108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2535 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2535  hypothetical protein  100 
 
 		 321 aa  634    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1742  hypothetical protein  32.51 
 
 		 303 aa  122  9e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1692  hypothetical protein  34.16 
 
 		 303 aa  107  3e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.360943  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1723  hypothetical protein  31.9 
 
 		 306 aa  96.3  6e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0541732 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1289  hypothetical protein  35.02 
 
 		 294 aa  92  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.17962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13588  hypothetical protein  42.77 
 
 		 289 aa  92  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0436638 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13746  hypothetical protein  31.99 
 
 		 296 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00180958  normal  0.465684 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5044  hypothetical protein  36.71 
 
 		 291 aa  89.4  8e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0096  hypothetical protein  28.62 
 
 		 286 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0105  hypothetical protein  28.62 
 
 		 286 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1630  hypothetical protein  35.5 
 
 		 307 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121478 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04300  hypothetical protein  29.84 
 
 		 319 aa  81.3  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.169884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0138  hypothetical protein  32.59 
 
 		 300 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0147  hypothetical protein  32.59 
 
 		 300 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.857188 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0128  hypothetical protein  32.22 
 
 		 300 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.795605 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4824  hypothetical protein  34.87 
 
 		 295 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12277  hypothetical protein  29.39 
 
 		 295 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000026926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0342  hypothetical protein  28.62 
 
 		 289 aa  77.4  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.844394  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4733  hypothetical protein  32.19 
 
 		 284 aa  77  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.545142  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0497  hypothetical protein  39.75 
 
 		 285 aa  77  0.0000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4353  hypothetical protein  31.76 
 
 		 284 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4629  hypothetical protein  30.04 
 
 		 277 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4439  hypothetical protein  31.76 
 
 		 284 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.100384 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4717  hypothetical protein  30.04 
 
 		 277 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.247054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4812  hypothetical protein  30.89 
 
 		 307 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00673201 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0086  hypothetical protein  28.96 
 
 		 278 aa  73.6  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.329246 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0638  hypothetical protein  33.15 
 
 		 284 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0651  hypothetical protein  33.15 
 
 		 284 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.617524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1730  hypothetical protein  30.04 
 
 		 288 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.432935  normal  0.816575 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0631  hypothetical protein  33.15 
 
 		 284 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0729308 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4654  hypothetical protein  30.92 
 
 		 289 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.397587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4275  hypothetical protein  29.18 
 
 		 289 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0774352  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4361  hypothetical protein  29.18 
 
 		 289 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0126978 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0608  hypothetical protein  29.33 
 
 		 290 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.876444  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0621  hypothetical protein  29.33 
 
 		 290 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.568124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0599  hypothetical protein  29.33 
 
 		 290 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11511  hypothetical protein  30.38 
 
 		 280 aa  70.1  0.00000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.494625 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4733  hypothetical protein  29.82 
 
 		 288 aa  69.3  0.00000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0630614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5011  hypothetical protein  28.9 
 
 		 277 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.938275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0971  hypothetical protein  29.59 
 
 		 320 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0989  hypothetical protein  29.59 
 
 		 320 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0711273  normal  0.39579 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5526  hypothetical protein  35.29 
 
 		 298 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0999  hypothetical protein  29.59 
 
 		 320 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.651239 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3163  hypothetical protein  28.85 
 
 		 289 aa  67.8  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2878  hypothetical protein  32.78 
 
 		 302 aa  67.8  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3817  hypothetical protein  32.52 
 
 		 294 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.590665  normal  0.529394 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2486  hypothetical protein  29.03 
 
 		 309 aa  65.5  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.123059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11091  hypothetical protein  27.95 
 
 		 283 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0879835  normal  0.520247 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3039  hypothetical protein  36.36 
 
 		 289 aa  64.7  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000250216  hitchhiker  0.00216931 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1942  hypothetical protein  29.14 
 
 		 357 aa  63.9  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.116952 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5457  hypothetical protein  28.35 
 
 		 301 aa  63.5  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597295 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1181  hypothetical protein  31.16 
 
 		 267 aa  63.5  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.59676 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4808  hypothetical protein  34.76 
 
 		 339 aa  62.8  0.000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4443  hypothetical protein  30.57 
 
 		 291 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.353827  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4530  hypothetical protein  30.57 
 
 		 291 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.724398  normal  0.679375 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05730  hypothetical protein  33.09 
 
 		 297 aa  61.2  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4768  protein of unknown function DUF559  42.48 
 
 		 259 aa  60.8  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.146214  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1169  hypothetical protein  28.03 
 
 		 320 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1186  hypothetical protein  28.03 
 
 		 320 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3899  hypothetical protein  29.66 
 
 		 289 aa  60.5  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1656  hypothetical protein  28.95 
 
 		 294 aa  59.7  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13550  hypothetical protein  29.61 
 
 		 279 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000138397  hitchhiker  0.00000300083 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4792  hypothetical protein  27.31 
 
 		 294 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.79958  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0865  hypothetical protein  33.97 
 
 		 319 aa  56.6  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0633151  normal  0.194369 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1355  hypothetical protein  27.82 
 
 		 335 aa  57  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0634709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1335  hypothetical protein  30.57 
 
 		 293 aa  55.8  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.402305 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4159  hypothetical protein  34.84 
 
 		 276 aa  55.8  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00219007  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28800  hypothetical protein  31.08 
 
 		 379 aa  55.5  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0955  hypothetical protein  27.3 
 
 		 307 aa  55.5  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4153  hypothetical protein  29.41 
 
 		 281 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4228  hypothetical protein  29.41 
 
 		 281 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.331823  normal  0.682192 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0991  hypothetical protein  27.63 
 
 		 318 aa  55.1  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.141016  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3121  hypothetical protein  32.34 
 
 		 328 aa  54.3  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.829265  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2812  hypothetical protein  33.76 
 
 		 261 aa  53.5  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.437661  normal  0.0518068 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2647  hypothetical protein  32.46 
 
 		 337 aa  53.1  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.572191  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2531  hypothetical protein  24.53 
 
 		 306 aa  52.4  0.000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1339  hypothetical protein  31.68 
 
 		 262 aa  52.4  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.334499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4384  hypothetical protein  27.88 
 
 		 281 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.88032  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1099  hypothetical protein  39.8 
 
 		 306 aa  51.2  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.994405  hitchhiker  0.000237406 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29770  hypothetical protein  34.43 
 
 		 275 aa  51.2  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.548604 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3520  hypothetical protein  28.39 
 
 		 314 aa  51.2  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.051391  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1196  hypothetical protein  28.03 
 
 		 320 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0446823 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1754  hypothetical protein  33.63 
 
 		 299 aa  50.4  0.00004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.133696  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5155  protein of unknown function DUF559  26.1 
 
 		 311 aa  50.4  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0898  hypothetical protein  37.5 
 
 		 290 aa  50.4  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3623  hypothetical protein  32.12 
 
 		 293 aa  49.7  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.510989  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4825  hypothetical protein  36.17 
 
 		 195 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.634678 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5265  hypothetical protein  26.4 
 
 		 286 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.550058 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4708  hypothetical protein  29.7 
 
 		 301 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00568624 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3288  hypothetical protein  27.5 
 
 		 313 aa  46.6  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3899  hypothetical protein  25.09 
 
 		 289 aa  47  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4303  hypothetical protein  30.81 
 
 		 303 aa  46.2  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.670084 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0912  hypothetical protein  26.86 
 
 		 289 aa  46.2  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0938391  normal  0.0123481 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0597  hypothetical protein  26.71 
 
 		 320 aa  45.4  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0726  hypothetical protein  28.16 
 
 		 310 aa  45.8  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1976  hypothetical protein  33.33 
 
 		 336 aa  45.4  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000667209 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22240  hypothetical protein  48.44 
 
 		 375 aa  45.8  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.527189  normal  0.11385 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1915  hypothetical protein  39.56 
 
 		 297 aa  45.8  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3354  hypothetical protein  28.24 
 
 		 374 aa  44.7  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0068  hypothetical protein  31.86 
 
 		 276 aa  45.1  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>