More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2355 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2355  TrkA domain-containing protein  100 
 
 		 366 aa  722    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1256  TrkA-N domain protein  50.73 
 
 		 350 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.430368  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1138  TrkA-N domain protein  47.6 
 
 		 366 aa  311  9e-84  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.576747  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3499  TrkA-N domain protein  48.02 
 
 		 356 aa  309  5.9999999999999995e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0133106  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1406  TrkA-N  45.76 
 
 		 359 aa  296  5e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.23449  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1460  TrkA domain-containing protein  45.76 
 
 		 359 aa  296  5e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0703342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1424  TrkA domain-containing protein  45.76 
 
 		 359 aa  296  5e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.753948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4663  TrkA domain-containing protein  44.88 
 
 		 359 aa  291  1e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1804  TrkA domain-containing protein  45.78 
 
 		 359 aa  288  1e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.008758  normal  0.0737173 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13223  transmembrane cation transporter  47.42 
 
 		 355 aa  285  7e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0847  TrkA-N domain protein  47.09 
 
 		 359 aa  282  6.000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0205361  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0697  TrkA domain-containing protein  48.04 
 
 		 345 aa  276  5e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.793307 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0644  TrkA domain-containing protein  47.87 
 
 		 339 aa  273  4.0000000000000004e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.247838  hitchhiker  0.00992918 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3603  TrkA-N domain protein  49.03 
 
 		 335 aa  272  6e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.497588 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0055  TrkA-N domain protein  47.24 
 
 		 336 aa  269  5.9999999999999995e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4967  TrkA-N domain protein  43.95 
 
 		 398 aa  267  2e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06820  K+ transport system, NAD-binding component  47.58 
 
 		 370 aa  251  1e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.074637  normal  0.0591627 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0720  TrkA-N  35.48 
 
 		 355 aa  199  6e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4906  TrkA-N domain protein  35.01 
 
 		 368 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0415092 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0848  TrkA-N  34.78 
 
 		 347 aa  184  2.0000000000000003e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0423628  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4403  TrkA domain-containing protein  34.44 
 
 		 341 aa  183  4.0000000000000006e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.602366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4504  TrkA domain-containing protein  33.04 
 
 		 364 aa  178  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4046  TrkA domain-containing protein  33.33 
 
 		 364 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.809582 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4030  TrkA domain-containing protein  33.63 
 
 		 364 aa  176  6e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.702941  normal  0.742816 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3710  TrkA-N  32.44 
 
 		 364 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.360814  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4658  TrkA domain-containing protein  32.44 
 
 		 364 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.677832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1162  TrkA-like protein  31.85 
 
 		 386 aa  171  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.30388 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5641  TrkA domain-containing protein  32.14 
 
 		 364 aa  170  3e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.289182 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1460  TrkA domain-containing protein  31.43 
 
 		 413 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1364  TrkA domain-containing protein  32.18 
 
 		 369 aa  156  6e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2540  TrkA domain-containing protein  32.18 
 
 		 369 aa  155  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0305515  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1286  putative potassium channel protein  32.18 
 
 		 369 aa  155  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1025  putative potassium channel protein  33.23 
 
 		 326 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1293  TrkA domain-containing protein  33.23 
 
 		 326 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0542  TrkA domain-containing protein  33.23 
 
 		 326 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0270  putative potassium channel protein  33.23 
 
 		 326 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.435171  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1528  TrkA domain-containing protein  26.99 
 
 		 347 aa  104  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.857437  normal  0.417483 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2039  TrkA-N domain protein  31.6 
 
 		 350 aa  103  4e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2970  TrkA-N domain protein  32.48 
 
 		 393 aa  102  7e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.489017  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2095  TrkA family potassium uptake protein  27.39 
 
 		 346 aa  103  7e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.188907  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2999  TrkA-N domain protein  34.45 
 
 		 388 aa  102  9e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0471  TrkA domain-containing protein  24.32 
 
 		 325 aa  102  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1529  TrkA-N domain protein  36.21 
 
 		 395 aa  101  2e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.479554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1751  TrkA domain-containing protein  28.82 
 
 		 332 aa  99.8  7e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0577  TrkA-N domain protein  32.2 
 
 		 395 aa  98.6  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2079  TrkA-N domain protein  27.33 
 
 		 371 aa  96.3  7e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0453  TrkA-N domain protein  29.24 
 
 		 346 aa  95.9  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1694  TrkA domain-containing protein  27.95 
 
 		 332 aa  95.9  1e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.249596  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1993  TrkA-N domain protein  33.33 
 
 		 399 aa  94.7  2e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0873902 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2168  TrkA-N domain protein  24.25 
 
 		 531 aa  93.6  5e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1142  TrkA domain-containing protein  24.55 
 
 		 341 aa  91.3  2e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1120  TrkA-N domain protein  23.43 
 
 		 335 aa  90.5  4e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000439413  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5545  TrkA-N domain protein  28.62 
 
 		 341 aa  90.9  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.789205 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5075  potassium channel protein  26.97 
 
 		 334 aa  89.7  7e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000793674  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5092  potassium channel protein  26.97 
 
 		 334 aa  89.7  7e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00108262  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0556  TrkA domain-containing protein  26.14 
 
 		 346 aa  89.7  7e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5489  potassium uptake protein, TrkA family  28.16 
 
 		 330 aa  89  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3731  hypothetical protein  24.9 
 
 		 338 aa  89  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000159336  normal  0.309617 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00100  potassium channel protein  24.05 
 
 		 335 aa  88.2  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.377928  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5434  potassium uptake protein, TrkA family  29.95 
 
 		 337 aa  87  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14401  K+ transport system, NAD-binding component  26.76 
 
 		 352 aa  87  5e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000716154 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5187  TrkA domain-containing protein  28.5 
 
 		 330 aa  86.7  7e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5573  potassium uptake protein, TrkA family  27.76 
 
 		 330 aa  85.9  9e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5517  potassium uptake protein, TrkA family  26.92 
 
 		 330 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1045  TrkA domain-containing protein  25.85 
 
 		 350 aa  85.9  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000596347  hitchhiker  0.00364441 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2743  TrkA domain-containing protein  24.04 
 
 		 333 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3004  TrkA-N domain-containing protein  23.67 
 
 		 354 aa  85.1  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3877  TrkA-N domain protein  28.4 
 
 		 350 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.705897 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08671  VIC family potassium channel protein  25.43 
 
 		 351 aa  85.1  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1520  TrkA domain-containing protein  24.03 
 
 		 324 aa  84.7  0.000000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.639077  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3347  TrkA-N  25.18 
 
 		 352 aa  84.7  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.220422  normal  0.349567 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2854  TrkA-N domain protein  22.02 
 
 		 331 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3680  TrkA domain-containing protein  27.47 
 
 		 509 aa  84.3  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0800  TrkA-N domain protein  26.58 
 
 		 331 aa  83.6  0.000000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.501698  normal  0.632091 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3794  TrkA-N domain protein  28.22 
 
 		 350 aa  83.2  0.000000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.434274  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0117  TrkA-N domain protein  26.42 
 
 		 345 aa  83.2  0.000000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3915  TrkA domain-containing protein  28.03 
 
 		 330 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.557122  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07711  VIC family potassium channel protein  25 
 
 		 351 aa  81.6  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.584573  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0715  VIC family potassium channel protein  25 
 
 		 351 aa  81.6  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.4714  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07731  VIC family potassium channel protein  25 
 
 		 351 aa  81.3  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5153  TrkA-N domain protein  23.98 
 
 		 355 aa  80.9  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000053583 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1024  TrkA domain-containing protein  26.7 
 
 		 335 aa  80.9  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.282206 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1744  VIC family potassium channel protein  26.81 
 
 		 352 aa  80.5  0.00000000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3127  K+ transport systems, NAD-binding component  26.77 
 
 		 337 aa  80.1  0.00000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0451  TrkA domain-containing protein  21.86 
 
 		 336 aa  80.1  0.00000000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.278158  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0403  VIC family potassium channel protein  26.16 
 
 		 346 aa  79.7  0.00000000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.133961  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0922  TrkA domain-containing protein  25.63 
 
 		 335 aa  79.3  0.00000000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10941  hypothetical protein  26.16 
 
 		 346 aa  79.3  0.00000000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275534 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1654  TrkA domain-containing protein  27.18 
 
 		 335 aa  79.3  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.190782  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1744  TrkA-N domain protein  29.82 
 
 		 368 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.844821 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3909  TrkA domain-containing protein  25.56 
 
 		 355 aa  78.6  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0877338 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06531  putative potassium channel, VIC family protein  27.27 
 
 		 359 aa  77.8  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1332  TrkA-N:Ion transport protein  21.65 
 
 		 517 aa  77.4  0.0000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.478947  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0368  TrkA-N domain protein  23.39 
 
 		 356 aa  77  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0361  TrkA-N domain protein  23.39 
 
 		 356 aa  76.6  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0353  TrkA-N domain protein  31.44 
 
 		 542 aa  76.6  0.0000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2971  TrkA domain-containing protein  24.66 
 
 		 350 aa  76.6  0.0000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2518  TrkA-N domain protein  23.78 
 
 		 362 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2566  TrkA-N domain protein  28.94 
 
 		 336 aa  75.5  0.000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4160  TrkA domain-containing protein  22.78 
 
 		 351 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>