173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2607 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2607  galactokinase  100 
 
 		 399 aa  770    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00377614  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2960  galactokinase  51.32 
 
 		 407 aa  322  5e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0133618  decreased coverage  0.000169773 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2211  galactokinase  50 
 
 		 414 aa  308  1.0000000000000001e-82  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.173587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0758  galactokinase  48.54 
 
 		 429 aa  299  7e-80  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.558541  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0973  galactokinase  44.7 
 
 		 416 aa  296  4e-79  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3973  galactokinase  50.52 
 
 		 408 aa  295  7e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.103412  normal  0.340727 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1464  galactokinase  47.46 
 
 		 394 aa  294  2e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.10348  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2490  galactokinase  54.7 
 
 		 409 aa  292  8e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32880  galactokinase  50.51 
 
 		 409 aa  290  2e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.226542  normal  0.212245 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1768  galactokinase  45.53 
 
 		 385 aa  287  2e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.862041  normal  0.168773 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14320  galactokinase  49.35 
 
 		 389 aa  285  7e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1233  galactokinase  49.87 
 
 		 395 aa  285  7e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000254056 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2387  galactokinase  46.21 
 
 		 372 aa  281  2e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1161  galactokinase  47.27 
 
 		 401 aa  276  6e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.415843  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24040  galactokinase  47.79 
 
 		 420 aa  272  8.000000000000001e-72  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4206  galactokinase  50.26 
 
 		 376 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4056  galactokinase  49.23 
 
 		 403 aa  265  8e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.37616  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1191  galactokinase  49.21 
 
 		 373 aa  263  4.999999999999999e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4902  galactokinase  47.26 
 
 		 379 aa  256  4e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.227753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1677  galactokinase  45.77 
 
 		 400 aa  249  8e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000114591 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0892  galactokinase  40.55 
 
 		 391 aa  243  6e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0958973 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7279  galactokinase  43.93 
 
 		 418 aa  239  5.999999999999999e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1701  galactokinase  39.73 
 
 		 398 aa  226  4e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.33248 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3249  galactokinase  41.58 
 
 		 387 aa  226  6e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0969  galactokinase  40.98 
 
 		 392 aa  224  3e-57  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.003784  normal  0.261209 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1097  galactokinase  39.45 
 
 		 385 aa  223  4.9999999999999996e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0010459  normal  0.419761 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1087  galactokinase  33.25 
 
 		 387 aa  223  6e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00232  galactokinase  38.48 
 
 		 379 aa  221  1.9999999999999999e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.234167  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2888  galactokinase  41.03 
 
 		 383 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0997  galactokinase  44.76 
 
 		 362 aa  220  3e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00864415  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2397  galactokinase  40.77 
 
 		 349 aa  221  3e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.667862 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1195  galactokinase  33.87 
 
 		 380 aa  220  3e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3271  galactokinase  39.68 
 
 		 388 aa  219  7e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.6391  hitchhiker  0.00131566 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2085  galactokinase  37.3 
 
 		 385 aa  218  1e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.351225  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0780  galactokinase  37.11 
 
 		 382 aa  216  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2885  galactokinase  37.11 
 
 		 382 aa  216  7e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0860  galactokinase  37.11 
 
 		 382 aa  216  7e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.048492  normal  0.889348 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0784  galactokinase  37.11 
 
 		 382 aa  216  7e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2905  galactokinase  37.11 
 
 		 382 aa  216  7e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2815  galactokinase  39.5 
 
 		 359 aa  215  9.999999999999999e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.113081 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002662  galactokinase  37.97 
 
 		 386 aa  215  9.999999999999999e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03327  galactokinase  37.7 
 
 		 386 aa  214  1.9999999999999998e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0678  galactokinase  36.6 
 
 		 382 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0810  galactokinase  36.44 
 
 		 382 aa  214  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20660  galactokinase  35.73 
 
 		 404 aa  214  2.9999999999999995e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0811  galactokinase  36.84 
 
 		 382 aa  214  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0924  galactokinase  37.37 
 
 		 382 aa  213  4.9999999999999996e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0740905 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1248  galactokinase  37.14 
 
 		 382 aa  213  4.9999999999999996e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4020  galactokinase  38.7 
 
 		 388 aa  213  5.999999999999999e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000198069 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0869  galactokinase  36.17 
 
 		 382 aa  213  7e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0901  galactokinase  36.17 
 
 		 382 aa  212  9e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0838  galactokinase  36.17 
 
 		 382 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3026  galactokinase  36.8 
 
 		 389 aa  210  4e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0647  galactokinase  37.33 
 
 		 389 aa  209  6e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00202468  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2017  galactokinase  37.17 
 
 		 387 aa  209  7e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.126452  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1197  galactokinase  36.9 
 
 		 405 aa  209  8e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.765458  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0652  galactokinase  38.07 
 
 		 388 aa  209  8e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.430663  hitchhiker  0.00000383534 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0939  galactokinase  33.33 
 
 		 389 aa  207  2e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10631  galactokinase  44.16 
 
 		 363 aa  207  4e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00193784  normal  0.94952 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0415  galactokinase  33.52 
 
 		 355 aa  206  5e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2287  galactokinase  39.13 
 
 		 393 aa  206  6e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2819  galactokinase  35.39 
 
 		 395 aa  206  8e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1291  galactokinase  40.55 
 
 		 383 aa  204  2e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.68588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0554  galactokinase  38.22 
 
 		 403 aa  204  3e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2692  galactokinase  38.28 
 
 		 392 aa  202  6e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.44477  normal  0.174085 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0830  galactokinase  35.85 
 
 		 386 aa  202  6e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0480015  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0578  galactokinase  33.06 
 
 		 388 aa  200  3.9999999999999996e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3819  galactokinase  38.4 
 
 		 391 aa  200  3.9999999999999996e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.388206  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2857  galactokinase  38.78 
 
 		 383 aa  199  6e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1411  galactokinase  38.78 
 
 		 383 aa  199  6e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2945  galactokinase  38.78 
 
 		 383 aa  199  6e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1934  galactokinase  41.21 
 
 		 349 aa  198  1.0000000000000001e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.210895 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3336  galactokinase  36.39 
 
 		 409 aa  196  8.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.325513  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0998  galactokinase  37.16 
 
 		 391 aa  195  1e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0577  galactokinase  36.87 
 
 		 384 aa  194  2e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1073  galactokinase  36.41 
 
 		 385 aa  192  8e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.848986  normal  0.026776 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1171  galactokinase  38.29 
 
 		 383 aa  190  2.9999999999999997e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0609  galactokinase  34.03 
 
 		 387 aa  190  2.9999999999999997e-47  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0700517  normal  0.0223386 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1466  galactokinase  34.03 
 
 		 388 aa  189  9e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1552  galactokinase  32.35 
 
 		 387 aa  187  3e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1345  galactokinase  32.35 
 
 		 387 aa  187  3e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.659508  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1632  galactokinase  35.19 
 
 		 394 aa  186  7e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0355  galactokinase  34.13 
 
 		 389 aa  184  3e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0320  galactokinase  32.7 
 
 		 386 aa  184  3e-45  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2325  galactokinase  35.25 
 
 		 405 aa  184  3e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1516  galactokinase  32.57 
 
 		 385 aa  183  5.0000000000000004e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3238  galactokinase  30.15 
 
 		 397 aa  183  6e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.217049  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1938  galactokinase  35.69 
 
 		 369 aa  183  6e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.491701  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1313  galactokinase  34.66 
 
 		 390 aa  182  7e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.20548  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2085  galactokinase  34.43 
 
 		 394 aa  182  8.000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.11245  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1326  galactokinase  37.27 
 
 		 387 aa  182  1e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0502  galactokinase  41.19 
 
 		 384 aa  181  2e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.592539  normal  0.852074 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4110  galactokinase  39.59 
 
 		 356 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1777  galactokinase  31.11 
 
 		 392 aa  180  4e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3662  galactokinase  34.85 
 
 		 412 aa  179  7e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0296405  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2952  galactokinase  37.11 
 
 		 387 aa  178  1e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0634  galactokinase  34.55 
 
 		 381 aa  179  1e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0657  galactokinase  34.55 
 
 		 381 aa  178  2e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0536  galactokinase  35.5 
 
 		 382 aa  178  2e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0132306 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3728  galactokinase  34.55 
 
 		 381 aa  178  2e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>