197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2861 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_2861  NUDIX hydrolase  100 
 
 
142 aa  278  2e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.510666  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4976  NUDIX hydrolase  43.26 
 
 
197 aa  103  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00200112 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5556  NUDIX hydrolase  39.29 
 
 
130 aa  71.2  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.239043  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3443  NUDIX hydrolase  48.21 
 
 
525 aa  56.2  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000281945  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37240  ADP-ribose pyrophosphatase  30.83 
 
 
136 aa  55.8  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1221  NUDIX hydrolase  56.36 
 
 
221 aa  54.7  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.365989  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2650  hypothetical protein  35.07 
 
 
315 aa  54.3  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1932  NUDIX hydrolase  52.73 
 
 
221 aa  53.9  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00450491 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1499  Mut/nudix family protein, putative isopentenyl-diphosphate isomerase  45.31 
 
 
170 aa  52.8  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  9.38166e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0038  mutator MutT protein  42.86 
 
 
158 aa  52.4  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.934517  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1775  NUDIX hydrolase  30.4 
 
 
166 aa  50.4  0.000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.108748  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0069  NUDIX hydrolase  59.18 
 
 
221 aa  50.4  0.000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.509046 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12628  hypothetical protein  39.36 
 
 
351 aa  50.4  0.000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.175878  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4170  NUDIX hydrolase  31.71 
 
 
151 aa  49.7  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.258691 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2458  NUDIX hydrolase  45.1 
 
 
138 aa  48.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2433  dATP pyrophosphohydrolase  31.33 
 
 
147 aa  48.9  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0218705  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2175  NUDIX hydrolase  52.08 
 
 
133 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.523963 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0922  NUDIX hydrolase  53.73 
 
 
136 aa  48.9  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2376  NUDIX hydrolase  41.94 
 
 
197 aa  49.3  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.278695  normal  0.316272 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3998  NUDIX hydrolase  45.61 
 
 
154 aa  48.9  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0404394  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1505  MutT/nudix family protein  34.94 
 
 
158 aa  48.9  0.00003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000663569  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0967  hydrolase, NUDIX family  43.86 
 
 
154 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00369926  normal  0.920839 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4267  hydrolase, NUDIX family  41.94 
 
 
154 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.555582  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2957  MutT/nudix family protein  34.15 
 
 
159 aa  48.5  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0605  NUDIX hydrolase  29.57 
 
 
147 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2059  dATP pyrophosphohydrolase  29.45 
 
 
146 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0369752 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2640  MutT/nudix family protein  34.15 
 
 
159 aa  48.1  0.00004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0434568  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1615  NUDIX hydrolase  40.91 
 
 
154 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2852  NUDIX hydrolase  45.61 
 
 
157 aa  48.1  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000177474  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1590  NUDIX hydrolase  40.91 
 
 
154 aa  48.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2701  NUDIX hydrolase  42.19 
 
 
147 aa  47.8  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0393532  normal  0.652309 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2114  dATP pyrophosphohydrolase  29.45 
 
 
150 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00720061 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2054  dATP pyrophosphohydrolase  29.45 
 
 
150 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.830611 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1223  dATP pyrophosphohydrolase  29.45 
 
 
150 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.315157  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1924  NUDIX hydrolase  47.3 
 
 
340 aa  47.8  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1506  NUDIX hydrolase  34.07 
 
 
390 aa  47.8  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01836  dATP pyrophosphohydrolase  29.93 
 
 
150 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.618356  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01824  hypothetical protein  29.93 
 
 
150 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.452157  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1138  NUDIX hydrolase  43.4 
 
 
140 aa  47.4  0.00007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1107  dATP pyrophosphohydrolase  29.93 
 
 
150 aa  47.4  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1958  dATP pyrophosphohydrolase  29.93 
 
 
150 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.683601  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2095  dATP pyrophosphohydrolase  29.93 
 
 
150 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0764827  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1775  NUDIX hydrolase  29.93 
 
 
169 aa  47  0.00008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00597986  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2601  dATP pyrophosphohydrolase  29.93 
 
 
169 aa  47  0.00008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.110942  normal  0.760647 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22390  ADP-ribose pyrophosphatase  46.3 
 
 
196 aa  47.4  0.00008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1259  hypothetical protein  46.43 
 
 
153 aa  47.4  0.00008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1991  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  45.76 
 
 
184 aa  47  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2246  NUDIX hydrolase  37.78 
 
 
168 aa  47  0.00009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.171331  decreased coverage  0.0000730626 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3909  MutT/Nudix family protein  43.86 
 
 
154 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0016299  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1482  NUDIX family protein  43.86 
 
 
143 aa  46.2  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0365982  normal  0.462774 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1347  dATP pyrophosphohydrolase  28.77 
 
 
150 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00224987 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0346  NUDIX hydrolase  47.46 
 
 
182 aa  46.2  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0239643 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4928  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  48.53 
 
 
199 aa  47  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.358749  normal  0.255355 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1767  dATP pyrophosphohydrolase  29.25 
 
 
169 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.502024  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1321  dATP pyrophosphohydrolase  29.25 
 
 
147 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.832088  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2666  NUDIX hydrolase  47.69 
 
 
182 aa  46.2  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.167572 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3901  MutT/Nudix family protein  41.94 
 
 
154 aa  45.8  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000267829  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1205  hypothetical protein  34.12 
 
 
182 aa  45.8  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000418064 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4178  hydrolase, NUDIX family  41.94 
 
 
154 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0036026 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0058  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 
183 aa  45.8  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.993982  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0924  NUDIX hydrolase  26.87 
 
 
133 aa  45.8  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2095  NUDIX hydrolase  50.75 
 
 
327 aa  45.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0792688  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4063  mutT/nudix family protein  41.94 
 
 
141 aa  45.4  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000339826  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4380  mutT/nudix family protein  41.94 
 
 
141 aa  45.4  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000407544  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1230  NUDIX hydrolase  34.31 
 
 
165 aa  45.4  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.310052  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1038  NUDIX hydrolase  30.63 
 
 
144 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.419621  normal  0.38743 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4229  mutT/nudix family protein  42.11 
 
 
154 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000345145  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3045  MutT/NUDIX family phosphohydrolase  25.55 
 
 
153 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9419  hypothetical protein  49.09 
 
 
361 aa  44.3  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4438  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  50 
 
 
199 aa  44.7  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3372  mutT/nudix family protein  25.55 
 
 
153 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2041  8-oxo-dGTPase  44.26 
 
 
162 aa  44.3  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1166  NTP pyrophosphohydrolase  47.27 
 
 
132 aa  44.3  0.0006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2828  mutator MutT protein  47.27 
 
 
132 aa  44.3  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.623153  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0189  NUDIX hydrolase  41.94 
 
 
161 aa  44.3  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2431  hydrolase, nudix family  28.57 
 
 
141 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2480  NUDIX family hydrolase  29.92 
 
 
141 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0910  NUDIX hydrolase  25.37 
 
 
141 aa  44.3  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.479251  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2758  putative mut-like protein  37.8 
 
 
163 aa  43.9  0.0007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3251  NUDIX hydrolase  40.3 
 
 
178 aa  43.9  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000109349  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2639  NUDIX family hydrolase  29.13 
 
 
141 aa  43.9  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2535  NUDIX family hydrolase  29.92 
 
 
141 aa  43.9  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8468  NUDIX hydrolase  47.37 
 
 
130 aa  43.9  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410235  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1408  NUDIX hydrolase  49.09 
 
 
178 aa  43.9  0.0008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.797387  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1126  dimethyladenosine transferase  42.37 
 
 
459 aa  43.9  0.0008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0870793  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2523  hydrolase, nudix family  29.92 
 
 
141 aa  43.9  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.464819  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0697  MutT related protein  40 
 
 
145 aa  43.5  0.0009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.382229  normal  0.361701 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0997  NUDIX hydrolase  45.28 
 
 
153 aa  43.5  0.0009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.665088  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2914  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  38.1 
 
 
179 aa  43.5  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4458  NUDIX hydrolase  53.06 
 
 
131 aa  43.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6631  NUDIX hydrolase  34.04 
 
 
169 aa  43.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.101767 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4287  hydrolase, NUDIX family  40.35 
 
 
152 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000426319  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2044  NUDIX hydrolase  45.45 
 
 
147 aa  43.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00490099 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3117  NUDIX hydrolase  40.68 
 
 
178 aa  43.1  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.129541  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2159  dATP pyrophosphohydrolase  27.56 
 
 
154 aa  43.5  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2758  NUDIX hydrolase  47.27 
 
 
132 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2482  NUDIX hydrolase  27.41 
 
 
138 aa  43.5  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7624  NUDIX hydrolase  44.44 
 
 
169 aa  43.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.299419  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2586  NUDIX hydrolase  30.94 
 
 
138 aa  43.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2396  NUDIX family hydrolase  41.94 
 
 
141 aa  43.5  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.64074  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>