More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2407 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0146  alanyl-tRNA synthetase  41.86 
 
 		 876 aa  639    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0010822  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2096  alanyl-tRNA synthetase  42.08 
 
 		 879 aa  659    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.224522  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0375  alanine--tRNA ligase  51.88 
 
 		 894 aa  835    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2268  alanyl-tRNA synthetase  42.66 
 
 		 878 aa  646    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000149569 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1819  alanyl-tRNA synthetase  59.12 
 
 		 892 aa  979    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000366282 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3075  alanyl-tRNA synthetase  55.53 
 
 		 888 aa  905    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.314973 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1351  alanyl-tRNA synthetase  57.13 
 
 		 895 aa  950    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6094  Alanine--tRNA ligase  61.08 
 
 		 890 aa  956    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0138717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16360  alanyl-tRNA synthetase  54.52 
 
 		 902 aa  929    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2557  alanyl-tRNA synthetase  43.09 
 
 		 887 aa  639    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.243689  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1828  alanyl-tRNA synthetase  59.12 
 
 		 892 aa  982    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.222093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2070  alanyl-tRNA synthetase  55.54 
 
 		 889 aa  931    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.450401  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1694  alanyl-tRNA synthetase  59.8 
 
 		 892 aa  924    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0569274  normal  0.130258 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2135  alanyl-tRNA synthetase  62.2 
 
 		 889 aa  989    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00198775  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17690  alanyl-tRNA synthetase  57.13 
 
 		 895 aa  931    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.010603  normal  0.139761 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15270  alanyl-tRNA synthetase  57.89 
 
 		 888 aa  952    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0205422  normal  0.854238 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12720  alanyl-tRNA synthetase  53.16 
 
 		 903 aa  859    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.233264  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0769  alanyl-tRNA synthetase  41.03 
 
 		 878 aa  651    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0610904  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2408  alanyl-tRNA synthetase  42.35 
 
 		 882 aa  654    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00604857  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1689  alanyl-tRNA synthetase  56.38 
 
 		 895 aa  928    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.153123  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0201  alanyl-tRNA synthetase  42.18 
 
 		 876 aa  652    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0035752 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1975  alanyl-tRNA synthetase  55.28 
 
 		 890 aa  898    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.235306  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2047  alanyl-tRNA synthetase  62.26 
 
 		 889 aa  1028    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0621427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2026  alanyl-tRNA synthetase  44.36 
 
 		 879 aa  645    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0668165  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3297  alanyl-tRNA synthetase  54.78 
 
 		 891 aa  882    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000320998  normal  0.10569 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3214  alanyl-tRNA synthetase  58.38 
 
 		 881 aa  904    Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0063614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0912  alanyl-tRNA synthetase  42.21 
 
 		 880 aa  636    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00106674  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1279  alanyl-tRNA synthetase  44.72 
 
 		 881 aa  641    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.302491  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3200  alanyl-tRNA synthetase  43.33 
 
 		 880 aa  674    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0953243  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3878  alanyl-tRNA synthetase  55.87 
 
 		 885 aa  954    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.785303  normal  0.718927 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1521  alanyl-tRNA synthetase  42.92 
 
 		 887 aa  637    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3154  alanyl-tRNA synthetase  40.67 
 
 		 876 aa  647    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2014  alanyl-tRNA synthetase  57.86 
 
 		 896 aa  897    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.226707  normal  0.142525 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12510  alanyl-tRNA synthetase  56.87 
 
 		 893 aa  917    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.617945  normal  0.25929 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2346  alanyl-tRNA synthetase  53.92 
 
 		 897 aa  852    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.413447  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0616  alanyl-tRNA synthetase  52.05 
 
 		 893 aa  834    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2320  alanyl-tRNA synthetase  53.14 
 
 		 900 aa  861    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.871367  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3032  alanyl-tRNA synthetase  60.63 
 
 		 893 aa  990    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3763  alanyl-tRNA synthetase  54.75 
 
 		 898 aa  866    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.49187 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2387  alanyl-tRNA synthetase  53.81 
 
 		 897 aa  850    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.648952  normal  0.0242506 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1818  alanyl-tRNA synthetase  56.65 
 
 		 897 aa  873    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.17806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05750  alanyl-tRNA synthetase  42.7 
 
 		 876 aa  665    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.214182  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3158  alanyl-tRNA synthetase  58.18 
 
 		 897 aa  931    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.412954  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12576  alanyl-tRNA synthetase  52.91 
 
 		 904 aa  843    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.251019  normal  0.0860525 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2378  alanyl-tRNA synthetase  61.02 
 
 		 889 aa  1028    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2278  alanyl-tRNA synthetase  53.77 
 
 		 892 aa  892    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00416969  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1489  alanyl-tRNA synthetase  40.07 
 
 		 877 aa  635    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000163922  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0013  alanyl-tRNA synthetase  42.51 
 
 		 878 aa  647    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1330  alanyl-tRNA synthetase  58.2 
 
 		 886 aa  937    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0429057  normal  0.324853 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3176  alanyl-tRNA synthetase  42.74 
 
 		 878 aa  659    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2407  alanyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 896 aa  1801    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.714506  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2393  alanyl-tRNA synthetase  53.92 
 
 		 897 aa  852    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.545162 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2640  alanyl-tRNA synthetase  53.42 
 
 		 898 aa  842    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.747101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2015  alanyl-tRNA synthetase  54.1 
 
 		 898 aa  890    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000286953 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5265  alanyl-tRNA synthetase  55.98 
 
 		 890 aa  914    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1780  alanyl-tRNA synthetase  39.31 
 
 		 878 aa  634  1e-180  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0561709 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0222  alanyl-tRNA synthetase  40.72 
 
 		 876 aa  634  1e-180  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1331  alanyl-tRNA synthetase  39.71 
 
 		 883 aa  633  1e-180  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.255644  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1906  alanyl-tRNA synthetase  40.96 
 
 		 879 aa  631  1e-179  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1394  alanyl-tRNA synthetase  42.68 
 
 		 883 aa  627  1e-178  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0850  alanyl-tRNA synthetase  41.18 
 
 		 874 aa  623  1e-177  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0089  alanyl-tRNA synthetase  42.65 
 
 		 879 aa  625  1e-177  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0831  alanyl-tRNA synthetase  41.3 
 
 		 884 aa  622  1e-176  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.168627  normal  0.137566 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0148  alanyl-tRNA synthetase  41.48 
 
 		 875 aa  616  1e-175  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.379709  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2168  alanyl-tRNA synthetase  42.13 
 
 		 884 aa  619  1e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.176955  normal  0.0912251 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1033  alanyl-tRNA synthetase  40.58 
 
 		 882 aa  617  1e-175  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2555  alanyl-tRNA synthetase  42.43 
 
 		 878 aa  618  1e-175  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0951  alanyl-tRNA synthetase  43.59 
 
 		 854 aa  616  1e-175  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.197115  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1433  alanyl-tRNA synthetase  40.6 
 
 		 863 aa  615  9.999999999999999e-175  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00451  alanyl-tRNA synthetase  38.01 
 
 		 886 aa  614  9.999999999999999e-175  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3711  alanyl-tRNA synthetase  39.67 
 
 		 905 aa  614  9.999999999999999e-175  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.296443  hitchhiker  0.000064855 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00471  alanyl-tRNA synthetase  38.24 
 
 		 886 aa  614  9.999999999999999e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1311  alanyl-tRNA synthetase  41.2 
 
 		 874 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.290938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3223  alanyl-tRNA synthetase  39.35 
 
 		 931 aa  612  9.999999999999999e-175  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3925  alanyl-tRNA synthetase  42.41 
 
 		 905 aa  613  9.999999999999999e-175  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.013428  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3839  alanyl-tRNA synthetase  42.3 
 
 		 905 aa  613  9.999999999999999e-175  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.538554  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5448  alanyl-tRNA synthetase  41.5 
 
 		 896 aa  610  1e-173  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.10309 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0962  alanyl-tRNA synthetase  41.6 
 
 		 878 aa  611  1e-173  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0451  alanyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 883 aa  610  1e-173  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2374  alanyl-tRNA synthetase  40.87 
 
 		 880 aa  611  1e-173  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0815913  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0045  alanyl-tRNA synthetase  38.01 
 
 		 886 aa  612  1e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.214669  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3784  alanyl-tRNA synthetase  42.56 
 
 		 905 aa  611  1e-173  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0683735  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3181  alanyl-tRNA synthetase  40.25 
 
 		 879 aa  610  1e-173  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2824  alanyl-tRNA synthetase  40.87 
 
 		 874 aa  610  1e-173  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0756598 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2372  alanyl-tRNA synthetase  42.78 
 
 		 883 aa  609  1e-173  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.726035  normal  0.535692 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1387  alanyl-tRNA synthetase  40.56 
 
 		 863 aa  610  1e-173  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115833  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4284  alanyl-tRNA synthetase  39.65 
 
 		 880 aa  605  9.999999999999999e-173  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1590  alanyl-tRNA synthetase  41.42 
 
 		 864 aa  607  9.999999999999999e-173  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.136396  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4616  alanyl-tRNA synthetase  39.65 
 
 		 880 aa  605  9.999999999999999e-173  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00215408  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1957  alanyl-tRNA synthetase  41.83 
 
 		 884 aa  607  9.999999999999999e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.103878  normal  0.2106 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1613  alanyl-tRNA synthetase  40.87 
 
 		 874 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.894889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0728  alanyl-tRNA synthetase  39.87 
 
 		 880 aa  607  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00762442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0927  alanyl-tRNA synthetase  40.49 
 
 		 897 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.540325  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1409  alanyl-tRNA synthetase  40.6 
 
 		 897 aa  608  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.412076  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2104  alanyl-tRNA synthetase  42.74 
 
 		 883 aa  608  9.999999999999999e-173  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.653271  normal  0.762887 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0598  alanyl-tRNA synthetase  41.12 
 
 		 885 aa  606  9.999999999999999e-173  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.188713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0843  alanyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 892 aa  608  9.999999999999999e-173  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000200247  unclonable  0.0000000309197 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2490  alanyl-tRNA synthetase  40.46 
 
 		 877 aa  608  9.999999999999999e-173  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000298908  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1387  alanyl-tRNA synthetase  40.38 
 
 		 874 aa  608  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.371658 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1324  alanyl-tRNA synthetase  40.27 
 
 		 874 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.632034 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>