More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2485 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_2180  CTP synthetase  57.72 
 
 		 540 aa  636    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13730  CTP synthetase  73.27 
 
 		 624 aa  823    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0546  CTP synthetase  57.78 
 
 		 547 aa  635    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1923  CTP synthetase  57.38 
 
 		 542 aa  635    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0447943  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2201  CTP synthetase  56.43 
 
 		 536 aa  642    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22080  CTP synthase  76.65 
 
 		 554 aa  865    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.202828  normal  0.968992 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2959  CTP synthetase  72.1 
 
 		 579 aa  837    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.736461 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25420  CTP synthetase  75.23 
 
 		 566 aa  852    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.199429 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0051  CTP synthetase  59.55 
 
 		 547 aa  645    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1199  CTP synthetase  74.22 
 
 		 581 aa  848    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.129574  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1664  CTP synthase  76.08 
 
 		 553 aa  837    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.210101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2823  CTP synthase  74 
 
 		 578 aa  834    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.267203  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3446  CTP synthetase  56.85 
 
 		 531 aa  640    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2990  CTP synthase  74.86 
 
 		 563 aa  835    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.781575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5411  CTP synthetase  77.15 
 
 		 565 aa  832    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0382  CTP synthase  70.02 
 
 		 560 aa  804    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4064  CTP synthetase  72.26 
 
 		 583 aa  846    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.541211  normal  0.525358 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2377  CTP synthase  71.25 
 
 		 581 aa  783    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2409  CTP synthetase  57.38 
 
 		 537 aa  638    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5435  CTP synthetase  75.18 
 
 		 589 aa  831    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00181043  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3157  CTP synthetase  71.91 
 
 		 608 aa  818    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0522365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1911  CTP synthetase  71.86 
 
 		 581 aa  803    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.115982  hitchhiker  0.000439643 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0078  CTP synthetase  56.51 
 
 		 541 aa  645    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3337  CTP synthetase  56.19 
 
 		 531 aa  638    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14180  CTP synthetase  75.89 
 
 		 563 aa  823    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.609851  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1347  CTP synthase  75.65 
 
 		 560 aa  853    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.543908  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11714  CTP synthetase  72.28 
 
 		 586 aa  825    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.24232 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1754  CTP synthetase  72.04 
 
 		 652 aa  814    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206256  hitchhiker  0.00103098 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0054  CTP synthetase  57.75 
 
 		 536 aa  645    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000543339  hitchhiker  0.00121166 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2944  CTP synthetase  72.46 
 
 		 579 aa  841    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1448  CTP synthetase  60.3 
 
 		 551 aa  656    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.38964  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3181  CTP synthetase  57.93 
 
 		 533 aa  649    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1487  CTP synthase  75.46 
 
 		 558 aa  842    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.883119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0563  CTP synthetase  57.78 
 
 		 547 aa  635    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2472  CTP synthetase  58.86 
 
 		 535 aa  666    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2182  CTP synthetase  58.86 
 
 		 535 aa  666    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3502  CTP synthetase  73.01 
 
 		 585 aa  823    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.676775  normal  0.111203 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18060  CTP synthetase  57.17 
 
 		 535 aa  651    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1920  CTP synthetase  72.15 
 
 		 581 aa  802    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.270417 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1135  CTP synthetase  59.19 
 
 		 535 aa  646    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0608  CTP synthetase  68.56 
 
 		 553 aa  788    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.235124  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2418  CTP synthetase  55.51 
 
 		 542 aa  650    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00522161  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3001  CTP synthase  75.5 
 
 		 566 aa  851    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.427451  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3141  CTP synthetase  74.82 
 
 		 572 aa  879    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.151944  normal  0.766797 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2836  CTP synthase  75.97 
 
 		 559 aa  840    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0206831  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2304  CTP synthetase  58.15 
 
 		 533 aa  643    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0258787  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1519  CTP synthetase  74.95 
 
 		 597 aa  852    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.154813  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12400  CTP synthetase  75.65 
 
 		 553 aa  831    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.023708  normal  0.233507 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4432  CTP synthase  68.37 
 
 		 587 aa  796    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.281255  normal  0.849017 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0969  CTP synthase  74.77 
 
 		 546 aa  857    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.538068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2163  CTP synthetase  56.43 
 
 		 536 aa  642    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1243  CTP synthetase  78.29 
 
 		 558 aa  848    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0811753  normal  0.94922 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4844  CTP synthetase  57.33 
 
 		 532 aa  639    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00361153  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2485  CTP synthetase  100 
 
 		 569 aa  1163    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.996454  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1518  CTP synthetase  74.17 
 
 		 587 aa  843    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000885327 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2988  CTP synthetase  72.46 
 
 		 579 aa  841    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.705391  normal  0.156372 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3283  CTP synthetase  72.46 
 
 		 583 aa  833    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2349  CTP synthetase  76.56 
 
 		 567 aa  865    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00181138  normal  0.0174696 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1132  CTP synthetase  75.09 
 
 		 558 aa  859    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0291  CTP synthetase  55.9 
 
 		 534 aa  633  1e-180  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1734  CTP synthetase  55.41 
 
 		 535 aa  629  1e-179  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0461926  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4054  CTP synthase  57.88 
 
 		 545 aa  629  1e-179  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.384479  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2267  CTP synthetase  56.75 
 
 		 545 aa  626  1e-178  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1945  CTP synthetase  56.43 
 
 		 534 aa  626  1e-178  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000498786  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4318  CTP synthetase  56.47 
 
 		 555 aa  623  1e-177  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.13902 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2034  CTP synthetase  56.48 
 
 		 558 aa  624  1e-177  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1762  CTP synthetase  54.91 
 
 		 533 aa  620  1e-176  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.55526  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1895  CTP synthetase  55.94 
 
 		 536 aa  619  1e-176  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0071  CTP synthase  55.36 
 
 		 559 aa  621  1e-176  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0141  CTP synthetase  55.23 
 
 		 533 aa  621  1e-176  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.226323  normal  0.0230809 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0701  CTP synthetase  55.23 
 
 		 533 aa  621  1e-176  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.202095  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4327  CTP synthetase  55.56 
 
 		 555 aa  619  1e-176  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4305  CTP synthetase  55.56 
 
 		 555 aa  617  1e-175  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1607  CTP synthetase  55.92 
 
 		 546 aa  617  1e-175  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.353292 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1276  CTP synthetase  56.35 
 
 		 538 aa  616  1e-175  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000541143 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1954  CTP synthetase  57.51 
 
 		 546 aa  617  1e-175  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4174  CTP synthetase  55.18 
 
 		 555 aa  617  1e-175  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3115  CTP synthetase  55.85 
 
 		 557 aa  615  1e-175  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000124409  hitchhiker  0.00148298 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1743  CTP synthetase  55.88 
 
 		 534 aa  616  1e-175  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3670  CTP synthetase  54.24 
 
 		 558 aa  615  1e-175  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3859  CTP synthetase  54.61 
 
 		 535 aa  615  1e-175  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2963  CTP synthetase  57.8 
 
 		 555 aa  617  1e-175  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000435948  hitchhiker  0.0000264859 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5468  CTP synthetase  54.61 
 
 		 535 aa  613  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.516404  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5187  CTP synthetase  54.24 
 
 		 535 aa  612  9.999999999999999e-175  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.537125  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5022  CTP synthetase  54.24 
 
 		 535 aa  612  9.999999999999999e-175  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5038  CTP synthetase  54.43 
 
 		 535 aa  613  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483501  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5136  CTP synthetase  54.43 
 
 		 535 aa  613  9.999999999999999e-175  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0433  CTP synthetase  55.05 
 
 		 550 aa  612  9.999999999999999e-175  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0589327 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1387  CTP synthetase  57.62 
 
 		 549 aa  612  9.999999999999999e-175  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5583  CTP synthetase  54.24 
 
 		 535 aa  612  9.999999999999999e-175  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.426963  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1743  CTP synthetase  57.41 
 
 		 547 aa  615  9.999999999999999e-175  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0432346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2872  CTP synthetase  53.57 
 
 		 571 aa  612  9.999999999999999e-175  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0537097 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5516  CTP synthetase  54.43 
 
 		 535 aa  613  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00176439  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5431  CTP synthetase  54.43 
 
 		 535 aa  613  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.6711200000000003e-24 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21631  CTP synthetase  55.87 
 
 		 555 aa  608  1e-173  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.397558 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5461  CTP synthetase  54.06 
 
 		 535 aa  610  1e-173  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000119534  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2785  CTP synthetase  55.35 
 
 		 538 aa  611  1e-173  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.963897  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1291  CTP synthetase  55.93 
 
 		 555 aa  610  1e-173  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2887  CTP synthetase  55.08 
 
 		 537 aa  608  1e-173  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.691762 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18211  CTP synthetase  55.74 
 
 		 555 aa  608  1e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>