More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2765 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



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Organism name
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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  100 
 
 		 210 aa  427  1e-119  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  57.22 
 
 		 204 aa  218  7e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13590  TetR family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 200 aa  215  5e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.332381  normal  0.0844747 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5283  TetR family transcriptional regulator  51.52 
 
 		 208 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261053 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  52.13 
 
 		 215 aa  209  2e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  52.13 
 
 		 205 aa  208  4e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  52.13 
 
 		 205 aa  208  4e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3991  regulatory protein TetR  55.67 
 
 		 197 aa  208  5e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1483  TetR family transcriptional regulator  51.61 
 
 		 197 aa  207  7e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1369  transcriptional regulator, TetR family  57.65 
 
 		 197 aa  202  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.859804 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  46.86 
 
 		 229 aa  195  4.0000000000000005e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2348  transcriptional regulator, TetR family  48.37 
 
 		 222 aa  179  4e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0187157  normal  0.0306872 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3352  transcriptional regulator, TetR family  47.78 
 
 		 183 aa  174  7e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0512596  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2800  TetR family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 224 aa  164  9e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.697977  decreased coverage  0.000162176 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2601  regulatory protein, TetR  41.71 
 
 		 224 aa  162  4.0000000000000004e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.354794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2358  transcriptional regulator, TetR family  37.71 
 
 		 216 aa  135  6.0000000000000005e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 206 aa  134  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  29.79 
 
 		 188 aa  97.4  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 208 aa  95.1  6e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3944  TetR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 215 aa  87  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  28.72 
 
 		 224 aa  87  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 219 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 201 aa  83.2  0.000000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2688  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 207 aa  81.3  0.000000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.357002  normal  0.760245 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 196 aa  80.9  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4378  transcriptional regulator, TetR family  29.08 
 
 		 200 aa  80.1  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2269  putative transcriptional regulator  31.05 
 
 		 207 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.629172  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26760  putative transcriptional regulator  30.53 
 
 		 198 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  28.34 
 
 		 202 aa  78.6  0.00000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4464  TetR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 204 aa  78.2  0.00000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0680244 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0595  TetR family transcriptional regulator  29 
 
 		 204 aa  77  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 310 aa  76.3  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0043  regulatory protein, TetR  32.46 
 
 		 211 aa  75.5  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2997  transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 		 213 aa  75.1  0.0000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2587  TetR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 434 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.308714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2233  transcriptional regulator, TetR family  29.95 
 
 		 246 aa  74.7  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0329344  normal  0.539811 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0433  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 204 aa  74.7  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2922  transcriptional regulator, TetR family  25.98 
 
 		 204 aa  73.2  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.404278 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10159  TetR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 214 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2548  TetR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 482 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.470429  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  26.34 
 
 		 207 aa  73.9  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2593  TetR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 482 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5475  putative transcriptional regulator, TetR family  29.7 
 
 		 232 aa  73.2  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0120226 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0809  regulatory protein, TetR  30.37 
 
 		 200 aa  73.2  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 211 aa  72.4  0.000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1804  transcriptional regulator, TetR family  26.82 
 
 		 189 aa  72.8  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_013159  Svir_17960  transcriptional regulator, TetR family  31.11 
 
 		 208 aa  72  0.000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.134645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 217 aa  72  0.000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6181  transcriptional regulator, TetR family  29.59 
 
 		 202 aa  71.6  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2499  transcriptional regulator, TetR family  27.51 
 
 		 208 aa  70.1  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2367  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 202 aa  70.5  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.445055  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0108  TetR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 219 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.244027  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0098  TetR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 219 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31231  normal  0.349087 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0117  TetR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 219 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0523426 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2767  TetR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 225 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.284138 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0832  transcriptional regulator, TetR family  31.98 
 
 		 211 aa  68.9  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 		 194 aa  68.6  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4158  TetR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 445 aa  68.2  0.00000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.1717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 213 aa  68.2  0.00000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1858  TetR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 234 aa  67.8  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.543066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 200 aa  67.8  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7312  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 210 aa  67  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  33.01 
 
 		 307 aa  67.4  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5293  TetR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 210 aa  67.4  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.199638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0719  TetR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 209 aa  66.6  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2438  transcriptional regulator, TetR family  23.66 
 
 		 208 aa  66.2  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4824  TetR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 228 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11992  MarR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 406 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2235  transcriptional regulator, TetR family  27.23 
 
 		 235 aa  65.9  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.170733  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  26.98 
 
 		 201 aa  66.2  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4734  TetR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 242 aa  65.9  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1050  transcriptional regulator, TetR family  33.6 
 
 		 225 aa  65.9  0.0000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0452  regulatory protein TetR  28.21 
 
 		 221 aa  65.1  0.0000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  32.38 
 
 		 291 aa  65.1  0.0000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  29.08 
 
 		 287 aa  65.1  0.0000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0126  TetR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 224 aa  65.1  0.0000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 222 aa  65.1  0.0000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3447  regulatory protein TetR  38.1 
 
 		 199 aa  64.7  0.0000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1471  TetR family transcriptional regulator  23.9 
 
 		 219 aa  64.7  0.0000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2551  TetR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 206 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.48532  normal  0.51431 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1844  transcriptional regulator, TetR family  25.13 
 
 		 214 aa  64.3  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1216  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 204 aa  64.3  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0573  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 232 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0810713  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33190  transcriptional regulator  27.07 
 
 		 202 aa  63.5  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.284512  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0773  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 224 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 216 aa  63.5  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0502  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 224 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0685  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 232 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1991  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 232 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2996  TetR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 193 aa  63.9  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.542374  normal  0.411304 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0347  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 200 aa  63.9  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0154637  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1638  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 232 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2087  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 232 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.390005  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2195  transcriptional regulator, TetR family  30.53 
 
 		 189 aa  63.2  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0891  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2801  TetR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_014165  Tbis_2155  TetR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 195 aa  62.8  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008825  Mpe_A0913  TetR family transcriptional regulator  25.39 
 
 		 195 aa  62.4  0.000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.269174  normal  1 
 
 
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NC_012793  GWCH70_3340  transcriptional regulator, TetR family  27.6 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009921  Franean1_3170  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 202 aa  62  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.148676  normal  1 
 
 
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