79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2478 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2478  hypothetical protein  100 
 
 		 374 aa  733    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3031  hypothetical protein  38.38 
 
 		 425 aa  145  1e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.416861 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2018  hypothetical protein  33.17 
 
 		 412 aa  139  7.999999999999999e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.896322  normal  0.166706 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2164  hypothetical protein  32.39 
 
 		 454 aa  139  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00681502  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6064  hypothetical protein  33.6 
 
 		 439 aa  137  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.634375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1252  hypothetical protein  31.75 
 
 		 426 aa  137  4e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.16322 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5441  hypothetical protein  32.41 
 
 		 437 aa  129  8.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.819313 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1747  hypothetical protein  31.25 
 
 		 443 aa  105  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.506846  hitchhiker  0.000552489 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1327  hypothetical protein  27.07 
 
 		 412 aa  93.2  6e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.964057  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0652  putative phosphatase  23.81 
 
 		 433 aa  86.7  6e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.49036  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1422  hypothetical protein  23.18 
 
 		 422 aa  86.3  8e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0657  hypothetical protein  25.42 
 
 		 436 aa  86.3  9e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3165  hypothetical protein  32.52 
 
 		 443 aa  83.2  0.000000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0143624  normal  0.30892 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0718  hypothetical protein  23.96 
 
 		 458 aa  76.6  0.0000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.201396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0847  hypothetical protein  22.16 
 
 		 410 aa  76.6  0.0000000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2349  hypothetical protein  22.47 
 
 		 415 aa  75.9  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.218384  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3292  hypothetical protein  25.69 
 
 		 415 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1990  hypothetical protein  25.34 
 
 		 415 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3017  hypothetical protein  28.94 
 
 		 429 aa  73.2  0.000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0370734  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2042  hypothetical protein  23.93 
 
 		 413 aa  73.2  0.000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000173265  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1638  hypothetical protein  25.24 
 
 		 427 aa  72.8  0.000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0559  hypothetical protein  22.09 
 
 		 410 aa  72.4  0.00000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.146499  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2153  hypothetical protein  23.85 
 
 		 449 aa  72.8  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2667  hypothetical protein  24.4 
 
 		 424 aa  70.9  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0707942  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3462  hypothetical protein  25.07 
 
 		 435 aa  70.1  0.00000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3319  hypothetical protein  24.86 
 
 		 415 aa  69.7  0.00000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.103018  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3297  hypothetical protein  24.86 
 
 		 415 aa  69.7  0.00000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3283  hypothetical protein  24.86 
 
 		 415 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3259  hypothetical protein  24.86 
 
 		 415 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3021  hypothetical protein  25 
 
 		 415 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2967  hypothetical protein  25 
 
 		 415 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.482567  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3152  hypothetical protein  26.43 
 
 		 412 aa  66.6  0.0000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1988  hypothetical protein  25.47 
 
 		 450 aa  66.2  0.0000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2985  hypothetical protein  24.17 
 
 		 415 aa  66.2  0.0000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.767883  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0121  hypothetical protein  25.07 
 
 		 424 aa  65.9  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00158567  normal  0.0307809 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0110  hypothetical protein  25.52 
 
 		 448 aa  63.9  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.765018 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1414  hypothetical protein  25.86 
 
 		 447 aa  63.5  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.792447  normal  0.210387 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1789  hypothetical protein  23.36 
 
 		 413 aa  63.5  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000891935  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4921  hypothetical protein  24.8 
 
 		 450 aa  63.2  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2453  hypothetical protein  28.31 
 
 		 449 aa  63.2  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1235  hypothetical protein  21.81 
 
 		 406 aa  63.2  0.000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0065  hypothetical protein  20.73 
 
 		 418 aa  61.2  0.00000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0099  hypothetical protein  26.79 
 
 		 424 aa  61.2  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00564358  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0062  hypothetical protein  21.24 
 
 		 418 aa  60.8  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.519667  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_537  hypothetical protein  21.81 
 
 		 442 aa  59.7  0.00000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.781044  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0597  hypothetical protein  21.96 
 
 		 442 aa  59.7  0.00000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2276  hypothetical protein  22.83 
 
 		 413 aa  59.3  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1004  hypothetical protein  22.79 
 
 		 413 aa  59.3  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00505199  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0572  hypothetical protein  21.5 
 
 		 442 aa  58.2  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0133  hypothetical protein  23.61 
 
 		 423 aa  58.2  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3256  hypothetical protein  21.84 
 
 		 413 aa  58.2  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2084  hypothetical protein  26.78 
 
 		 415 aa  56.6  0.0000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0833724  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1406  hypothetical protein  29.03 
 
 		 449 aa  56.2  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.122168  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1926  hypothetical protein  22.69 
 
 		 416 aa  55.5  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.570079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0086  hypothetical protein  19.71 
 
 		 411 aa  55.8  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2851  hypothetical protein  22.3 
 
 		 445 aa  55.8  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0586103  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2124  hypothetical protein  25.15 
 
 		 424 aa  55.1  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000234804  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2364  hypothetical protein  22.64 
 
 		 413 aa  55.1  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1920  hypothetical protein  28.43 
 
 		 430 aa  54.7  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.249749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0094  hypothetical protein  23.66 
 
 		 424 aa  53.9  0.000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1283  hypothetical protein  19.06 
 
 		 412 aa  52.4  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000225003  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4577  hypothetical protein  26.99 
 
 		 411 aa  52.4  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0647604  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3628  hypothetical protein  25.29 
 
 		 404 aa  52.4  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.73345 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1502  hypothetical protein  28.76 
 
 		 449 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00218363  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0089  hypothetical protein  22.91 
 
 		 424 aa  52  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.200818  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0704  hypothetical protein  22.19 
 
 		 417 aa  51.2  0.00003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2175  hypothetical protein  23.29 
 
 		 407 aa  50.8  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0009  hypothetical protein  22.43 
 
 		 417 aa  50.4  0.00005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1280  hypothetical protein  25.79 
 
 		 415 aa  48.1  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2814  hypothetical protein  26.9 
 
 		 404 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.380101  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3076  hypothetical protein  24.19 
 
 		 277 aa  47.8  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1138  hypothetical protein  22.93 
 
 		 413 aa  47  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.258981 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2901  hypothetical protein  27.07 
 
 		 404 aa  47.4  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2649  hypothetical protein  24.34 
 
 		 418 aa  46.6  0.0006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.804113  normal  0.316005 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2737  hypothetical protein  22.06 
 
 		 413 aa  46.6  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.601359  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2761  hypothetical protein  25 
 
 		 404 aa  46.6  0.0008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1859  hypothetical protein  22.01 
 
 		 414 aa  46.2  0.0009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.958241  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09523  hypothetical protein  21.15 
 
 		 411 aa  46.2  0.0009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.640574  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2995  hypothetical protein  26.52 
 
 		 404 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>