More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2545 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_2545  ABC transporter related  100 
 
 
315 aa  628  1e-179  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2251  ABC transporter related  58.36 
 
 
308 aa  330  2e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000349445 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2080  ABC transporter related  55.48 
 
 
388 aa  313  1.9999999999999998e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.669128 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16100  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  55.92 
 
 
308 aa  311  7.999999999999999e-84  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.252835  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2220  ABC transporter related protein  55.19 
 
 
308 aa  311  1e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000054865  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1655  ABC transporter related  56.23 
 
 
374 aa  310  2e-83  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334849  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5162  ABC transporter related  54.81 
 
 
312 aa  310  2e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.91236  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21980  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  54.37 
 
 
304 aa  305  4.0000000000000004e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.110747  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1989  ABC-type multidrug transport system ATPase componen  55.77 
 
 
309 aa  303  2.0000000000000002e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2730  ABC transporter-related protein  54.13 
 
 
309 aa  303  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.110102 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3680  ABC transporter related  53.99 
 
 
319 aa  303  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.764168  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11486  antibiotic ABC transporter ATP-binding protein  54.98 
 
 
313 aa  304  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.576168  normal  0.635651 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2380  ABC transporter related protein  53.62 
 
 
338 aa  296  4e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.719921  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2433  ABC transporter related  53.62 
 
 
310 aa  296  4e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.555917  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2478  ABC transporter related  53.62 
 
 
310 aa  296  4e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2512  ABC transporter related protein  52.24 
 
 
310 aa  295  8e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2469  ABC transporter related  53.29 
 
 
310 aa  294  1e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.182364  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5991  ABC transporter, ATP-binding protein  52.79 
 
 
302 aa  294  2e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171427  normal  0.144114 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2270  ABC transporter related  50.48 
 
 
314 aa  291  7e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0194765  normal  0.0896073 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1668  ABC transporter related protein  54.78 
 
 
329 aa  288  7e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0326508  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2965  ABC transporter related protein  50.31 
 
 
313 aa  280  3e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2919  ABC transporter related  53.92 
 
 
334 aa  275  6e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.748186  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1355  ABC transporter related protein  52.41 
 
 
299 aa  273  4.0000000000000004e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.79712  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1974  ABC transporter-like protein  51.97 
 
 
308 aa  268  1e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.495936 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1138  ABC transporter related  46.01 
 
 
311 aa  256  3e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.129025  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2342  ABC transporter related  47.42 
 
 
319 aa  255  8e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.2832 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0824  ABC transporter related protein  46.75 
 
 
306 aa  247  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2398  ABC transporter related protein  44.69 
 
 
300 aa  241  1e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000133291  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9332  ABC transporter related protein  44.16 
 
 
299 aa  221  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1843  ABC transporter related  43.3 
 
 
322 aa  221  1.9999999999999999e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000163971 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0274  ABC transporter related protein  43.18 
 
 
303 aa  221  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4919  ABC transporter related protein  45.71 
 
 
302 aa  220  1.9999999999999999e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0999062  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14590  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  52.49 
 
 
331 aa  218  1e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.294178  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1549  ABC transporter related  42.67 
 
 
319 aa  218  1e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.819341  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5630  ABC transporter related protein  45.27 
 
 
302 aa  218  2e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.694537  normal  0.578056 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2101  ABC transporter related  43.61 
 
 
322 aa  214  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0278  ABC transporter related  38.03 
 
 
308 aa  213  4.9999999999999996e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.833844  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0720  ABC transporter related  39.29 
 
 
305 aa  212  7.999999999999999e-54  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00029064  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3544  ABC transporter related  42.81 
 
 
302 aa  211  1e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0818201  normal  0.548154 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_700  ABC transporter, ATP-binding protein  38.96 
 
 
305 aa  210  2e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.365383  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0794  ABC transporter, ATP-binding protein  38.96 
 
 
305 aa  208  7e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00734303  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2960  ABC transporter related protein  42.02 
 
 
314 aa  207  2e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00870565  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0172  ABC transporter related  40.4 
 
 
322 aa  204  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5131  ABC transporter related protein  42.76 
 
 
301 aa  204  2e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135595  normal  0.223967 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0482  ABC transporter related  41.37 
 
 
322 aa  203  2e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3622  ABC transporter related  48.66 
 
 
290 aa  203  2e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4004  ABC transporter related  48.66 
 
 
282 aa  203  3e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0853449  hitchhiker  0.000219352 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0191  ABC transporter related  42.62 
 
 
305 aa  203  3e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.668087  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4231  ABC transporter related  37.5 
 
 
304 aa  202  7e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4397  ABC transporter related protein  48.31 
 
 
301 aa  202  9e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.355124  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3802  ABC transporter related  42.02 
 
 
330 aa  201  9.999999999999999e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.550833  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1027  ABC transporter related protein  50.89 
 
 
317 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.87943  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4559  ABC transporter related protein  41.67 
 
 
285 aa  201  1.9999999999999998e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.995467  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0910  ABC transporter-like protein  47.2 
 
 
284 aa  200  3e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11470  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  44.72 
 
 
321 aa  199  3.9999999999999996e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.160218  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0612  ABC transporter related protein  43.09 
 
 
314 aa  199  6e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.787595  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1677  ABC transporter, ATPase subunit  40.24 
 
 
353 aa  197  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.42394 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3320  ABC transporter related protein  40.18 
 
 
331 aa  197  2.0000000000000003e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2680  ABC transporter related protein  49 
 
 
297 aa  196  5.000000000000001e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6376  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.5 
 
 
313 aa  194  1e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0291  ABC-type multidrug transport system ATPase component  39.74 
 
 
324 aa  194  2e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3067  ABC transporter related  44.29 
 
 
254 aa  194  2e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0151  ABC transporter related  36.69 
 
 
283 aa  191  1e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1687  ABC transporter, ATP-binding protein  46.73 
 
 
280 aa  190  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0554  ABC transporter related  38.19 
 
 
305 aa  191  2e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.31573  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0704  ABC transporter related  41.67 
 
 
256 aa  189  4e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.187193  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0540  ABC transporter related  37.86 
 
 
301 aa  189  7e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29910  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  50.99 
 
 
313 aa  187  3e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.880888  normal  0.697642 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3107  ABC transporter related protein  41.64 
 
 
323 aa  185  9e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000248355 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0349  ABC transporter related protein  41.83 
 
 
301 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.172507  normal  0.855348 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1191  ABC transporter related protein  39.74 
 
 
333 aa  185  1.0000000000000001e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0095  ABC transporter related  36.16 
 
 
310 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000602484  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4203  ABC transporter related  39.1 
 
 
741 aa  184  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.746448  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0713  ABC transporter related  35.81 
 
 
295 aa  183  4.0000000000000006e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5477  ABC transporter related protein  40.38 
 
 
330 aa  182  8.000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0609  ABC transporter related protein  40.97 
 
 
301 aa  182  1e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11530  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  46.89 
 
 
310 aa  181  2e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.317764  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3102  ABC transporter related  42.23 
 
 
300 aa  180  2.9999999999999997e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00319499  hitchhiker  0.0000545387 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3531  ABC transporter related protein  46.48 
 
 
319 aa  180  2.9999999999999997e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0919  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.06 
 
 
342 aa  180  2.9999999999999997e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4747  ABC transporter related protein  48.36 
 
 
237 aa  180  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.667529 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0214  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.86 
 
 
312 aa  180  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0510  ABC transporter related  40 
 
 
276 aa  179  4e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5653  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43.33 
 
 
255 aa  179  4e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2585  ABC transporter related  39.67 
 
 
308 aa  179  5.999999999999999e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.345311  normal  0.0961797 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4255  ABC transporter related  36.7 
 
 
312 aa  179  7e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3299  ABC transporter related protein  39.3 
 
 
342 aa  178  1e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0284  ABC transporter, ATPase subunit  39.94 
 
 
310 aa  178  1e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1077  ABC transporter related protein  39.74 
 
 
309 aa  178  1e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0807489  normal  0.0520068 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1352  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.86 
 
 
331 aa  177  2e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.467202  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0376  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.1 
 
 
318 aa  177  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.139774  normal  0.0152344 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2430  ABC transporter related  40.2 
 
 
303 aa  177  2e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0400473  normal  0.675282 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3547  ABC transporter-like protein  40.07 
 
 
290 aa  177  3e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.757976 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2770  ABC transporter related  38.85 
 
 
319 aa  177  3e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.285853  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1776  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.6 
 
 
319 aa  176  4e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.179608 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1173  ABC transporter related  38.73 
 
 
306 aa  176  5e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1585  ABC transporter related  45.54 
 
 
321 aa  176  6e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.719287  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3423  ABC transporter related  39.56 
 
 
310 aa  176  6e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00331391  normal  0.124939 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0672  ABC transporter related  45.12 
 
 
289 aa  176  6e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0422494  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1895  ABC transporter related  38.91 
 
 
343 aa  175  7e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>