 
 		 491 aa  669    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0971172 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10258  cobyric acid synthase  72.15 
 
 		 494 aa  647    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0479101 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2880  cobyric acid synthase  100 
 
 		 476 aa  933    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0377  cobyric acid synthase  72.91 
 
 		 490 aa  632  1e-180  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2509  cobyric acid synthase  66.94 
 
 		 495 aa  588  1e-167  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.15189  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17700  cobyric acid synthase  66.19 
 
 		 498 aa  582  1.0000000000000001e-165  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0379411  normal  0.993656 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7399  adenosylcobyric acid synthase (glutamine- hydrolyzing)  57.88 
 
 		 509 aa  487  1e-136  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3928  cobyric acid synthase CobQ  56.58 
 
 		 575 aa  479  1e-134  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.111937  normal  0.0307354 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1288  cobyric acid synthase CobQ  58.85 
 
 		 501 aa  475  1e-133  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00711481  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0309  cobyric acid synthase  58.73 
 
 		 501 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6023  cobyric acid synthase CobQ  53.85 
 
 		 529 aa  471  1.0000000000000001e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.945282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0138  cobyric acid synthase  56.31 
 
 		 486 aa  468  1.0000000000000001e-131  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0558  cobyric acid synthase CobQ  57.43 
 
 		 511 aa  468  9.999999999999999e-131  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3554  cobyric acid synthase CobQ  55.67 
 
 		 521 aa  460  9.999999999999999e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5883  cobyric acid synthase CobQ  54.44 
 
 		 509 aa  451  1e-125  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2446  cobyric acid synthase CobQ  55.58 
 
 		 509 aa  444  1e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.117915 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1693  cobyric acid synthase CobQ  52.21 
 
 		 507 aa  443  1e-123  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0137801  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2744  cobyric acid synthase CobQ  53.15 
 
 		 512 aa  438  1e-121  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0267335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2603  cobyric acid synthase  52.68 
 
 		 520 aa  424  1e-117  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.478422  normal  0.158438 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4863  cobyric acid synthase  55.75 
 
 		 508 aa  421  1e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00498054  normal  0.404957 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2128  cobyric acid synthase CobQ  48.34 
 
 		 517 aa  400  9.999999999999999e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.347874  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0634  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  52.93 
 
 		 499 aa  399  9.999999999999999e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2034  cobyric acid synthase  52.16 
 
 		 495 aa  394  1e-108  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0326425 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2051  cobyric acid synthase  52.16 
 
 		 495 aa  394  1e-108  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.831815  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2097  cobyric acid synthase  52.16 
 
 		 495 aa  394  1e-108  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0722506  normal  0.329562 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4734  cobyric acid synthase  47.55 
 
 		 485 aa  369  1e-101  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4113  cobyric acid synthase  46.8 
 
 		 490 aa  363  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47690  cobyric acid synthase  46.39 
 
 		 490 aa  359  5e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00733771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0796  cobyric acid synthase  46.41 
 
 		 481 aa  359  6e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2453  cobyric acid synthase  46.41 
 
 		 481 aa  358  9e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.094745 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33080  cobyric acid synthase  47.24 
 
 		 485 aa  355  8.999999999999999e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0282392  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0384  cobyric acid synthase  47.23 
 
 		 481 aa  353  4e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.541429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1236  cobyric acid synthase  43.9 
 
 		 484 aa  351  1e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.170511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1098  cobyric acid synthase  41.27 
 
 		 517 aa  350  3e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1456  cobyric acid synthase CobQ  43.76 
 
 		 495 aa  350  4e-95  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.727464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0666  cobyric acid synthase  43.69 
 
 		 484 aa  350  4e-95  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1276  cobyric acid synthase  43.76 
 
 		 484 aa  350  5e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.651231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2146  cobyric acid synthase CobQ  43.95 
 
 		 485 aa  349  6e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.363664  normal  0.0198915 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000116  cobyric acid synthase  42.12 
 
 		 485 aa  348  8e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1311  cobyric acid synthase  44.95 
 
 		 483 aa  348  1e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.306129  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2195  cobyric acid synthase  40.63 
 
 		 513 aa  345  1e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1677  cobyric acid synthase  43.09 
 
 		 484 aa  344  2e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2241  cobyric acid synthase  40.43 
 
 		 506 aa  343  2.9999999999999997e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.386357  normal  0.07507 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3272  cobyric acid synthase CobQ  42.92 
 
 		 480 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00599844 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2141  cobyric acid synthase  40.87 
 
 		 506 aa  343  2.9999999999999997e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3127  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  42.19 
 
 		 500 aa  343  2.9999999999999997e-93  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0279  cobyric acid synthase  42.71 
 
 		 489 aa  343  4e-93  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2565  cobyric acid synthase CobQ  43.47 
 
 		 479 aa  343  5e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.263598  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1274  cobyric acid synthase  44.54 
 
 		 506 aa  343  5.999999999999999e-93  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.929502  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05724  cobyric acid synthase  41.04 
 
 		 475 aa  342  5.999999999999999e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4042  cobyric acid synthase  43.56 
 
 		 484 aa  342  8e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3381  cobyric acid synthase  45.38 
 
 		 496 aa  342  9e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1872  cobyric acid synthase  43.48 
 
 		 483 aa  342  9e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2390  cobyric acid synthase  45.81 
 
 		 495 aa  342  1e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0066766 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2188  cobyric acid synthase  40.24 
 
 		 506 aa  342  1e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3377  cobyric acid synthase  42.35 
 
 		 536 aa  341  1e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2354  cobyric acid synthase  40.24 
 
 		 506 aa  342  1e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.066722 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2137  cobyric acid synthase  43.4 
 
 		 484 aa  341  2e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.281937  normal  0.137961 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0240  cobyric acid synthase  41.51 
 
 		 485 aa  340  2e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2656  cobyric acid synthase  44.07 
 
 		 498 aa  340  2.9999999999999998e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.74347  normal  0.607627 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3678  cobyric acid synthase CobQ  40.16 
 
 		 500 aa  340  2.9999999999999998e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0664782  normal  0.329019 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1848  cobyric acid synthase CobQ  44.76 
 
 		 496 aa  340  4e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2381  cobyric acid synthase  42.77 
 
 		 488 aa  340  4e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.62958  decreased coverage  0.00269559 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3745  cobyric acid synthase  44.86 
 
 		 493 aa  339  5e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0646477  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3857  cobyric acid synthase CobQ  40.28 
 
 		 491 aa  339  7e-92  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.929745  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3178  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  44.13 
 
 		 493 aa  339  8e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.954428 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0196  cobyric acid synthase  41.37 
 
 		 491 aa  338  9.999999999999999e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.152835 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2612  cobyric acid synthase CobQ  42.65 
 
 		 494 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2760  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  41.05 
 
 		 507 aa  338  9.999999999999999e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.147797 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3492  cobyric acid synthase  43.56 
 
 		 504 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2606  cobyric acid synthase  42.13 
 
 		 503 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5777  cobyric acid synthase  44.44 
 
 		 511 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.259752 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1284  cobyric acid synthase  37.84 
 
 		 514 aa  337  1.9999999999999998e-91  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0848  cobyric acid synthase  44.15 
 
 		 501 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0783  cobyric acid synthase  40.95 
 
 		 495 aa  337  2.9999999999999997e-91  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5262  cobyric acid synthase CobQ  44.58 
 
 		 488 aa  337  3.9999999999999995e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.841841 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1713  cobyric acid synthase  43.01 
 
 		 486 aa  336  5e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3676  cobyric acid synthase  43.42 
 
 		 486 aa  336  5e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0301884  normal  0.0393979 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2937  cobyric acid synthase  42.74 
 
 		 481 aa  335  7.999999999999999e-91  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0505975  hitchhiker  0.00124265 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0144  cobyric acid synthase  43.15 
 
 		 487 aa  335  1e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1755  cobyric acid synthase  44.56 
 
 		 483 aa  335  1e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.438055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2203  cobyric acid synthase  43.45 
 
 		 484 aa  335  2e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0873321  normal  0.914907 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1039  cobyric acid synthase  44.42 
 
 		 545 aa  333  3e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.999214  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3640  cobyric acid synthase CobQ  39.68 
 
 		 495 aa  333  3e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1045  cobyric acid synthase  44.42 
 
 		 535 aa  333  4e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0181  cobyric acid synthase CobQ  43.2 
 
 		 494 aa  333  5e-90  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0190399  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3448  cobyric acid synthase CobQ  42.04 
 
 		 852 aa  332  6e-90  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2157  cobyric acid synthase  41.98 
 
 		 485 aa  332  6e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.711251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1552  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  47.22 
 
 		 492 aa  332  6e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.333423  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0879  cobyric acid synthase  42.8 
 
 		 523 aa  332  7.000000000000001e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4778  cobyric acid synthase CobQ  47.91 
 
 		 628 aa  332  7.000000000000001e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.316992 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1560  cobyric acid synthase  40.12 
 
 		 503 aa  332  7.000000000000001e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0789  cobyric acid synthase  45.77 
 
 		 494 aa  332  8e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00846074  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2304  cobyric acid synthase  44.62 
 
 		 505 aa  332  9e-90  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1628  cobyric acid synthase  44.42 
 
 		 529 aa  332  9e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.115512  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2971  cobyric acid synthase  44.42 
 
 		 523 aa  332  9e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.106945  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2161  cobyric acid synthase  41.92 
 
 		 539 aa  332  9e-90  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.468126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2316  cobyric acid synthase  44.42 
 
 		 531 aa  332  9e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.0037254  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0484  cobyric acid synthase  40.93 
 
 		 864 aa  332  1e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>