16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2789 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_2789  hypothetical protein  100 
 
 
177 aa  367  1e-101  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.705189  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2623  hypothetical protein  52.47 
 
 
305 aa  153  1e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.140164  normal  0.486862 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2821  hypothetical protein  52.83 
 
 
315 aa  153  1e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.875118  normal  0.0237416 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3856  protein of unknown function DUF35  47.09 
 
 
322 aa  149  3e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.343505  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5255  hypothetical protein  47.71 
 
 
324 aa  144  8.000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.338508 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5059  hypothetical protein  44.51 
 
 
317 aa  143  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.945383  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4674  hypothetical protein  46.06 
 
 
318 aa  142  3e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4760  hypothetical protein  46.06 
 
 
318 aa  142  3e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.247642  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1511  hypothetical protein  43.6 
 
 
317 aa  138  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0885  protein of unknown function DUF35  44.64 
 
 
333 aa  135  2e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13575  hypothetical protein  44.24 
 
 
311 aa  134  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000328171 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8196  hypothetical protein  43.72 
 
 
319 aa  129  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0059  hypothetical protein  43.54 
 
 
173 aa  105  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2138  hypothetical protein  36.67 
 
 
321 aa  95.5  4e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3482  protein of unknown function DUF35  36.59 
 
 
319 aa  89.4  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.893274  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3318  hypothetical protein  40 
 
 
312 aa  80.5  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000206651 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>