118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2549 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2549  transcriptional regulator  100 
 
 		 240 aa  480  1e-135  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.12553  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2262  putative transcriptional regulator  60.95 
 
 		 253 aa  241  5e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.148405 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1134  putative transcriptional regulator  56.73 
 
 		 273 aa  212  4.9999999999999996e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.767556  normal  0.0484804 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2223  putative transcriptional regulator  55.51 
 
 		 280 aa  208  5e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000435551  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2275  putative transcriptional regulator  54.59 
 
 		 237 aa  207  1e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00171437  normal  0.131971 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1973  putative transcriptional regulator  54.38 
 
 		 254 aa  206  2e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.490943 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2063  putative transcriptional regulator  55.29 
 
 		 280 aa  205  6e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5988  putative transcriptional regulator  54.59 
 
 		 270 aa  204  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.423891  normal  0.331781 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2964  putative transcriptional regulator  55.24 
 
 		 258 aa  203  2e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3084  regulatory protein, ArsR  52.81 
 
 		 248 aa  197  1.0000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00550431  normal  0.268013 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3311  putative transcriptional regulator  52.59 
 
 		 251 aa  197  1.0000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000054847 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2441  putative transcriptional regulator  51.79 
 
 		 244 aa  193  2e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.47008  normal  0.125946 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1988  transcriptional regulator  55.07 
 
 		 265 aa  191  7e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.625652  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5155  putative transcriptional regulator  56.67 
 
 		 238 aa  186  4e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2382  regulatory protein ArsR  47.44 
 
 		 274 aa  182  3e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.307498  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16120  transcriptional regulator  51.15 
 
 		 269 aa  182  5.0000000000000004e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.778634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2732  putative transcriptional regulator  49.3 
 
 		 220 aa  180  2e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0409175 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3678  putative transcriptional regulator  48.15 
 
 		 245 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.12072  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2510  putative transcriptional regulator  49.1 
 
 		 236 aa  173  1.9999999999999998e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2471  transcriptional regulator  50.23 
 
 		 238 aa  172  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2435  transcriptional regulator  49.77 
 
 		 238 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.412292  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2480  transcriptional regulator  49.77 
 
 		 238 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.337028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13330  predicted transcriptional regulator  44.64 
 
 		 238 aa  170  1e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.763143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1659  putative transcriptional regulator  50.7 
 
 		 308 aa  168  7e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.773243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21960  predicted transcriptional regulator  45.12 
 
 		 275 aa  166  2e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.153457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1139  putative transcriptional regulator  43.1 
 
 		 252 aa  165  6.9999999999999995e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.140272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11488  transcriptional regulator  48.4 
 
 		 268 aa  162  3e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0037779  normal  0.99088 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2084  putative transcriptional regulator  49.52 
 
 		 291 aa  159  4e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.877049 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1356  putative transcriptional regulator  45.78 
 
 		 248 aa  159  5e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2341  putative transcriptional regulator  45.71 
 
 		 270 aa  154  1e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.265482 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2918  putative transcriptional regulator  46.48 
 
 		 265 aa  147  1.0000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2102  transcriptional regulator  39 
 
 		 289 aa  145  7.0000000000000006e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.697253  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1844  putative transcriptional regulator  39.11 
 
 		 271 aa  143  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000755788 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14610  predicted transcriptional regulator  42.31 
 
 		 245 aa  140  1.9999999999999998e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.330701  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1670  putative transcriptional regulator  46.15 
 
 		 270 aa  124  1e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0587994  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11480  predicted transcriptional regulator  37.44 
 
 		 209 aa  103  2e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.902569  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4686  DeoR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 210 aa  100  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000645179  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5102  transcriptional regulator, DeoR family  28.91 
 
 		 210 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.211932  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1570  putative transcriptional regulator  35.44 
 
 		 219 aa  100  3e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.417601  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4828  DeoR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 210 aa  99.4  5e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00756639  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4669  DeoR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 210 aa  99.4  5e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5193  DeoR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 210 aa  99.4  5e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.076054  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5064  transcriptional regulator, DeoR family  28.44 
 
 		 210 aa  99.4  5e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5097  DeoR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 210 aa  99  7e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3558  putative transcriptional regulator  28.64 
 
 		 210 aa  97.4  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5103  transcriptional regulator, DeoR family  27.96 
 
 		 210 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.411801  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4781  putative transcriptional regulator  27.49 
 
 		 210 aa  94.7  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2060  MarR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 235 aa  93.6  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000000547125  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0136  transcriptional regulator, DeoR family  27.01 
 
 		 210 aa  93.2  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.790585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3726  putative transcriptional regulator  33.66 
 
 		 212 aa  92  8e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.110577  hitchhiker  0.00164762 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3238  putative transcriptional regulator  33.17 
 
 		 211 aa  89.7  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.990793 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0425  putative transcriptional regulator  29.3 
 
 		 219 aa  89.4  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.973468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0414  putative transcriptional regulator  29.3 
 
 		 219 aa  89  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3451  putative transcriptional regulator  28.97 
 
 		 217 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.225926  hitchhiker  0.00000000543336 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2493  putative transcriptional regulator  29.56 
 
 		 211 aa  85.1  9e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0117208  normal  0.769487 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4801  putative transcriptional regulator  30.21 
 
 		 207 aa  84.7  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000472031 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4354  transcriptional regulator  29.95 
 
 		 228 aa  84.3  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.898255 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3070  transcriptional regulator, TrmB  29.72 
 
 		 215 aa  82.4  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.272047 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0028  transcriptional regulator  33.98 
 
 		 217 aa  80.1  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.572077  normal  0.204969 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001755  predicted transcriptional regulator  25.96 
 
 		 206 aa  80.1  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0263515  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2239  hypothetical protein  27.8 
 
 		 205 aa  79.7  0.00000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0091  hypothetical protein  26.23 
 
 		 205 aa  77  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0896  putative transcriptional regulator  30.73 
 
 		 207 aa  76.3  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.610602 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4804  putative transcriptional regulator  28.99 
 
 		 210 aa  75.9  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000646734 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1246  putative transcriptional regulator  26.42 
 
 		 203 aa  75.5  0.0000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.628425 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0915  putative transcriptional regulator  31.22 
 
 		 218 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.949391 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2786  putative transcriptional regulator  29.79 
 
 		 208 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.788805 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1048  putative transcriptional regulator  26.37 
 
 		 207 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00716  hypothetical protein  23.9 
 
 		 204 aa  72.8  0.000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0888  putative transcriptional regulator  30.6 
 
 		 211 aa  72  0.000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3278  putative transcriptional regulator  29.05 
 
 		 207 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0971152 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0961  putative transcriptional regulator  31.65 
 
 		 225 aa  71.6  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.189509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03001  regulatory proteins, AsnC family protein  30.73 
 
 		 215 aa  70.5  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.764788 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1011  putative transcriptional regulator  28.44 
 
 		 207 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1113  putative transcriptional regulator  27.75 
 
 		 207 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00818822 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1080  putative transcriptional regulator  28.91 
 
 		 207 aa  68.9  0.00000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0077  transcriptional regulator  27.68 
 
 		 246 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.53122  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1733  transcriptional regulator  30.09 
 
 		 214 aa  68.6  0.00000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.86463 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5538  putative transcriptional regulator  28.02 
 
 		 209 aa  68.6  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.912326  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1018  putative transcriptional regulator  28.96 
 
 		 210 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1043  hypothetical protein  28.71 
 
 		 223 aa  67  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0030  hypothetical protein  28.71 
 
 		 223 aa  67  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0384  hypothetical protein  28.71 
 
 		 223 aa  67  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1579  hypothetical protein  28.71 
 
 		 223 aa  67  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.145631  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1494  hypothetical protein  28.71 
 
 		 223 aa  67  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1200  hypothetical protein  28.71 
 
 		 223 aa  67  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0108281  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0435  putative transcriptional regulator  30.59 
 
 		 199 aa  67.4  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.341746  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1711  putative transcriptional regulator  29.95 
 
 		 210 aa  67  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.42173  normal  0.540015 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0995  hypothetical protein  25.97 
 
 		 206 aa  67  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2175  transcriptional regulator TrmB  30.39 
 
 		 203 aa  67  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.168136  normal  0.574645 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4997  putative transcriptional regulator  27.84 
 
 		 222 aa  67  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0423  transcriptional regulator  26.22 
 
 		 227 aa  66.2  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.956901  normal  0.107177 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2284  transcriptional regulator  29.12 
 
 		 214 aa  65.9  0.0000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.123055 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3584  hypothetical protein  26.92 
 
 		 206 aa  65.1  0.0000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2998  transcriptional regulator  26.37 
 
 		 206 aa  64.7  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00441752  normal  0.169259 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3079  transcriptional regulator  26.37 
 
 		 206 aa  64.7  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0625169  normal  0.749503 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3358  putative transcriptional regulator  27.69 
 
 		 220 aa  65.1  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0338727  normal  0.270871 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3176  transcriptional regulator  26.37 
 
 		 206 aa  63.9  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4136  hypothetical protein  28.78 
 
 		 214 aa  63.9  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3788  hypothetical protein  28.78 
 
 		 222 aa  63.9  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>