143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2805 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_2805  hypothetical protein  100 
 
 
111 aa  213  9e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0666  hypothetical protein  81.98 
 
 
111 aa  181  2.0000000000000003e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.254156  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05280  hypothetical protein  81.65 
 
 
110 aa  180  5.0000000000000004e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.53643  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0715  hypothetical protein  81.65 
 
 
109 aa  179  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0815  hypothetical protein  81.98 
 
 
111 aa  178  2e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2162  protein of unknown function UPF0060  79.09 
 
 
113 aa  178  2e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.800491  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4423  hypothetical protein  78.9 
 
 
117 aa  175  2e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3474  protein of unknown function UPF0060  80.18 
 
 
111 aa  175  2e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.395847  normal  0.288197 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4238  hypothetical protein  76.58 
 
 
112 aa  174  5e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.12468  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12657  hypothetical protein  80.37 
 
 
110 aa  172  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000162308  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4957  hypothetical protein  75.68 
 
 
111 aa  169  1e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.0343479 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0009  hypothetical protein  78.9 
 
 
110 aa  169  2e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14640  hypothetical protein  78.38 
 
 
111 aa  167  6e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.702088  normal  0.333944 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0931  protein of unknown function UPF0060  75.23 
 
 
109 aa  165  2e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.159877  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3233  hypothetical protein  73.64 
 
 
119 aa  164  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3114  hypothetical protein  74.77 
 
 
111 aa  164  2.9999999999999998e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0138946 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7600  membrane protein  77.06 
 
 
110 aa  164  5e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0769625  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5385  hypothetical protein  70.64 
 
 
110 aa  164  5e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3127  hypothetical protein  74.77 
 
 
108 aa  163  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.247319  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2786  hypothetical protein  77.57 
 
 
113 aa  161  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3406  hypothetical protein  74.77 
 
 
108 aa  161  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.679363  normal  0.282544 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2550  hypothetical protein  80.37 
 
 
131 aa  162  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.201615  normal  0.61856 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2513  hypothetical protein  80.37 
 
 
113 aa  160  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.811146  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2558  hypothetical protein  80.37 
 
 
113 aa  160  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.743036 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2204  hypothetical protein  72.48 
 
 
110 aa  160  5.0000000000000005e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19950  hypothetical protein  70.91 
 
 
112 aa  156  1e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0102643 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4718  protein of unknown function UPF0060  76.15 
 
 
110 aa  149  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0852  protein of unknown function UPF0060  67.96 
 
 
107 aa  142  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.990746 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0982  protein of unknown function UPF0060  53.21 
 
 
112 aa  107  7.000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.236233  normal  0.293859 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1682  hypothetical protein  52.29 
 
 
109 aa  106  9.000000000000001e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1184  hypothetical protein  50.91 
 
 
110 aa  104  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.45839e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1798  hypothetical protein  50 
 
 
110 aa  102  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2216  hypothetical protein  56.31 
 
 
103 aa  102  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.160487  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1681  hypothetical protein  47.62 
 
 
121 aa  95.9  2e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1507  hypothetical protein  42.73 
 
 
111 aa  95.1  3e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0118428  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1733  hypothetical protein  48.18 
 
 
109 aa  94.7  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1757  hypothetical protein  48.18 
 
 
109 aa  94.7  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3546  protein of unknown function UPF0060  48.11 
 
 
108 aa  93.6  9e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2364  hypothetical protein  47.57 
 
 
108 aa  93.6  9e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2408  hypothetical protein  47.57 
 
 
108 aa  93.6  9e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.130394  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45111  predicted protein  47.27 
 
 
126 aa  92.8  1e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.977587  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2546  protein of unknown function UPF0060  44.95 
 
 
118 aa  90.5  6e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.465405 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4073  protein of unknown function UPF0060  51.38 
 
 
122 aa  90.1  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41111  predicted protein  42.2 
 
 
115 aa  85.1  3e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.330048  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2845  hypothetical protein  43.24 
 
 
111 aa  84.7  4e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.215126  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2545  protein of unknown function UPF0060  50 
 
 
108 aa  83.6  8e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.462566 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2715  hypothetical protein  40 
 
 
109 aa  81.3  0.000000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.858893  normal  0.216037 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2942  protein of unknown function UPF0060  37.04 
 
 
109 aa  80.5  0.000000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.255383  hitchhiker  0.00264399 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3084  hypothetical protein  38.1 
 
 
107 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.662192  normal  0.35717 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1170  protein of unknown function UPF0060  38.46 
 
 
106 aa  79.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.540258  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1018  protein of unknown function UPF0060  38.46 
 
 
106 aa  78.6  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.357312  normal  0.312122 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4363  protein of unknown function UPF0060  44.34 
 
 
110 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.313348  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1139  hypothetical protein  39.29 
 
 
110 aa  78.6  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.798922  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0916  hypothetical protein  37.27 
 
 
110 aa  76.6  0.0000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.201272  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0701  hypothetical protein  42.16 
 
 
107 aa  76.6  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2533  protein of unknown function UPF0060  44.44 
 
 
108 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000116156  normal  0.0524259 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1498  hypothetical protein  36.04 
 
 
110 aa  75.1  0.0000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0278138  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2955  hypothetical protein  37.5 
 
 
110 aa  74.3  0.0000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1341  hypothetical protein  40.38 
 
 
126 aa  73.9  0.0000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.43803 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2554  hypothetical protein  36.45 
 
 
110 aa  73.9  0.0000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2087  hypothetical protein  40.37 
 
 
110 aa  73.2  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.752744 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0196  hypothetical protein  34.95 
 
 
107 aa  72.8  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.511333  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3331  hypothetical protein  35.58 
 
 
106 aa  72  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2511  hypothetical protein  35.29 
 
 
106 aa  72.4  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0462845  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1668  protein of unknown function UPF0060  40.37 
 
 
110 aa  72.8  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0587  hypothetical protein  35.92 
 
 
110 aa  72  0.000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1326  hypothetical protein  40 
 
 
105 aa  72  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.685047  normal  0.260826 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2632  hypothetical protein  40.74 
 
 
112 aa  71.2  0.000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.673518 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0485  hypothetical protein  39.09 
 
 
108 aa  70.5  0.000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.376985  normal 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4944  hypothetical protein  38.18 
 
 
110 aa  70.5  0.000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.194262  normal  0.300598 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4032  hypothetical protein  40.57 
 
 
105 aa  70.1  0.000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.581742 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1975  hypothetical protein  40 
 
 
108 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0351  hypothetical protein  37.96 
 
 
110 aa  69.3  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1837  hypothetical protein  38.39 
 
 
111 aa  68.9  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.39802 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0232  hypothetical protein  39.09 
 
 
117 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2302  putative transmembrane protein  38.95 
 
 
99 aa  68.2  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0342  hypothetical protein  36.04 
 
 
110 aa  66.6  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.790185  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05320  hypothetical protein  38.18 
 
 
110 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0866851  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2370  hypothetical protein  40 
 
 
107 aa  65.5  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.458203  normal  0.777163 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1473  hypothetical protein  37.96 
 
 
111 aa  65.9  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1656  hypothetical protein  38.83 
 
 
141 aa  66.2  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.110388  normal  0.226472 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3077  protein of unknown function UPF0060  53.45 
 
 
109 aa  65.9  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0586655 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2230  hypothetical protein  37.38 
 
 
106 aa  64.7  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25900  hypothetical protein  38.68 
 
 
222 aa  64.7  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5052  hypothetical protein  38.68 
 
 
106 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.597089 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2004  hypothetical protein  39.6 
 
 
130 aa  64.3  0.0000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0347623  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1996  hypothetical protein  36.19 
 
 
106 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.550248  normal  0.0123851 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6500  protein of unknown function UPF0060  43.27 
 
 
107 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.813001  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2837  protein of unknown function UPF0060  37.38 
 
 
109 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.578312  normal  0.331063 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01551  hypothetical protein  39.6 
 
 
108 aa  63.5  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.520057  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2061  protein of unknown function UPF0060  39.6 
 
 
108 aa  63.5  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.151826  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01541  hypothetical protein  39.6 
 
 
108 aa  63.5  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.871793  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1655  hypothetical protein  39.6 
 
 
108 aa  63.5  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0427679  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1789  hypothetical protein  39.6 
 
 
108 aa  63.5  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.477899  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2048  hypothetical protein  39.6 
 
 
108 aa  63.5  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.791171  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1618  hypothetical protein  39.22 
 
 
108 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00333014  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2291  hypothetical protein  38.61 
 
 
108 aa  62  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.827947  hitchhiker  0.000000000030396 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1160  hypothetical protein  42.16 
 
 
110 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.760553  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0423  hypothetical protein  42.99 
 
 
110 aa  61.6  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.183716  normal  0.508856 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1172  hypothetical protein  42.16 
 
 
110 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0240568  normal  0.121257 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>