145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2337 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2337  methyltransferase type 12  100 
 
 		 440 aa  866    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2341  hypothetical protein  58.62 
 
 		 178 aa  207  3e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00227549 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2302  hypothetical protein  58.05 
 
 		 178 aa  206  7e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.69717  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2349  hypothetical protein  58.05 
 
 		 178 aa  206  7e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.996131  normal  0.40591 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3837  hypothetical protein  56.55 
 
 		 172 aa  186  5e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0455557  normal  0.186197 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3588  hypothetical protein  57.87 
 
 		 179 aa  186  1.0000000000000001e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.698381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1626  hypothetical protein  54.71 
 
 		 172 aa  184  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.25806  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6824  hypothetical protein  51.46 
 
 		 180 aa  184  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3140  hypothetical protein  54.02 
 
 		 182 aa  181  2e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1619  hypothetical protein  53.57 
 
 		 172 aa  179  1e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000184007 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0168  hypothetical protein  56.89 
 
 		 186 aa  171  2e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0586014  hitchhiker  0.00159646 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3194  hypothetical protein  52.63 
 
 		 175 aa  167  5e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0687  Methyltransferase type 12  53.37 
 
 		 208 aa  162  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.557107 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0249  hypothetical protein  46.06 
 
 		 178 aa  153  5e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5435  Methyltransferase type 12  36.22 
 
 		 202 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0879885  hitchhiker  0.0072084 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0361  Methyltransferase type 12  37.02 
 
 		 202 aa  94.4  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.839759  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1407  methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 196 aa  81.3  0.00000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0503  methyltransferase type 11  38.32 
 
 		 197 aa  80.9  0.00000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2277  methyltransferase type 11  35.19 
 
 		 250 aa  78.6  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0448979  normal  0.0702037 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2491  Methyltransferase type 11  32.68 
 
 		 195 aa  79  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.13744 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0183  methyltransferase type 11  34.8 
 
 		 199 aa  76.6  0.0000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0947468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0925  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 222 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1707  type III restriction protein res subunit  36.99 
 
 		 1287 aa  75.9  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.730362  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1409  hypothetical protein  29.8 
 
 		 192 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2747  Methyltransferase type 11  33.5 
 
 		 195 aa  73.2  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.718719 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2572  methyltransferase type 11  37.75 
 
 		 199 aa  72.8  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00406147  unclonable  0.0000000336172 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03040  methyltransferase family protein  29.61 
 
 		 202 aa  70.9  0.00000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1956  methyltransferase type 12  36.57 
 
 		 201 aa  69.3  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.177509  normal  0.0792402 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3491  methyltransferase type 11  31.91 
 
 		 364 aa  69.7  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4053  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase UbiE  30.81 
 
 		 207 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2822  hypothetical protein  33.89 
 
 		 200 aa  65.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.201237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0338  tellurite resistance protein-related protein  27.27 
 
 		 192 aa  66.2  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3205  Methyltransferase type 11  34.25 
 
 		 210 aa  63.9  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0233  hypothetical protein  31.19 
 
 		 209 aa  63.5  0.000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.385291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2524  methyltransferase type 12  25.13 
 
 		 195 aa  62.8  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.347392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1053  hypothetical protein  25.13 
 
 		 192 aa  62.4  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.19261  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1751  putative methyltransferase  33.12 
 
 		 222 aa  62  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2971  Generic methyltransferase  36.67 
 
 		 200 aa  62  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.294264  normal  0.814895 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35300  hypothetical protein  34.9 
 
 		 218 aa  61.6  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2771  Methyltransferase type 12  32.45 
 
 		 199 aa  61.6  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2539  methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 203 aa  60.8  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0779638  normal  0.34629 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0257  Methyltransferase type 11  31.76 
 
 		 208 aa  60.8  0.00000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00403327 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1916  hypothetical protein  31.68 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.193289  normal  0.326976 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6054  methyltransferase type 11  32.32 
 
 		 241 aa  60.5  0.00000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.202203  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0486  hypothetical protein  31.93 
 
 		 208 aa  60.1  0.00000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1544  Methyltransferase type 11  25.13 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.580406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6189  Methyltransferase type 11  35 
 
 		 220 aa  60.1  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1131  hypothetical protein  29.58 
 
 		 193 aa  59.3  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1032  methyltransferase type 11  32.9 
 
 		 208 aa  59.7  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.507472  normal  0.696143 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5190  hypothetical protein  30.18 
 
 		 207 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1089  hypothetical protein  29.58 
 
 		 193 aa  58.5  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1187  tellurite resistance related protein  26.83 
 
 		 214 aa  58.5  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.954275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0182  tellurite resistance related protein  26.83 
 
 		 214 aa  58.5  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041705 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02230  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  33.97 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0348  hypothetical protein  31.18 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.11153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2489  methyltransferase type 11  31.75 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.910654  normal  0.230216 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0572  methyltransferase type 11  28.21 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7236  Methyltransferase type 12  30.98 
 
 		 234 aa  55.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2548  thiopurine S-methyltransferase  28.23 
 
 		 213 aa  55.5  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.997429  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2940  methyltransferase type 11  29.83 
 
 		 224 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4338  methyltransferase type 11  30.69 
 
 		 208 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4718  hypothetical protein  26.35 
 
 		 165 aa  54.3  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.841461  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4719  hypothetical protein  24.59 
 
 		 163 aa  54.3  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.164513  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0981  Methyltransferase type 11  24.47 
 
 		 221 aa  53.9  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2366  type 11 methyltransferase  33.12 
 
 		 233 aa  53.9  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0147512 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4865  Methyltransferase type 11  34.75 
 
 		 218 aa  53.9  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.743669  normal  0.127304 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2296  Methyltransferase type 11  34.51 
 
 		 209 aa  53.9  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000023308  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0642  Methyltransferase type 12  32.45 
 
 		 227 aa  53.9  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.970055 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0885  methyltransferase, putative  36.19 
 
 		 214 aa  53.5  0.000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.784579  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5232  methyltransferase type 11  38.2 
 
 		 352 aa  52  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1080  Methyltransferase type 11  35.71 
 
 		 215 aa  52  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4121  hypothetical protein  26.83 
 
 		 167 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29120  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  32.24 
 
 		 203 aa  51.6  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1068  Methyltransferase type 12  26.23 
 
 		 222 aa  50.8  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1722  methyltransferase type 12  22.92 
 
 		 575 aa  50.1  0.00007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0792321 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0933  methyltransferase type 12  26.85 
 
 		 208 aa  50.1  0.00009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.275777  hitchhiker  0.00155248 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1383  thiopurine S-methyltransferase  35 
 
 		 198 aa  49.7  0.00009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0875719  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2456  methyltransferase type 11  31.06 
 
 		 217 aa  49.7  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.161151  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2514  methyltransferase type 11  27.85 
 
 		 208 aa  49.7  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0379622  normal  0.538818 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2989  methyltransferase type 11  30.56 
 
 		 232 aa  49.3  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000030187 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0619  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  39.58 
 
 		 236 aa  48.9  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00265376  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2249  methyltransferase type 12  27.81 
 
 		 217 aa  48.5  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.200806 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3262  tellurite resistance protein TehB  25.64 
 
 		 287 aa  48.5  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0181563  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4265  Methyltransferase type 11  30.07 
 
 		 215 aa  48.9  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00699595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2925  methyltransferase type 11  24.68 
 
 		 585 aa  48.5  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2634  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 211 aa  48.1  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0552  Methyltransferase type 11  31.93 
 
 		 247 aa  47.4  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.286054  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0712  Methyltransferase type 11  35.83 
 
 		 246 aa  47  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3431  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  31.3 
 
 		 403 aa  47  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5285  Methyltransferase type 11  29.91 
 
 		 220 aa  46.6  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2455  tellurite resistance protein TehB  24.67 
 
 		 298 aa  47  0.0008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1044  thiopurine S-methyltransferase  29.49 
 
 		 206 aa  46.6  0.0008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0180  Methyltransferase type 11  26.76 
 
 		 282 aa  46.6  0.0008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4274  methyltransferase type 11  30.88 
 
 		 243 aa  46.6  0.0009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.533221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4752  putative methionine biosynthesis protein MetW  25 
 
 		 541 aa  46.6  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.432574 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1090  hypothetical protein  25.2 
 
 		 201 aa  45.8  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2586  methyltransferase type 11  32 
 
 		 204 aa  46.2  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.322136  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00760  methyltransferase family protein  30.39 
 
 		 200 aa  46.6  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.226135 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00200  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  30.07 
 
 		 200 aa  46.2  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  34.78 
 
 		 274 aa  46.2  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>