220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2555 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2555  NifU family SUF system FeS assembly protein  100 
 
 		 150 aa  308  1e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.693713  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2229  SUF system FeS assembly protein, NifU family  62.5 
 
 		 151 aa  197  5e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000771916  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2447  SUF system FeS assembly protein, NifU family  64.29 
 
 		 156 aa  196  1.0000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0284902 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16170  SUF system FeS assembly protein, NifU family  62.86 
 
 		 150 aa  193  6e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5149  SUF system FeS assembly protein, NifU family  60.28 
 
 		 147 aa  192  9e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.726273  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1665  SUF system FeS assembly protein  61.81 
 
 		 172 aa  190  6e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.754519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2268  SUF system FeS assembly protein, NifU family  60.14 
 
 		 163 aa  188  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.794805 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1982  SUF system FeS assembly protein  60.81 
 
 		 160 aa  185  2e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.323974  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2090  NifU family SUF system FeS assembly protein  61.43 
 
 		 151 aa  184  5e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2505  SUF system FeS assembly protein, NifU family  57.45 
 
 		 151 aa  181  3e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2440  SUF system FeS assembly protein  58.9 
 
 		 153 aa  181  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.155172  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2485  NifU family SUF system FeS assembly protein  58.9 
 
 		 153 aa  181  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.200135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2476  NifU family SUF system FeS assembly protein  58.5 
 
 		 153 aa  181  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.435362  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1967  SUF system FeS assembly protein  57.75 
 
 		 145 aa  180  5.0000000000000004e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.245372 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2958  SUF system FeS assembly protein, NifU family  56.41 
 
 		 158 aa  180  7e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1139  NifU family SUF system FeS assembly protein  56.38 
 
 		 157 aa  176  7e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.039211 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5982  nitrogen fixation protein  57.14 
 
 		 145 aa  176  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.8626  normal  0.134039 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3673  NifU family SUF system FeS assembly protein  58.04 
 
 		 155 aa  175  1e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.905267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11493  nitrogen fixation-like protein  57.43 
 
 		 162 aa  175  2e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000220118  normal  0.138949 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2737  NifU family SUF system FeS assembly protein  58.04 
 
 		 153 aa  174  3e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.556546 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16670  SUF system FeS assembly protein, NifU family  54.73 
 
 		 152 aa  174  4e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0471636  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2069  SUF system FeS assembly protein, NifU family  60.87 
 
 		 155 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.420514  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2387  SUF system FeS assembly protein, NifU family  57.45 
 
 		 154 aa  169  1e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.212849  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2280  SUF system FeS assembly protein, NifU family  55.94 
 
 		 167 aa  168  2e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000288131  hitchhiker  0.00804986 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3078  NifU family SUF system FeS assembly protein  56.38 
 
 		 158 aa  166  1e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.167444  normal  0.201859 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3305  NifU family SUF system FeS assembly protein  55.86 
 
 		 158 aa  164  2.9999999999999998e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000286575 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3483  SUF system FeS assembly protein, NifU family  55.47 
 
 		 146 aa  160  6e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.250714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13390  SUF system FeS assembly protein, NifU family  50.69 
 
 		 163 aa  152  1e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00685407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1294  SUF system FeS assembly protein, NifU family  52.05 
 
 		 149 aa  143  9e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000198269 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1362  SUF system FeS assembly protein, NifU family  50.34 
 
 		 155 aa  138  3e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.576777  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1236  NifU family SUF system FeS assembly protein  46.41 
 
 		 161 aa  135  2e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21900  SUF system FeS assembly protein, NifU family  49.34 
 
 		 178 aa  133  9.999999999999999e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1145  SUF system FeS assembly protein, NifU family  45.45 
 
 		 178 aa  128  3e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0603  NifU family SUF system FeS assembly protein  45.1 
 
 		 151 aa  118  1.9999999999999998e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.281207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3280  SUF system FeS assembly protein, NifU family  41.73 
 
 		 149 aa  117  6e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.182981  normal  0.0362221 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1676  SUF system FeS assembly protein, NifU family  40.94 
 
 		 171 aa  116  9.999999999999999e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.610224  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0144  NifU family protein  41.73 
 
 		 147 aa  115  1.9999999999999998e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.966065  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0221  NifU family protein  42.55 
 
 		 144 aa  115  3e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1636  SUF system FeS assembly protein, NifU family  37.4 
 
 		 139 aa  114  3.9999999999999997e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2335  SUF system FeS assembly protein, NifU family  40.54 
 
 		 191 aa  113  6.9999999999999995e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.610109  normal  0.712132 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0907  NifU family SUF system FeS assembly protein  40.82 
 
 		 149 aa  110  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.895466 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0847  SUF system FeS assembly protein  38.3 
 
 		 149 aa  107  5e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.190633  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0897  SUF system FeS assembly protein, NifU family  38.3 
 
 		 149 aa  107  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.341493  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0893  SUF system FeS assembly protein, NifU family  38.3 
 
 		 149 aa  107  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0894  NifU family SUF system FeS assembly protein  41.67 
 
 		 153 aa  106  8.000000000000001e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0702679  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0656  hypothetical protein  38.26 
 
 		 149 aa  103  9e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2313  SUF system FeS assembly protein  39.31 
 
 		 147 aa  101  3e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.960672 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0568  SUF system FeS assembly protein, NifU family  41.78 
 
 		 153 aa  101  3e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.654939  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0640  hypothetical protein  37.58 
 
 		 149 aa  100  5e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0387  SUF system FeS assembly protein, NifU family  42.52 
 
 		 233 aa  100  6e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.820137 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0602  hypothetical protein  35.29 
 
 		 184 aa  99.4  1e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.547374  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0165  SUF system FeS assembly protein  40.3 
 
 		 140 aa  99  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0989  SUF system FeS assembly protein, NifU family  39.71 
 
 		 151 aa  98.6  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.784389  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1970  NifU-like protein for Fe-S cluster formation  36.67 
 
 		 152 aa  99  2e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0290  NifU family SUF system FeS assembly protein  37.59 
 
 		 137 aa  98.2  3e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1895  SUF system FeS assembly protein, NifU family  35.06 
 
 		 154 aa  97.4  5e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2328  NifU family SUF system FeS assembly protein  37.59 
 
 		 137 aa  97.1  7e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0846  NifU family SUF system FeS assembly protein  36.03 
 
 		 154 aa  97.1  7e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.539052  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0862  NifU family SUF system FeS assembly protein  36.03 
 
 		 154 aa  97.1  7e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.16993  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0269  SUF system FeS assembly protein, NifU family  36.99 
 
 		 148 aa  97.1  8e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1002  SUF system FeS assembly protein, NifU family  37.59 
 
 		 141 aa  96.7  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0651104  normal  0.492699 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0652  NifU family SUF system FeS assembly protein  38.41 
 
 		 145 aa  95.5  2e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2268  NifU family SUF system FeS assembly protein  35.14 
 
 		 151 aa  94.4  5e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.193991  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2486  SUF system FeS assembly protein  37.93 
 
 		 150 aa  94  6e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1864  SUF system FeS assembly protein  34.75 
 
 		 162 aa  93.6  8e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.861958  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2920  SUF system FeS assembly protein, NifU family  39.86 
 
 		 145 aa  92.8  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1787  SUF system FeS assembly protein  36.43 
 
 		 160 aa  92.8  1e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0971844  normal  0.163448 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4273  SUF system FeS assembly protein  36.23 
 
 		 149 aa  92.8  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1504  SUF system FeS assembly protein, NifU family protein  34.03 
 
 		 153 aa  90.9  6e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.175472 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4473  SUF system FeS assembly protein, NifU family  35.25 
 
 		 165 aa  90.1  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2850  NifU family SUF system FeS assembly protein  34.06 
 
 		 159 aa  89.4  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3071  SUF system FeS assembly protein, NifU family  40.58 
 
 		 149 aa  89.4  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2339  SUF system FeS assembly protein, NifU family  34.06 
 
 		 159 aa  89.4  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000980785  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2053  NifU domain-containing protein  37.78 
 
 		 144 aa  87.8  4e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.415003  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2274  SUF system FeS assembly protein, NifU family  36.79 
 
 		 144 aa  87.8  4e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2035  Fe-S cluster formation protein, NifU-like  34.27 
 
 		 144 aa  87.4  6e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1110  Fe-S cluster formation protein, NifU-like  34.72 
 
 		 146 aa  87  8e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2827  NifU family SUF system FeS assembly protein  37.68 
 
 		 163 aa  86.7  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0609  NifU-like domain-containing protein  37.68 
 
 		 163 aa  86.3  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2403  NifU-like domain-containing protein  37.68 
 
 		 163 aa  86.3  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2886  NifU-like domain-containing protein  37.68 
 
 		 163 aa  86.3  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2707  NifU family SUF system FeS assembly protein  37.68 
 
 		 163 aa  86.3  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1716  NifU-like domain-containing protein  37.68 
 
 		 163 aa  86.3  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0759049  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2764  NifU family SUF system FeS assembly protein  37.68 
 
 		 163 aa  85.5  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.541275  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26820  SUF system FeS assembly protein, NifU family  31.88 
 
 		 145 aa  85.9  2e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1793  NifU-like domain-containing protein  35.04 
 
 		 163 aa  84.3  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.310093  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0207  SUF system FeS assembly protein  36.11 
 
 		 140 aa  84  7e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0118  iron-sulfur cluster assembly scaffold SufA  38.57 
 
 		 143 aa  84  7e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5117  NifU domain-containing protein  38.57 
 
 		 143 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4848  NifU domain-containing protein  38.57 
 
 		 143 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4689  NifU family protein  38.57 
 
 		 143 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4704  NifU family protein  38.57 
 
 		 143 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5214  NifU domain-containing protein  38.57 
 
 		 143 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4802  NifU family SUF system FeS assembly protein  38.57 
 
 		 143 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5085  iron-sulfur cluster assembly scaffold SufA  38.57 
 
 		 143 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5120  iron-sulfur cluster assembly scaffold SufA  38.57 
 
 		 143 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5122  iron-sulfur cluster assembly scaffold SufA  38.57 
 
 		 143 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0356779  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3313  SUF system FeS assembly protein, NifU family  35.81 
 
 		 141 aa  82.4  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3576  NifU family SUF system FeS assembly protein  38.57 
 
 		 143 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1444  IscU  33.33 
 
 		 158 aa  79  0.00000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>