More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2441 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2441  peptide deformylase  100 
 
 		 181 aa  368  1e-101  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0409247  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1367  peptide deformylase  73.74 
 
 		 182 aa  256  1e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.561221  normal  0.0670098 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2824  Peptide deformylase  72.63 
 
 		 182 aa  255  3e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.397492  normal  0.11831 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3098  peptide deformylase  70.95 
 
 		 188 aa  254  3e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3001  peptide deformylase  69.1 
 
 		 181 aa  254  6e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00230291  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5225  peptide deformylase  67.04 
 
 		 181 aa  251  6e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.240861  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1279  peptide deformylase  69.66 
 
 		 180 aa  247  7e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00526616  normal  0.0870351 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2985  peptide deformylase  69.66 
 
 		 181 aa  239  2e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1861  peptide deformylase  68.93 
 
 		 186 aa  233  1.0000000000000001e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.239464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2574  peptide deformylase  64.84 
 
 		 183 aa  232  3e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.0804397 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1868  peptide deformylase  66.49 
 
 		 186 aa  230  1e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.647129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1718  peptide deformylase  60.99 
 
 		 183 aa  214  5e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0107997  hitchhiker  0.00219347 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3120  peptide deformylase  68.36 
 
 		 177 aa  202  3e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235772  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1592  peptide deformylase  62.89 
 
 		 161 aa  193  9e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0439056  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2508  peptide deformylase  59.26 
 
 		 168 aa  186  1e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0280865  normal  0.0311982 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2357  peptide deformylase  56.79 
 
 		 167 aa  183  9e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.408741  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1664  peptide deformylase  56.17 
 
 		 204 aa  180  8.000000000000001e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000323293 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2568  peptide deformylase  55.83 
 
 		 180 aa  180  1e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.126543  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0295  peptide deformylase  54.88 
 
 		 184 aa  174  6e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.819909 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2433  peptide deformylase  53.94 
 
 		 185 aa  173  9.999999999999999e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1670  peptide deformylase  54.32 
 
 		 197 aa  170  9e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.140138  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14050  peptide deformylase  54.66 
 
 		 162 aa  168  4e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.455853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27860  peptide deformylase  52.44 
 
 		 166 aa  167  7e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0522307 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2158  peptide deformylase  53.42 
 
 		 162 aa  160  7e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1799  peptide deformylase  52.8 
 
 		 162 aa  160  9e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.341074  hitchhiker  0.00908048 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2143  peptide deformylase  53.12 
 
 		 164 aa  159  3e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2660  peptide deformylase  45.1 
 
 		 230 aa  156  1e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.729564  normal  0.0430884 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0402  N-formylmethionyl-tRNA deformylase  46.25 
 
 		 162 aa  146  1.0000000000000001e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00108273  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1520  peptide deformylase  47.2 
 
 		 162 aa  146  2.0000000000000003e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.420459  normal  0.0828575 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5928  Peptide deformylase  50 
 
 		 159 aa  142  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.375256  normal  0.0170344 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34550  peptide deformylase  48.26 
 
 		 183 aa  142  3e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0427  peptide deformylase  47.09 
 
 		 195 aa  139  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.62292  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10790  peptide deformylase  52.74 
 
 		 191 aa  138  3.9999999999999997e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00525841  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7321  Peptide deformylase  48.15 
 
 		 162 aa  138  4.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1468  peptide deformylase  47.17 
 
 		 164 aa  137  7e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0116921  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2532  peptide deformylase  46.45 
 
 		 162 aa  137  1e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0811  peptide deformylase  42.14 
 
 		 162 aa  136  2e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5601  Peptide deformylase  47.27 
 
 		 182 aa  135  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.131759  normal  0.546444 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16790  N-formylmethionyl-tRNA deformylase  45.68 
 
 		 163 aa  134  9e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0288836  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2436  peptide deformylase  45.93 
 
 		 190 aa  131  5e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.108704  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1333  peptide deformylase  46.9 
 
 		 156 aa  127  6e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00759572  normal  0.402167 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4914  peptide deformylase  43.02 
 
 		 190 aa  127  7.000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26070  peptide deformylase  41.95 
 
 		 192 aa  127  8.000000000000001e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5192  peptide deformylase  45.56 
 
 		 213 aa  126  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0341702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3726  peptide deformylase  45 
 
 		 167 aa  125  3e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.766438 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0854  peptide deformylase  43.26 
 
 		 215 aa  124  6e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0000000749472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1688  peptide deformylase  44.79 
 
 		 164 aa  123  2e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5021  peptide deformylase  42.68 
 
 		 225 aa  120  8e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2186  peptide deformylase  45.81 
 
 		 190 aa  119  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000219506 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0402  peptide deformylase  44.13 
 
 		 200 aa  119  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0978833  normal  0.0252019 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3885  peptide deformylase  43.95 
 
 		 173 aa  119  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0724077  normal  0.763087 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_666  peptide deformylase  43.05 
 
 		 167 aa  119  3e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0240694  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0014  peptide deformylase  41.92 
 
 		 230 aa  119  3e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0857  peptide deformylase  45.21 
 
 		 154 aa  119  3e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0732  peptide deformylase  42.22 
 
 		 197 aa  118  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.635565  normal  0.587652 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0897  peptide deformylase  45.83 
 
 		 155 aa  118  4.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0279496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0142  peptide deformylase  45.22 
 
 		 173 aa  117  7e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00942793  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0687  peptide deformylase  43.62 
 
 		 167 aa  117  7.999999999999999e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.132535  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0760  peptide deformylase  42.38 
 
 		 167 aa  117  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0435683  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10434  peptide deformylase  40.78 
 
 		 197 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0367345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0372  peptide deformylase  40.79 
 
 		 169 aa  117  9.999999999999999e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4287  peptide deformylase  40.96 
 
 		 170 aa  116  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2602  peptide deformylase  44.19 
 
 		 199 aa  116  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.280121  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0583  peptide deformylase  47.24 
 
 		 178 aa  115  3e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0768  peptide deformylase  40.49 
 
 		 185 aa  115  3e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0336972  normal  0.920717 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1320  peptide deformylase  45.22 
 
 		 167 aa  115  3e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.369931  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0559  peptide deformylase  41.9 
 
 		 197 aa  115  3e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.489462 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0569  peptide deformylase  41.9 
 
 		 197 aa  115  3e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0581  peptide deformylase  41.9 
 
 		 197 aa  115  3e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28634  hitchhiker  0.00744017 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0567  peptide deformylase  43.75 
 
 		 170 aa  115  3.9999999999999997e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000525099  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1726  peptide deformylase  42.94 
 
 		 221 aa  114  5e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0175  peptide deformylase  42.78 
 
 		 197 aa  114  6e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.94792 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1035  peptide deformylase  40.24 
 
 		 187 aa  114  1.0000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0021  peptide deformylase  42.86 
 
 		 167 aa  113  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.3876 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0562  peptide deformylase  44.65 
 
 		 185 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0976  peptide deformylase  40.24 
 
 		 187 aa  114  1.0000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2648  hypothetical protein  41.51 
 
 		 170 aa  112  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2518  hypothetical protein  41.51 
 
 		 170 aa  112  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1528  peptide deformylase  44.06 
 
 		 159 aa  112  3e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2314  peptide deformylase  41.1 
 
 		 164 aa  112  3e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.566498  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1344  peptide deformylase  38.41 
 
 		 175 aa  112  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3853  peptide deformylase  41.72 
 
 		 150 aa  112  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1168  peptide deformylase  41.38 
 
 		 164 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00145163  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0830  peptide deformylase  40.27 
 
 		 187 aa  111  5e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.139175  normal  0.098116 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1174  peptide deformylase  39.72 
 
 		 162 aa  111  5e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.234676  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1952  peptide deformylase  44.52 
 
 		 157 aa  111  5e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4010  peptide deformylase  40.82 
 
 		 187 aa  111  6e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.132582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3965  peptide deformylase  40.82 
 
 		 187 aa  111  6e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09550  peptide deformylase  37.5 
 
 		 213 aa  111  6e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.255264  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1593  peptide deformylase  41.89 
 
 		 154 aa  110  8.000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3881  peptide deformylase  43.15 
 
 		 156 aa  110  9e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000146602 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1039  peptide deformylase  39.58 
 
 		 166 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1679  peptide deformylase  37.89 
 
 		 185 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3718  peptide deformylase  43.15 
 
 		 156 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.193094  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0818  peptide deformylase  40.12 
 
 		 171 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2492  peptide deformylase  37.42 
 
 		 163 aa  110  1.0000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4005  peptide deformylase  43.15 
 
 		 156 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1130  peptide deformylase  42.18 
 
 		 164 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000143546  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09890  peptide deformylase  41.22 
 
 		 154 aa  109  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2722  peptide deformylase  41.45 
 
 		 187 aa  109  3e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>