163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2382 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_2382  SNO glutamine amidotransferase  100 
 
 
201 aa  397  9.999999999999999e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6117  SNO glutamine amidotransferase family  68.34 
 
 
196 aa  264  5.999999999999999e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.298038  normal  0.336811 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2107  SNO glutamine amidotransferase  66.5 
 
 
219 aa  262  2e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0846545  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0824  SNO glutamine amidotransferase  66.67 
 
 
202 aa  260  8e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0589495  normal  0.0695207 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2109  SNO glutamine amidotransferase  65.99 
 
 
204 aa  255  3e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0561786  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1988  SNO glutamine amidotransferase  64.97 
 
 
200 aa  254  5e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00558528 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2067  SNO glutamine amidotransferase  66 
 
 
196 aa  253  1.0000000000000001e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1792  SNO glutamine amidotransferase  65 
 
 
203 aa  253  2.0000000000000002e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.369392  normal  0.171036 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2097  glutamine amidotransferase subunit PdxT  63.96 
 
 
201 aa  249  1e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3180  SNO glutamine amidotransferase  63.13 
 
 
217 aa  249  1e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2250  glutamine amidotransferase subunit PdxT  63.27 
 
 
206 aa  243  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0531826  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2297  glutamine amidotransferase subunit PdxT  63.27 
 
 
206 aa  243  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3058  SNO glutamine amidotransferase  61.69 
 
 
207 aa  243  9.999999999999999e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.293498  normal  0.634434 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2350  SNO glutamine amidotransferase  64.77 
 
 
204 aa  243  1.9999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2628  SNO glutamine amidotransferase  63.4 
 
 
210 aa  242  3e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.556247  normal  0.566633 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2289  glutamine amidotransferase subunit PdxT  62.76 
 
 
206 aa  240  1e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1778  SNO glutamine amidotransferase  63.27 
 
 
201 aa  239  2e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00618792 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1664  SNO glutamine amidotransferase  57.14 
 
 
213 aa  237  1e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0590929  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15360  pyridoxal phosphate synthase yaaE subunit  61.84 
 
 
212 aa  236  2e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.132239  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1347  glutamine amidotransferase subunit PdxT  63 
 
 
207 aa  235  4e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.20518  normal  0.550615 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1791  SNO glutamine amidotransferase  61.22 
 
 
201 aa  231  5e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.16453  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2566  glutamine amidotransferase subunit PdxT  62.05 
 
 
195 aa  230  1e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2298  SNO glutamine amidotransferase  60.61 
 
 
211 aa  229  2e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5148  glutamine amidotransferase subunit PdxT  61.81 
 
 
203 aa  228  4e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00302911  decreased coverage  0.000104531 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1367  glutamine amidotransferase subunit PdxT  59.18 
 
 
199 aa  224  6e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.39004 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2305  glutamine amidotransferase subunit PdxT  55.5 
 
 
236 aa  222  3e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00618121  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2035  glutamine amidotransferase subunit PdxT  55.05 
 
 
236 aa  220  9.999999999999999e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000103921 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3399  SNO glutamine amidotransferase  59.69 
 
 
203 aa  219  3e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00144938  hitchhiker  0.00000892885 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12623  glutamine amidotransferase subunit PdxT  58 
 
 
198 aa  216  1e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1930  SNO glutamine amidotransferase  57.73 
 
 
201 aa  215  4e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.142807  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3807  SNO glutamine amidotransferase  57.51 
 
 
190 aa  204  6e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00155051  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3830  glutamine amidotransferase subunit PdxT  61.34 
 
 
195 aa  204  8e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.213314 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0573  glutamine amidotransferase subunit PdxT  55.5 
 
 
195 aa  198  3.9999999999999996e-50  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2041  SNO glutamine amidotransferase  54.69 
 
 
190 aa  195  5.000000000000001e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0223517  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0598  glutamine amidotransferase subunit PdxT  52.04 
 
 
195 aa  193  1e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.474532  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3235  SNO glutamine amidotransferase  52.11 
 
 
189 aa  192  4e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_538  SNO glutamine amidotransferase family  51.53 
 
 
195 aa  191  5e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0013  SNO glutamine amidotransferase  52.88 
 
 
193 aa  190  1e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.489468  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3723  SNO glutamine amidotransferase  51.04 
 
 
189 aa  189  2e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181067 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4347  glutamine amidotransferase subunit PdxT  50 
 
 
191 aa  188  4e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000714565  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0448  glutamine amidotransferase subunit PdxT  50.78 
 
 
188 aa  188  5.999999999999999e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000803094  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0008  SNO glutamine amidotransferase  53.61 
 
 
194 aa  187  7e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0011  glutamine amidotransferase subunit PdxT  50 
 
 
188 aa  186  2e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0273171  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1858  glutamine amidotransferase subunit PdxT  47.64 
 
 
187 aa  186  3e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0468928  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0463  glutamine amidotransferase subunit PdxT  50.26 
 
 
188 aa  186  3e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0035  SNO glutamine amidotransferase  49.74 
 
 
196 aa  184  7e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1750  glutamine amidotransferase subunit PdxT  45.64 
 
 
191 aa  183  2.0000000000000003e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0010  glutamine amidotransferase subunit PdxT  51.3 
 
 
189 aa  183  2.0000000000000003e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000532264  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19920  pyridoxal phosphate synthase yaaE subunit  50.73 
 
 
208 aa  179  4e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.573466  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0010  glutamine amidotransferase subunit PdxT  48.44 
 
 
188 aa  178  5.999999999999999e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.0000000000000200223  unclonable  0.00000000668451 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1547  SNO glutamine amidotransferase  52.36 
 
 
195 aa  177  8e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0627546  hitchhiker  0.00674426 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1897  SNO glutamine amidotransferase  48.97 
 
 
191 aa  177  1e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0960589  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_7092  predicted protein  47.22 
 
 
216 aa  176  2e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0012  glutamine amidotransferase subunit PdxT  48.72 
 
 
196 aa  175  3e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000426828  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0012  glutamine amidotransferase subunit PdxT  46.94 
 
 
192 aa  175  4e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000128055  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1107  glutamine amidotransferase subunit PdxT  48.5 
 
 
201 aa  174  8e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00213413  decreased coverage  0.0014311 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0012  glutamine amidotransferase subunit PdxT  48.21 
 
 
196 aa  173  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000589315  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0012  glutamine amidotransferase subunit PdxT  47.45 
 
 
196 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0017  glutamine amidotransferase subunit PdxT  48.21 
 
 
196 aa  173  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000149279  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1110  SNO glutamine amidotransferase  49.22 
 
 
198 aa  172  1.9999999999999998e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00211024  hitchhiker  0.0000000000000181394 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0011  glutamine amidotransferase subunit PdxT  48.21 
 
 
196 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000439429  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0015  glutamine amidotransferase subunit PdxT  46.67 
 
 
196 aa  171  5e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5303  glutamine amidotransferase subunit PdxT  47.18 
 
 
196 aa  171  9e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000178442  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2937  SNO glutamine amidotransferase  47.94 
 
 
190 aa  170  1e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0527364  normal  0.214935 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0011  glutamine amidotransferase subunit PdxT  45.13 
 
 
196 aa  169  2e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00056794  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3161  SNO glutamine amidotransferase  50.25 
 
 
191 aa  169  3e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.655935  normal  0.065831 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0159  glutamine amidotransferase subunit PdxT  45.5 
 
 
186 aa  167  7e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1601  SNO glutamine amidotransferase  44.28 
 
 
198 aa  166  2e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1037  glutamine amidotransferase  46.15 
 
 
191 aa  166  2.9999999999999998e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.133166  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0920  SNO glutamine amidotransferase  47.62 
 
 
186 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0959  SNO glutamine amidotransferase  42.56 
 
 
192 aa  164  5.9999999999999996e-40  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2184  SNO glutamine amidotransferase  40.51 
 
 
188 aa  164  9e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000861553  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1483  SNO glutamine amidotransferase  43.81 
 
 
190 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.441099  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0012  glutamine amidotransferase subunit PdxT  48.72 
 
 
196 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000139131  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0015  glutamine amidotransferase subunit PdxT  48.72 
 
 
196 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0014  glutamine amidotransferase subunit PdxT  48.21 
 
 
196 aa  162  3e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0011  glutamine amidotransferase subunit PdxT  48.21 
 
 
196 aa  162  3e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000347383  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1060  pyridoxal 5'-phosphate synthase, glutaminase subunit Pdx2  45.69 
 
 
197 aa  162  3e-39  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.149673 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1859  glutamine amidotransferase subunit PdxT  44.04 
 
 
189 aa  161  5.0000000000000005e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00060363  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1220  SNO glutamine amidotransferase  53.4 
 
 
212 aa  161  7e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.148888  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1317  SNO glutamine amidotransferase  45.79 
 
 
204 aa  160  1e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0522409  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0542  glutamine amidotransferase subunit PdxT  43.3 
 
 
186 aa  160  1e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0556  glutamine amidotransferase subunit PdxT  43.3 
 
 
186 aa  160  1e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1478  SNO glutamine amidotransferase  41.26 
 
 
205 aa  157  1e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1078  glutamine amidotransferase subunit PdxT  43.3 
 
 
199 aa  155  3e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000385984  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0078  hypothetical protein  44.79 
 
 
189 aa  154  7e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0431149 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0009  glutamine amidotransferase subunit PdxT  49.24 
 
 
199 aa  154  8e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1871  glutamine amidotransferase subunit PdxT  47.67 
 
 
192 aa  152  4e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0156111  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2227  glutamine amidotransferase subunit PdxT  47.69 
 
 
195 aa  150  1e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0367546 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3580  glutamine amidotransferase subunit PdxT  41.71 
 
 
200 aa  149  3e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.118248 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0902  glutamine amidotransferase subunit PdxT  43.59 
 
 
212 aa  149  3e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0551  glutamine amidotransferase subunit PdxT  45.6 
 
 
197 aa  149  4e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0370  glutamine amidotransferase subunit PdxT  46.07 
 
 
197 aa  147  1.0000000000000001e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0422  glutamine amidotransferase subunit PdxT  42.42 
 
 
198 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0010  glutamine amidotransferase subunit PdxT  45.64 
 
 
192 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0040  SNO glutamine amidotransferase  46.43 
 
 
196 aa  145  5e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1409  glutamine amidotransferase subunit PdxT  45.88 
 
 
192 aa  144  6e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.794168  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2240  SNO glutamine amidotransferase  41.15 
 
 
189 aa  145  6e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0214455  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1336  glutamine amidotransferase subunit PdxT  43.56 
 
 
202 aa  143  2e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.424247  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2323  glutamine amidotransferase subunit PdxT  42 
 
 
196 aa  142  4e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>