More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2720 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_2720  hypothetical protein  100 
 
 
451 aa  883    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5679  protein of unknown function DUF21  56.16 
 
 
450 aa  438  9.999999999999999e-123  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.372603  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2999  hypothetical protein  55.19 
 
 
503 aa  435  1e-120  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.280207  normal  0.727721 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1954  hypothetical protein  52.73 
 
 
574 aa  428  1e-119  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0113455  normal  0.562335 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31520  CBS domain-containing protein  51.03 
 
 
455 aa  404  1e-111  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1722  protein of unknown function DUF21  51.33 
 
 
460 aa  403  1e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.564871  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2962  protein of unknown function DUF21  50.48 
 
 
486 aa  382  1e-104  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.387429  hitchhiker  0.00195258 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09590  CBS domain-containing protein  48.22 
 
 
443 aa  375  1e-103  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.328849 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2371  protein of unknown function DUF21  47.26 
 
 
490 aa  372  1e-102  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.304604 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5344  protein of unknown function DUF21  52.08 
 
 
444 aa  360  3e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.308769  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1234  protein of unknown function DUF21  50.89 
 
 
453 aa  353  5e-96  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.981961  normal  0.106715 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22510  CBS domain-containing protein  51.27 
 
 
438 aa  352  8e-96  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0516538  normal  0.801852 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3364  hypothetical protein  47.73 
 
 
457 aa  352  1e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3094  hypothetical protein  48.47 
 
 
451 aa  347  2e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.292492  normal  0.43311 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2378  protein of unknown function DUF21  46.7 
 
 
443 aa  344  2e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000393714 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3662  hypothetical protein  46.01 
 
 
453 aa  343  5e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2764  protein of unknown function DUF21  46.24 
 
 
461 aa  340  2.9999999999999998e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.357691  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2484  protein of unknown function DUF21  44.9 
 
 
442 aa  338  9.999999999999999e-92  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2814  hypothetical protein  47.72 
 
 
471 aa  337  2.9999999999999997e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2858  hypothetical protein  47.72 
 
 
471 aa  337  2.9999999999999997e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.860129  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2841  hypothetical protein  47.72 
 
 
470 aa  337  2.9999999999999997e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.245306  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2317  protein of unknown function DUF21  46.06 
 
 
450 aa  335  7.999999999999999e-91  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1222  protein of unknown function DUF21  46.12 
 
 
439 aa  334  2e-90  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.250523  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0063  protein of unknown function DUF21  47.06 
 
 
452 aa  333  3e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2643  hypothetical protein  44.54 
 
 
445 aa  329  5.0000000000000004e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0914  hypothetical protein  48.98 
 
 
474 aa  329  8e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.447806  normal  0.0678288 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11870  hypothetical protein  46.88 
 
 
455 aa  326  5e-88  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0136182  normal  0.440152 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0508  protein of unknown function DUF21  47.33 
 
 
451 aa  321  9.999999999999999e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6404  hypothetical protein  46.78 
 
 
452 aa  321  9.999999999999999e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07750  CBS domain-containing protein  46.1 
 
 
438 aa  314  1.9999999999999998e-84  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1409  hypothetical protein  42.89 
 
 
452 aa  292  8e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.464754 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0047  hypothetical protein  40.43 
 
 
520 aa  287  2.9999999999999996e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1368  hypothetical protein  41.45 
 
 
452 aa  282  1e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000999119 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24020  CBS domain-containing protein  42.49 
 
 
451 aa  280  3e-74  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.94366 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6909  hypothetical protein  41.3 
 
 
451 aa  279  7e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.97846  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4665  protein of unknown function DUF21  40 
 
 
441 aa  268  1e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1685  CBS  40.81 
 
 
462 aa  265  2e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0119  protein of unknown function DUF21  41.05 
 
 
486 aa  249  8e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.458192  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3544  protein of unknown function DUF21  33.86 
 
 
446 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5779  protein of unknown function DUF21  41.32 
 
 
468 aa  244  1.9999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1941  protein of unknown function DUF21  39.57 
 
 
460 aa  237  3e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.164047  normal  0.0989418 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2949  protein of unknown function DUF21  38.79 
 
 
469 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1763  hypothetical protein  35.03 
 
 
446 aa  232  1e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0445  protein of unknown function DUF21  38.93 
 
 
451 aa  230  4e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0534885  normal  0.0812429 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05880  CBS domain-containing protein  39.14 
 
 
478 aa  229  9e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.927545 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0318  protein of unknown function DUF21  37.04 
 
 
496 aa  228  1e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  unclonable  0.00000000206585  hitchhiker  0.00828276 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3490  hypothetical protein  36.7 
 
 
458 aa  227  3e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3477  hypothetical protein  37.1 
 
 
458 aa  226  9e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3540  hypothetical protein  37.1 
 
 
458 aa  226  9e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.228644  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1705  pyruvate-ferredoxin oxidoreductase  29.48 
 
 
446 aa  224  3e-57  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0644  magnesium and cobalt efflux protein CorC  29.93 
 
 
442 aa  223  7e-57  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2179  protein of unknown function DUF21  34.9 
 
 
431 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1285  hypothetical protein  35.06 
 
 
446 aa  220  3e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0324547  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1588  protein of unknown function DUF21  36.21 
 
 
443 aa  219  5e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1072  hypothetical protein  35.46 
 
 
442 aa  219  8.999999999999998e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.638225  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3860  hypothetical protein  35.9 
 
 
453 aa  216  5e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.188072  normal  0.0935065 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0412  protein of unknown function DUF21  37.47 
 
 
459 aa  216  7e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.29322  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4066  protein of unknown function DUF21  32.75 
 
 
438 aa  209  7e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.659836  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2793  protein of unknown function DUF21  36.5 
 
 
464 aa  209  9e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2683  CBS domain-containing protein  36.72 
 
 
455 aa  209  1e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.522065  normal  0.368276 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0455  conserved hypothetical protein, putative efflux protein (DUF21 domain protein)  30.21 
 
 
456 aa  206  5e-52  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.844865  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3861  protein of unknown function DUF21  38.46 
 
 
460 aa  205  1e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00340007  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3115  hypothetical protein  34.84 
 
 
456 aa  204  2e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3277  protein of unknown function DUF21  33.33 
 
 
437 aa  205  2e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000233033  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2296  protein of unknown function DUF21  34.75 
 
 
433 aa  203  4e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.23749  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0176  transporter, putative  30.28 
 
 
428 aa  202  9.999999999999999e-51  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0760  protein of unknown function DUF21  32.92 
 
 
437 aa  202  9.999999999999999e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.332278 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2767  hypothetical protein  34.38 
 
 
434 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4622  protein of unknown function DUF21  32.22 
 
 
430 aa  201  3e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2966  protein of unknown function DUF21  32.95 
 
 
439 aa  197  2.0000000000000003e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0214  transporter, putative  30.14 
 
 
428 aa  196  7e-49  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1383  transport protein  30.54 
 
 
434 aa  194  2e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.283032  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0191  putative transporter  29.68 
 
 
428 aa  194  2e-48  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0151  magnesium and cobalt efflux protein CorC  28.94 
 
 
433 aa  194  3e-48  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0022  magnesium and cobalt efflux protein CorC  30.37 
 
 
442 aa  191  2e-47  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0015  protein of unknown function DUF21  34.75 
 
 
450 aa  191  2e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.309554  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0921  protein of unknown function DUF21  34.1 
 
 
443 aa  187  3e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2595  hypothetical protein  33.41 
 
 
476 aa  187  3e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1126  protein of unknown function DUF21  29.05 
 
 
428 aa  187  3e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.93664  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4426  hypothetical protein  32.35 
 
 
440 aa  184  3e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.598992 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0521  protein of unknown function DUF21  30.72 
 
 
448 aa  182  8.000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1580  hypothetical protein  31.4 
 
 
445 aa  182  1e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0951178  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1085  hypothetical protein  33.33 
 
 
464 aa  180  4e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.792914 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1889  protein of unknown function DUF21  32.65 
 
 
464 aa  180  4.999999999999999e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.483019  normal  0.437772 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0252  protein of unknown function DUF21  27.99 
 
 
434 aa  179  8e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000514588  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3532  hypothetical protein  30.84 
 
 
455 aa  179  8e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0361  CBS domain-containing protein  29.23 
 
 
449 aa  178  1e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2397  CBS domain protein  31.43 
 
 
443 aa  179  1e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2134  CBS domain-containing protein  30.85 
 
 
451 aa  177  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2072  magnesium and cobalt efflux protein  30.85 
 
 
451 aa  177  2e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0473612  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2270  CBS domain protein  31.43 
 
 
443 aa  178  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2388  protein of unknown function DUF21  31.64 
 
 
442 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.945135 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2288  CBS domain-containing protein  30.85 
 
 
451 aa  177  2e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.779019  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5780  protein of unknown function DUF21  37.12 
 
 
353 aa  177  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3055  CBS domain protein  31.17 
 
 
443 aa  178  2e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2068  magnesium and cobalt efflux protein  30.77 
 
 
451 aa  177  3e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2723  protein of unknown function DUF21  31.21 
 
 
443 aa  177  4e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2313  CBS domain protein  31.17 
 
 
443 aa  177  4e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0742  hypothetical protein  29.26 
 
 
449 aa  177  4e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0726  hypothetical protein  29.26 
 
 
449 aa  177  4e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>