More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2775 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2775  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 302 aa  613  9.999999999999999e-175  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.562879  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2670  alpha/beta hydrolase fold  56.79 
 
 		 298 aa  322  4e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00899476  normal  0.0694304 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2878  alpha/beta hydrolase fold  60.47 
 
 		 283 aa  319  3e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4708  alpha/beta hydrolase fold  55.9 
 
 		 299 aa  313  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5093  alpha/beta hydrolase fold  55.9 
 
 		 299 aa  313  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.284245 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4794  alpha/beta hydrolase fold  55.9 
 
 		 299 aa  313  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1464  alpha/beta hydrolase fold  54.83 
 
 		 294 aa  311  1e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5307  alpha/beta hydrolase fold  54.48 
 
 		 295 aa  310  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224347 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13602  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4-dienoate hydrolase bphD  55.14 
 
 		 291 aa  309  4e-83  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.552922 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3844  alpha/beta hydrolase fold protein  55.12 
 
 		 289 aa  301  9e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.185404  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2141  alpha/beta hydrolase fold  52.29 
 
 		 284 aa  249  4e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0323  alpha/beta hydrolase fold  42.46 
 
 		 285 aa  217  2e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.619665  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0333  alpha/beta hydrolase fold  42.46 
 
 		 285 aa  217  2e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.240836 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0312  alpha/beta hydrolase fold  42.11 
 
 		 285 aa  216  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2898  alpha/beta hydrolase fold  41.11 
 
 		 291 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14294 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3522  alpha/beta hydrolase fold protein  39.06 
 
 		 289 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.328717  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4525  alpha/beta hydrolase fold  40.43 
 
 		 290 aa  211  1e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.212373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4183  alpha/beta hydrolase fold  44.4 
 
 		 279 aa  210  3e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.221808 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4501  alpha/beta hydrolase fold protein  38.13 
 
 		 285 aa  199  6e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.569639  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1754  alpha/beta hydrolase fold  40.6 
 
 		 277 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4141  alpha/beta hydrolase fold  38.59 
 
 		 286 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0556153  normal  0.121245 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1186  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4- dienoate hydrolase (BphD)  40.26 
 
 		 286 aa  183  3e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.644621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0935  alpha/beta hydrolase fold  41.34 
 
 		 288 aa  181  9.000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0423109  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15080  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  38.83 
 
 		 288 aa  179  4.999999999999999e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.625795  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4541  alpha/beta hydrolase fold protein  37.2 
 
 		 288 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.707016  normal  0.231702 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00303  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  37.18 
 
 		 293 aa  177  1e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0321266  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0274  Alpha/beta hydrolase fold  39.12 
 
 		 289 aa  178  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.642233  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00307  hypothetical protein  37.18 
 
 		 293 aa  177  1e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0415585  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0373  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  37.18 
 
 		 293 aa  177  1e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.170384  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3276  alpha/beta hydrolase fold  37.18 
 
 		 288 aa  177  1e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.15708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0380  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  37.18 
 
 		 288 aa  177  1e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.615144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0413  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  37.18 
 
 		 293 aa  177  1e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1361  Alpha/beta hydrolase fold  35.31 
 
 		 298 aa  177  2e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00841082  hitchhiker  0.00000857461 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0424  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  38.58 
 
 		 288 aa  177  2e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  38.58 
 
 		 288 aa  177  3e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2956  Alpha/beta hydrolase  40.39 
 
 		 275 aa  176  4e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.419373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0911  Alpha/beta hydrolase fold  34.53 
 
 		 289 aa  174  9.999999999999999e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0219257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1306  alpha/beta hydrolase fold  38.61 
 
 		 276 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258208  normal  0.0573899 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0531  alpha/beta hydrolase fold protein  37.19 
 
 		 273 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0592  alpha/beta hydrolase fold  38.99 
 
 		 288 aa  172  6.999999999999999e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2323  putative 2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase (MhpC)  35.69 
 
 		 289 aa  171  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1981  alpha/beta hydrolase fold  35.02 
 
 		 287 aa  170  3e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.578343 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0221  alpha/beta hydrolase fold  37.67 
 
 		 286 aa  169  5e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1331  Alpha/beta hydrolase fold  34.8 
 
 		 278 aa  167  2e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000258733 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1183  Alpha/beta hydrolase  34.74 
 
 		 279 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330922  normal  0.0773535 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3786  Alpha/beta hydrolase fold  38.31 
 
 		 274 aa  166  4e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00563208  hitchhiker  0.00293132 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2882  alpha/beta hydrolase fold  37.69 
 
 		 276 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.035123 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3515  alpha/beta hydrolase fold protein  37.88 
 
 		 293 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4414  alpha/beta hydrolase fold  34.34 
 
 		 277 aa  159  5e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3545  alpha/beta hydrolase fold protein  37.79 
 
 		 283 aa  158  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.158387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4621  alpha/beta hydrolase fold  37.79 
 
 		 283 aa  158  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4111  alpha/beta hydrolase fold protein  34.04 
 
 		 288 aa  156  5.0000000000000005e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0346007  normal  0.0462514 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3344  alpha/beta hydrolase fold  37.98 
 
 		 289 aa  155  9e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2274  2-hydroxymuconic semialdehyde hydrolase  37.22 
 
 		 291 aa  154  1e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4719  alpha/beta hydrolase fold protein  37.77 
 
 		 282 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3110  alpha/beta hydrolase fold protein  35.93 
 
 		 304 aa  154  2e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.228638  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2456  alpha/beta hydrolase fold  35 
 
 		 278 aa  152  8e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0153839  normal  0.505758 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2786  alpha/beta hydrolase fold  37.31 
 
 		 283 aa  148  9e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.200125 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3250  Alpha/beta hydrolase fold  34.75 
 
 		 273 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000000000180136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1513  Alpha/beta hydrolase fold  37.64 
 
 		 293 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42230  2-hydroxymuconic semialdehyde hydrolase  35.66 
 
 		 271 aa  146  4.0000000000000006e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1463  Alpha/beta hydrolase  35.61 
 
 		 278 aa  145  5e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.234917  normal  0.480235 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3858  alpha/beta hydrolase fold  33.07 
 
 		 283 aa  144  2e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.167759  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3338  alpha/beta hydrolase fold  38.55 
 
 		 271 aa  143  4e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0955603 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5690  Alpha/beta hydrolase fold  38.75 
 
 		 283 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0433  alpha/beta hydrolase fold protein  34.75 
 
 		 282 aa  140  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0369165 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2894  alpha/beta hydrolase fold  35.1 
 
 		 287 aa  139  4.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1827  alpha/beta hydrolase fold  37.15 
 
 		 285 aa  136  4e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1464  alpha/beta hydrolase fold protein  29.43 
 
 		 279 aa  129  6e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3228  alpha/beta hydrolase fold  32.71 
 
 		 281 aa  129  7.000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3055  alpha/beta hydrolase fold  32.21 
 
 		 277 aa  129  9.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0115287 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0208  alpha/beta hydrolase fold  32.18 
 
 		 291 aa  120  3e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2147  alpha/beta hydrolase fold  32.82 
 
 		 278 aa  119  7e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3791  alpha/beta hydrolase fold  32.76 
 
 		 287 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3787  alpha/beta hydrolase fold  32.76 
 
 		 287 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265139  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3860  alpha/beta hydrolase fold  32.76 
 
 		 287 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0033  alpha/beta hydrolase fold  34.62 
 
 		 290 aa  115  6e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0210  alpha/beta hydrolase fold  32.03 
 
 		 279 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2400  alpha/beta hydrolase fold  31.74 
 
 		 288 aa  114  3e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0809  alpha/beta hydrolase fold  31.48 
 
 		 283 aa  113  4.0000000000000004e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4246  alpha/beta hydrolase fold  32.08 
 
 		 288 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.912428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3689  alpha/beta hydrolase fold protein  30.99 
 
 		 302 aa  110  3e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3884  alpha/beta hydrolase fold  31.17 
 
 		 286 aa  110  3e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.330831  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  30 
 
 		 284 aa  108  8.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  30.63 
 
 		 296 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3690  alpha/beta hydrolase fold  31.54 
 
 		 276 aa  103  4e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5837  alpha/beta hydrolase fold  31.56 
 
 		 316 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5440  alpha/beta hydrolase fold  31.56 
 
 		 299 aa  103  5e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.341918 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4748  alpha/beta hydrolase fold  33.85 
 
 		 295 aa  101  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.259792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0627  alpha/beta hydrolase fold  30.8 
 
 		 299 aa  100  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1679  alpha/beta hydrolase fold  30.8 
 
 		 299 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0545  alpha/beta hydrolase fold  30.8 
 
 		 299 aa  100  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5609  alpha/beta hydrolase fold  30.8 
 
 		 299 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.333622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1708  alpha/beta hydrolase fold  30.8 
 
 		 299 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0456043  normal  0.790109 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1652  alpha/beta hydrolase fold  30.8 
 
 		 299 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1023  alpha/beta family hydrolase  30.61 
 
 		 287 aa  99.8  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0538  alpha/beta hydrolase fold  30.8 
 
 		 299 aa  99.4  7e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.282885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0068  alpha/beta hydrolase fold  28.3 
 
 		 297 aa  96.3  5e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2885  alpha/beta hydrolase fold protein  31.03 
 
 		 275 aa  96.3  6e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00297178 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0598  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.3 
 
 		 368 aa  96.3  6e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0447613 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>