More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2509 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_17700  cobyric acid synthase  69.39 
 
 		 498 aa  641    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0379411  normal  0.993656 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0360  cobyric acid synthase  70.62 
 
 		 491 aa  670    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0971172 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10258  cobyric acid synthase  70.94 
 
 		 494 aa  664    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0479101 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1613  cobyric acid synthase CobQ  72.48 
 
 		 527 aa  650    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2509  cobyric acid synthase  100 
 
 		 495 aa  967    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.15189  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0377  cobyric acid synthase  70.42 
 
 		 490 aa  639    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2880  cobyric acid synthase  66.94 
 
 		 476 aa  611  1e-173  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7399  adenosylcobyric acid synthase (glutamine- hydrolyzing)  60 
 
 		 509 aa  527  1e-148  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0138  cobyric acid synthase  59.5 
 
 		 486 aa  518  1e-146  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1288  cobyric acid synthase CobQ  60.12 
 
 		 501 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00711481  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6023  cobyric acid synthase CobQ  55.09 
 
 		 529 aa  512  1e-144  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.945282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0558  cobyric acid synthase CobQ  59.8 
 
 		 511 aa  514  1e-144  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2446  cobyric acid synthase CobQ  59.59 
 
 		 509 aa  511  1e-143  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.117915 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5883  cobyric acid synthase CobQ  57.48 
 
 		 509 aa  499  1e-140  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0309  cobyric acid synthase  59.11 
 
 		 501 aa  497  1e-139  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3928  cobyric acid synthase CobQ  57.89 
 
 		 575 aa  494  9.999999999999999e-139  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.111937  normal  0.0307354 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2744  cobyric acid synthase CobQ  56.66 
 
 		 512 aa  494  9.999999999999999e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0267335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3554  cobyric acid synthase CobQ  58.3 
 
 		 521 aa  485  1e-136  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2603  cobyric acid synthase  55.68 
 
 		 520 aa  482  1e-135  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.478422  normal  0.158438 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4863  cobyric acid synthase  56.57 
 
 		 508 aa  463  1e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00498054  normal  0.404957 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1693  cobyric acid synthase CobQ  53.19 
 
 		 507 aa  464  1e-129  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0137801  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2128  cobyric acid synthase CobQ  50.68 
 
 		 517 aa  441  9.999999999999999e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.347874  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0634  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  55.44 
 
 		 499 aa  436  1e-121  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2034  cobyric acid synthase  54.81 
 
 		 495 aa  434  1e-120  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0326425 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2051  cobyric acid synthase  54.81 
 
 		 495 aa  434  1e-120  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.831815  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2097  cobyric acid synthase  54.81 
 
 		 495 aa  434  1e-120  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0722506  normal  0.329562 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4734  cobyric acid synthase  46.95 
 
 		 485 aa  388  1e-106  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33080  cobyric acid synthase  48.57 
 
 		 485 aa  381  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0282392  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1848  cobyric acid synthase CobQ  47.44 
 
 		 496 aa  376  1e-103  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1276  cobyric acid synthase  46.33 
 
 		 484 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.651231  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1677  cobyric acid synthase  45.6 
 
 		 484 aa  372  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4042  cobyric acid synthase  45.6 
 
 		 484 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1236  cobyric acid synthase  46.12 
 
 		 484 aa  371  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.170511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3127  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  43.18 
 
 		 500 aa  372  1e-101  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1456  cobyric acid synthase CobQ  46.76 
 
 		 495 aa  369  1e-101  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.727464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0796  cobyric acid synthase  46.53 
 
 		 481 aa  365  1e-100  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2453  cobyric acid synthase  46.73 
 
 		 481 aa  366  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.094745 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1098  cobyric acid synthase  41.6 
 
 		 517 aa  367  1e-100  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4113  cobyric acid synthase  47.44 
 
 		 490 aa  368  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3377  cobyric acid synthase  42.32 
 
 		 536 aa  365  1e-99  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47690  cobyric acid synthase  47.03 
 
 		 490 aa  365  1e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00733771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3539  cobyric acid synthase CobQ  43.85 
 
 		 776 aa  364  2e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.714834  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1755  cobyric acid synthase  46.94 
 
 		 483 aa  363  3e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.438055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1734  cobyric acid synthase CobQ  42.89 
 
 		 498 aa  363  4e-99  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.534175  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1284  cobyric acid synthase  39.22 
 
 		 514 aa  363  4e-99  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0196  cobyric acid synthase  42.74 
 
 		 491 aa  361  1e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.152835 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000116  cobyric acid synthase  42.32 
 
 		 485 aa  362  1e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0279  cobyric acid synthase  43.52 
 
 		 489 aa  362  1e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3605  cobyric acid synthase CobQ  43.49 
 
 		 772 aa  361  2e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2390  cobyric acid synthase  46.03 
 
 		 495 aa  358  9.999999999999999e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0066766 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1112  cobyric acid synthase  38.57 
 
 		 513 aa  358  9.999999999999999e-98  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2381  cobyric acid synthase  44.15 
 
 		 488 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.62958  decreased coverage  0.00269559 
 
 
-
 
NC_004310  BR1311  cobyric acid synthase  44.35 
 
 		 483 aa  357  1.9999999999999998e-97  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.306129  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05724  cobyric acid synthase  42.05 
 
 		 475 aa  357  1.9999999999999998e-97  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0323  cobyric acid synthase  45.05 
 
 		 491 aa  357  1.9999999999999998e-97  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0041  cobyric acid synthase CobQ  41.49 
 
 		 787 aa  358  1.9999999999999998e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1018  cobyric acid synthase CobQ  37.53 
 
 		 494 aa  357  3.9999999999999996e-97  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0820  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  39.88 
 
 		 503 aa  356  5.999999999999999e-97  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0783  cobyric acid synthase  41.92 
 
 		 495 aa  356  5.999999999999999e-97  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0936  cobyric acid synthase CobQ  39.96 
 
 		 506 aa  355  1e-96  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.164528  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1030  cobyric acid synthase  44.67 
 
 		 518 aa  354  2e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21140  cobyric acid synthase  42.63 
 
 		 508 aa  354  2e-96  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2354  cobyric acid synthase  39.72 
 
 		 506 aa  354  2e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.066722 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2195  cobyric acid synthase  39.92 
 
 		 513 aa  354  2e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1872  cobyric acid synthase  43.21 
 
 		 483 aa  353  2.9999999999999997e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2137  cobyric acid synthase  43.53 
 
 		 484 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.281937  normal  0.137961 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0211  cobyric acid synthase  42.94 
 
 		 491 aa  353  4e-96  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.264631 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2606  cobyric acid synthase  43.15 
 
 		 503 aa  353  4e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2241  cobyric acid synthase  39.92 
 
 		 506 aa  353  4e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.386357  normal  0.07507 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0666  cobyric acid synthase  42.36 
 
 		 484 aa  353  5e-96  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0144  cobyric acid synthase  44.49 
 
 		 487 aa  353  5e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2141  cobyric acid synthase  39.92 
 
 		 506 aa  353  5e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_807  cobyric acid synthase  39.56 
 
 		 503 aa  353  5e-96  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1907  cobyric acid synthase CobQ  44.83 
 
 		 483 aa  353  5.9999999999999994e-96  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0632  cobyric acid synthase  46.7 
 
 		 490 aa  352  5.9999999999999994e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.761759  normal  0.250853 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1683  cobyric acid synthase CobQ  42.95 
 
 		 858 aa  352  7e-96  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2188  cobyric acid synthase  40.12 
 
 		 506 aa  352  8e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0384  cobyric acid synthase  46.73 
 
 		 481 aa  352  8e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.541429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1274  cobyric acid synthase  43.94 
 
 		 506 aa  352  1e-95  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.929502  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3857  cobyric acid synthase CobQ  40.7 
 
 		 491 aa  351  2e-95  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.929745  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2198  cobyric acid synthase  45.23 
 
 		 481 aa  351  2e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.170201 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1989  cobyric acid synthase  44.4 
 
 		 482 aa  350  4e-95  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.56437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1646  cobyric acid synthase  45.51 
 
 		 488 aa  349  5e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00574559 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0240  cobyric acid synthase  40.62 
 
 		 485 aa  350  5e-95  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2656  cobyric acid synthase  44.51 
 
 		 498 aa  349  6e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.74347  normal  0.607627 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1002  cobyric acid synthase  40.27 
 
 		 556 aa  348  1e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0765  cobyric acid synthase  41.47 
 
 		 502 aa  348  1e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3361  cobyric acid synthase  40.55 
 
 		 560 aa  347  2e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3676  cobyric acid synthase  45.64 
 
 		 486 aa  347  2e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0301884  normal  0.0393979 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0485  cobyric acid synthase CobQ:precorrin-3B C17-methyltransferase region  43.17 
 
 		 797 aa  348  2e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3730  cobyric acid synthase  44.42 
 
 		 511 aa  347  2e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0484  cobyric acid synthase  41.72 
 
 		 864 aa  347  3e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1140  cobyric acid synthase  40.8 
 
 		 511 aa  347  3e-94  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.13784 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1014  cobyric acid synthase  40.66 
 
 		 565 aa  347  4e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.727995 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1765  cobyric acid synthase  45.8 
 
 		 484 aa  346  5e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.504033  normal  0.0308945 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3745  cobyric acid synthase  43.94 
 
 		 493 aa  346  5e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0646477  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2304  cobyric acid synthase  44.2 
 
 		 505 aa  345  1e-93  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1560  cobyric acid synthase  40.53 
 
 		 503 aa  345  1e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1038  cobyric acid synthase  41.01 
 
 		 510 aa  344  2e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0717  cobyric acid synthase  41.37 
 
 		 534 aa  344  2e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>