More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2316 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1033  beta-lactamase domain protein  68.21 
 
 		 561 aa  786    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.76638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1390  beta-lactamase domain-containing protein  63.52 
 
 		 562 aa  705    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2169  hypothetical protein  67.83 
 
 		 561 aa  720    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1081  beta-lactamase domain-containing protein  70.09 
 
 		 561 aa  748    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0177081  hitchhiker  0.00575165 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29160  predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  59.75 
 
 		 561 aa  687    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.813951  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1150  hypothetical protein  57.04 
 
 		 675 aa  653    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.920604 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1763  beta-lactamase domain protein  60.79 
 
 		 650 aa  677    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3309  beta-lactamase domain protein  69.04 
 
 		 561 aa  781    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0174304  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0792  metallo-beta-lactamase family hydrolase  66.18 
 
 		 561 aa  715    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.135441  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1348  beta-lactamase domain-containing protein  63.7 
 
 		 562 aa  707    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0621121  hitchhiker  0.000323796 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2242  beta-lactamase domain protein  59.21 
 
 		 580 aa  658    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.138314  normal  0.621627 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2465  beta-lactamase domain protein  71.45 
 
 		 561 aa  792    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.867081  normal  0.655144 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1230  beta-lactamase domain protein  70.52 
 
 		 561 aa  808    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.786128  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1530  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  70.69 
 
 		 561 aa  775    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.712095 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3543  beta-lactamase-like  66.42 
 
 		 561 aa  735    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.132705  normal  0.131405 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4272  beta-lactamase domain-containing protein  61.57 
 
 		 568 aa  694    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09390  predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  65.36 
 
 		 560 aa  704    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.293183  normal  0.492875 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25240  predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  64.61 
 
 		 565 aa  715    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1200  beta-lactamase domain-containing protein  68.26 
 
 		 561 aa  755    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.582889  normal  0.255924 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1480  beta-lactamase domain protein  71.28 
 
 		 561 aa  774    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0694172  normal  0.195502 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3943  beta-lactamase domain protein  61.68 
 
 		 566 aa  691    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.142082  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0950  putative metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  58.05 
 
 		 616 aa  661    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07160  beta-lactamase domain protein  65.35 
 
 		 561 aa  735    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0422873  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1789  beta-lactamase domain protein  65.36 
 
 		 561 aa  729    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.114581  normal  0.681062 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5806  beta-lactamase domain protein  63.29 
 
 		 559 aa  695    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1455  beta-lactamase domain protein  66.31 
 
 		 563 aa  738    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000013396 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0647  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  68.21 
 
 		 561 aa  767    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06070  predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  62.12 
 
 		 556 aa  703    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.258358  normal  0.112018 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1453  beta-lactamase domain-containing protein  66.43 
 
 		 563 aa  750    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2191  beta-lactamase domain protein  62.45 
 
 		 595 aa  695    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10470  predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  67.38 
 
 		 564 aa  739    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.797206  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1502  beta-lactamase domain-containing protein  68.68 
 
 		 561 aa  745    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.0000603701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2316  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 561 aa  1127    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.175765  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7858  beta-lactamase domain protein  67.97 
 
 		 561 aa  759    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.627673 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2117  beta-lactamase-like protein  56.12 
 
 		 558 aa  604  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2104  beta-lactamase domain-containing protein  56.12 
 
 		 558 aa  604  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.739055  normal  0.176892 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2163  beta-lactamase domain-containing protein  56.12 
 
 		 558 aa  604  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.142592  normal  0.270544 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2388  beta-lactamase domain-containing protein  55.4 
 
 		 558 aa  602  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.801347  normal  0.0151024 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12765  hypothetical protein  55.04 
 
 		 558 aa  592  1e-168  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.868415 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3999  beta-lactamase domain-containing protein  54.69 
 
 		 558 aa  583  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.818404  normal  0.115324 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4393  beta-lactamase domain-containing protein  46.31 
 
 		 558 aa  500  1e-140  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0728616  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0366  hypothetical protein  46.18 
 
 		 558 aa  501  1e-140  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0664287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1938  beta-lactamase domain-containing protein  45.07 
 
 		 554 aa  497  1e-139  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1268  metallo-beta-lactamase family protein  44.06 
 
 		 553 aa  492  9.999999999999999e-139  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000954754  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4057  beta-lactamase domain protein  45.19 
 
 		 558 aa  483  1e-135  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3163  beta-lactamase domain protein  44.16 
 
 		 554 aa  479  1e-134  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0947  beta-lactamase domain-containing protein  44.3 
 
 		 554 aa  481  1e-134  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3971  beta-lactamase domain protein  45.37 
 
 		 558 aa  481  1e-134  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.313503  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3657  beta-lactamase domain protein  42.78 
 
 		 554 aa  477  1e-133  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000145039  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1069  hypothetical protein  43.19 
 
 		 555 aa  478  1e-133  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000100194  normal  0.0563275 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1772  beta-lactamase domain protein  44.34 
 
 		 555 aa  476  1e-133  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0198506  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3113  metallo-beta-lactamase family protein  46.15 
 
 		 533 aa  473  1e-132  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1625  beta-lactamase domain protein  43.29 
 
 		 590 aa  474  1e-132  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000210591  hitchhiker  0.00000143957 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3415  beta-lactamase domain protein  45.89 
 
 		 593 aa  473  1e-132  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1816  beta-lactamase domain-containing protein  42.08 
 
 		 559 aa  474  1e-132  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000137497  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0383  beta-lactamase domain-containing protein  46.82 
 
 		 569 aa  473  1e-132  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07540  predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  42.99 
 
 		 631 aa  470  1.0000000000000001e-131  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000160452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08700  beta-lactamase domain protein  43.09 
 
 		 558 aa  471  1.0000000000000001e-131  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000465654  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1494  beta-lactamase domain-containing protein  41.79 
 
 		 560 aa  462  1e-129  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000870726  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3238  beta-lactamase domain protein  44.02 
 
 		 556 aa  459  9.999999999999999e-129  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.015572  normal  0.303561 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2294  beta-lactamase domain-containing protein  41.62 
 
 		 618 aa  460  9.999999999999999e-129  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1302  hypothetical protein  43.25 
 
 		 555 aa  458  1e-127  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0627  beta-lactamase domain protein  43.33 
 
 		 555 aa  455  1e-127  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.223093  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1460  beta-lactamase domain protein  42.7 
 
 		 551 aa  450  1e-125  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000017363  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0179  beta-lactamase domain protein  42.15 
 
 		 591 aa  450  1e-125  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1420  hypothetical protein  42.41 
 
 		 547 aa  450  1e-125  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.128957  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4078  beta-lactamase domain-containing protein  43.96 
 
 		 561 aa  450  1e-125  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35741  normal  0.385079 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0645  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  42.88 
 
 		 564 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000101529  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0875  beta-lactamase domain-containing protein  43.24 
 
 		 561 aa  447  1.0000000000000001e-124  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0942136  normal  0.212553 
 
 
-
 
NC_002936  DET0438  metallo-beta-lactamase family protein  42.29 
 
 		 551 aa  444  1e-123  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.386369  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_380  metallo-beta-lactamase  42.11 
 
 		 551 aa  443  1e-123  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1678  beta-lactamase domain protein  41.98 
 
 		 553 aa  445  1e-123  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10660  predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  41.79 
 
 		 644 aa  444  1e-123  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000341022  unclonable  0.00000000210768 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0415  beta-lactamase domain-containing protein  42.11 
 
 		 551 aa  444  1e-123  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.223724  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0787  beta-lactamase domain protein  39.23 
 
 		 554 aa  440  9.999999999999999e-123  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000129126  normal  0.323008 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2028  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  41.24 
 
 		 555 aa  441  9.999999999999999e-123  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2447  beta-lactamase domain protein  41.49 
 
 		 557 aa  439  9.999999999999999e-123  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1460  beta-lactamase domain protein  40 
 
 		 566 aa  440  9.999999999999999e-123  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4416  beta-lactamase domain-containing protein  41.03 
 
 		 569 aa  439  9.999999999999999e-123  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1745  RNA-metabolizing metallo-beta-lactamase family protein  41.06 
 
 		 555 aa  436  1e-121  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3833  metallo-beta-lactamase family protein  40.69 
 
 		 556 aa  433  1e-120  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000419922  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3809  metallo-beta-lactamase family protein  40.69 
 
 		 556 aa  433  1e-120  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2993599999999999e-37 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3648  metallo-beta-lactamase family protein  40.69 
 
 		 556 aa  433  1e-120  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3538  metallo-beta-lactamase family protein  40.88 
 
 		 556 aa  434  1e-120  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0178756  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3556  metallo-beta-lactamase family protein  40.69 
 
 		 556 aa  433  1e-120  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3567  beta-lactamase domain-containing protein  40.88 
 
 		 556 aa  434  1e-120  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00558369  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3933  metallo-beta-lactamase family protein  40.69 
 
 		 556 aa  433  1e-120  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00612119  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3845  metallo-beta-lactamase family protein  40.69 
 
 		 556 aa  433  1e-120  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000592634  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2092  beta-lactamase-like  41.37 
 
 		 556 aa  435  1e-120  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.471204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1597  beta-lactamase domain-containing protein  43.19 
 
 		 561 aa  433  1e-120  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2449  beta-lactamase domain-containing protein  40.33 
 
 		 583 aa  429  1e-119  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0351233  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0941  beta-lactamase domain protein  38.94 
 
 		 560 aa  429  1e-119  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1403  metallo-beta-lactamase family protein  40.51 
 
 		 556 aa  431  1e-119  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0055609  hitchhiker  0.000000000000158477 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3896  metallo-beta-lactamase family protein  40.69 
 
 		 556 aa  432  1e-119  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0341705  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3719  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  40.48 
 
 		 555 aa  424  1e-117  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.998295  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3735  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  40.48 
 
 		 555 aa  424  1e-117  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1150  beta-lactamase domain protein  38.21 
 
 		 548 aa  425  1e-117  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3804  beta-lactamase domain-containing protein  40.66 
 
 		 555 aa  425  1e-117  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.199247  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4190  hypothetical protein  40.48 
 
 		 555 aa  424  1e-117  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.491645  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4097  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  40.48 
 
 		 555 aa  424  1e-117  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000534796  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>