134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2322 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_2322  endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 
929 aa  1840    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.451149  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1631  5'-Nucleotidase domain protein  51.8 
 
 
1652 aa  654    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.453464  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0825  5'-Nucleotidase domain protein  49.45 
 
 
1512 aa  636    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3091  5'-Nucleotidase domain protein  50.06 
 
 
1577 aa  649    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0677  5'-nucleotidase domain-containing protein  46.99 
 
 
1525 aa  632  1e-179  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.608053  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33530  predicted extracellular nuclease  48.36 
 
 
1591 aa  592  1e-168  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0542188  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0364  5'-Nucleotidase domain protein  49.4 
 
 
1577 aa  570  1e-161  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.381679  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03610  putative glutamate--cysteine ligase/putative amino acid ligase  44.23 
 
 
902 aa  550  1e-155  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.230337  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0697  5'-Nucleotidase domain protein  48.97 
 
 
1506 aa  495  9.999999999999999e-139  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.208594  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3284  extracellular nuclease-like protein  35.06 
 
 
795 aa  338  1.9999999999999998e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.512865  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3615  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.37 
 
 
868 aa  337  5.999999999999999e-91  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.705484  normal  0.0425486 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0972  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.76 
 
 
1266 aa  288  5e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.705534  normal  0.368107 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0758  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.65 
 
 
818 aa  270  1e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0350969 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1361  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.12 
 
 
573 aa  267  7e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.153605  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5031  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.5 
 
 
1075 aa  265  3e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0324828  normal  0.671967 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4989  putative endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.73 
 
 
848 aa  265  3e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.170324  normal  0.316341 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0828  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.37 
 
 
818 aa  264  6.999999999999999e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.182782 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1201  PKD domain-containing protein  32.69 
 
 
780 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1104  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.93 
 
 
601 aa  254  4.0000000000000004e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.604194 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0110  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.01 
 
 
586 aa  253  2e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.738543  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0358  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.21 
 
 
826 aa  252  2e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2828  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.06 
 
 
1641 aa  250  9e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13340  extracellular nuclease  31.5 
 
 
780 aa  249  2e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0905495  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5193  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.73 
 
 
603 aa  249  2e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.79221  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2774  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.89 
 
 
1641 aa  248  3e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0508724  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  32.32 
 
 
2667 aa  248  4e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1033  endonuclease I  34.54 
 
 
1503 aa  247  8e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.8795  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2634  extracellular ribonuclease/nuclease fusion protein  30.77 
 
 
1310 aa  246  1.9999999999999999e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3357  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.75 
 
 
604 aa  244  6e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4728  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.8 
 
 
2346 aa  243  1e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1622  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.82 
 
 
944 aa  242  2e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1701  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.84 
 
 
1148 aa  242  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.427243  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0270  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.54 
 
 
641 aa  242  2.9999999999999997e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.527105  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1683  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.84 
 
 
1148 aa  240  8e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5194  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.69 
 
 
604 aa  240  9e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.337928  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1534  PKD domain-containing protein  30.08 
 
 
948 aa  239  2e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.97112  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01224  extracellular ribonuclease/nuclease fusion protein  31.12 
 
 
1346 aa  239  2e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1477  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.83 
 
 
947 aa  238  4e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4713  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.43 
 
 
1284 aa  237  9e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.814549 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1601  PKD domain-containing protein  29.96 
 
 
948 aa  234  4.0000000000000004e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.156806 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2637  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  35.79 
 
 
624 aa  234  8.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.541694  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2498  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  35.79 
 
 
624 aa  234  8.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.209723  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0259  putative extracellular nuclease  35.79 
 
 
624 aa  233  1e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2760  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.59 
 
 
604 aa  233  1e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1440  putative extracellular nuclease  35.79 
 
 
624 aa  233  1e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1637  putative extracellular nuclease  35.79 
 
 
624 aa  233  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0292  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  35.79 
 
 
624 aa  233  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.262594  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2286  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.23 
 
 
621 aa  233  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.127089 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1707  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28 
 
 
955 aa  232  3e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1911  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.08 
 
 
940 aa  231  5e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000962851  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1811  PKD domain-containing protein  29.94 
 
 
944 aa  231  6e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1844  extracellular nuclease, putative  29.5 
 
 
948 aa  230  7e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4098  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.27 
 
 
604 aa  230  7e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.535753 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4749  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.27 
 
 
604 aa  230  9e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3418  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.27 
 
 
604 aa  230  9e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1595  PKD domain-containing protein  29.85 
 
 
948 aa  229  1e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.230765  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0532  extracellular nuclease, putative  35.59 
 
 
622 aa  229  2e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0419  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.99 
 
 
1052 aa  229  2e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0131268  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1858  PKD domain-containing protein  29.46 
 
 
944 aa  228  4e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  32.44 
 
 
2775 aa  228  6e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2467  PKD domain containing protein  29.82 
 
 
944 aa  228  6e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.183397  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1819  PKD domain-containing protein  29.58 
 
 
944 aa  225  2e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4327  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.58 
 
 
653 aa  223  9.999999999999999e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.240387  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2272  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.19 
 
 
942 aa  220  7.999999999999999e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000211243  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2372  5'-Nucleotidase domain protein  30.95 
 
 
2796 aa  218  4e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.308667 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4553  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35 
 
 
620 aa  218  5e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3810  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35 
 
 
599 aa  217  8e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.193506 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3714  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35 
 
 
620 aa  216  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.495775 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2170  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.78 
 
 
945 aa  215  3.9999999999999995e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.160261 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3711  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.35 
 
 
600 aa  213  2e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.187879  normal  0.194712 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5536  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.68 
 
 
627 aa  211  5e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.8971  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1568  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.26 
 
 
942 aa  207  6e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.10217  normal  0.0647375 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0934  extracellular nuclease  35.28 
 
 
514 aa  200  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03816  nuclease  32.85 
 
 
572 aa  198  3e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00081  nuclease  28.42 
 
 
982 aa  191  4e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4013  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  45.48 
 
 
810 aa  189  2e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.48932 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002273  predicted extracellular nuclease  29.92 
 
 
984 aa  188  5e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3009  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.8 
 
 
876 aa  187  8e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00148055  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3944  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.77 
 
 
892 aa  187  9e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000110843  normal  0.791963 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2843  extracellular nuclease-like  30.61 
 
 
945 aa  182  4e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0894144  normal  0.737872 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2906  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.33 
 
 
873 aa  181  5.999999999999999e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.435339  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5343  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  44.31 
 
 
940 aa  181  8e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.799398 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01770  predicted extracellular nuclease  30 
 
 
863 aa  179  2e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.609758  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2945  extracellular nuclease  28.22 
 
 
865 aa  178  5e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.172583 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15630  predicted extracellular nuclease  43.51 
 
 
802 aa  176  1.9999999999999998e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.35443  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3886  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.69 
 
 
894 aa  175  3.9999999999999995e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000584422 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1364  putative exported nuclease  28.45 
 
 
890 aa  173  1e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.587865  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3718  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.09 
 
 
870 aa  172  2e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3193  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.87 
 
 
871 aa  171  5e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00309211  normal  0.0976082 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1737  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.46 
 
 
570 aa  169  2e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.979917  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0890  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.52 
 
 
870 aa  169  2e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.298934  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3281  putative endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.41 
 
 
1123 aa  167  9e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.310372  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1932  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  46.86 
 
 
802 aa  166  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3595  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.42 
 
 
870 aa  166  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0433948  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3397  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.31 
 
 
870 aa  166  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00146831  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2198  hypothetical protein  27.84 
 
 
869 aa  164  5.0000000000000005e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3472  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.31 
 
 
870 aa  164  6e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0137942  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3033  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.89 
 
 
870 aa  159  3e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.441038  normal  0.600162 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0201  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.09 
 
 
481 aa  158  4e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.418254  normal  0.692055 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0904  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.45 
 
 
870 aa  157  9e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00895191  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>