267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2312 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_2312  dihydrofolate reductase  100 
 
 
160 aa  320  6e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.312727  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0096  Dihydrofolate reductase  54.55 
 
 
161 aa  149  2e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2039  dihydrofolate reductase  47.97 
 
 
167 aa  145  2e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.570547  normal  0.482414 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1090  dihydrofolate reductase  56.64 
 
 
163 aa  145  2e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0523811 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4526  dihydrofolate reductase  54.93 
 
 
166 aa  144  4e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.85477  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1051  Dihydrofolate reductase  44.97 
 
 
163 aa  143  8e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2886  Dihydrofolate reductase  51.75 
 
 
166 aa  141  3e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1259  dihydrofolate reductase  49.68 
 
 
166 aa  140  6e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000117579 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2811  Dihydrofolate reductase  48.43 
 
 
292 aa  139  1e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  6.27481e-07  hitchhiker  3.05943e-05 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2431  dihydrofolate reductase  48.37 
 
 
171 aa  139  2e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2781  Dihydrofolate reductase  50.68 
 
 
166 aa  138  3e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.258533 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0423  dihydrofolate reductase  51.06 
 
 
166 aa  137  5e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0200309 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0700  dihydrofolate reductase region  50.7 
 
 
163 aa  137  5e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.694361  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2571  dihydrofolate reductase  47.95 
 
 
195 aa  136  1e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.115778  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2659  dihydrofolate reductase  49.65 
 
 
166 aa  135  2e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.691401 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2729  dihydrofolate reductase  49.66 
 
 
178 aa  135  3e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48110  Dihydrofolate reductase  46.94 
 
 
171 aa  134  4e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000576537  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2569  dihydrofolate reductase  47.33 
 
 
166 aa  134  7e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.858438  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0914  dihydrofolate reductase  46.67 
 
 
166 aa  133  1e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1963  dihydrofolate reductase  40.25 
 
 
183 aa  131  4e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0972  dihydrofolate reductase  47.1 
 
 
160 aa  131  4e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.415398  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3353  dihydrofolate reductase  48.98 
 
 
179 aa  131  4e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0397175 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3318  Dihydrofolate reductase  47.1 
 
 
160 aa  130  8e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1582  Dihydrofolate reductase  38.56 
 
 
162 aa  129  1e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  2.74022e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2922  dihydrofolate reductase  42.67 
 
 
160 aa  129  2e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  3.8363e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1074  dihydrofolate reductase  45.65 
 
 
160 aa  128  3e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0303057  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2350  dihydrofolate reductase region  47.62 
 
 
178 aa  128  3e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0899  Dihydrofolate reductase  47.22 
 
 
177 aa  128  3e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1041  dihydrofolate reductase  45.65 
 
 
160 aa  128  3e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0691593  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3214  dihydrofolate reductase  45.65 
 
 
160 aa  128  4e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.871101  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3120  dihydrofolate reductase  45.65 
 
 
160 aa  128  4e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2037  dihydrofolate reductase  48.3 
 
 
179 aa  128  4e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.750289  normal  0.473794 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1421  Dihydrofolate reductase  42.96 
 
 
161 aa  127  4e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.491047 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3646  dihydrofolate reductase  42.41 
 
 
160 aa  127  5e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1653  Dihydrofolate reductase  44.22 
 
 
165 aa  127  6e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1640  dihydrofolate reductase  39.72 
 
 
162 aa  127  8e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00601598  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0351  dihydrofolate reductase  45.89 
 
 
171 aa  127  8e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.146405  normal  0.312334 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0946  dihydrofolate reductase oxidoreductase protein  47.18 
 
 
167 aa  127  9e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0266319 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2824  dihydrofolate reductase  42.66 
 
 
160 aa  127  9e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1855  Dihydrofolate reductase  43.05 
 
 
171 aa  126  1e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.513687  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0914  dihydrofolate reductase  43.17 
 
 
167 aa  126  1e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1420  dihydrofolate reductase  44.87 
 
 
178 aa  126  1e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.112898  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1058  dihydrofolate reductase  43.17 
 
 
167 aa  126  1e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0984  dihydrofolate reductase  44.2 
 
 
160 aa  125  2e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.69665  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1729  dihydrofolate reductase  46.21 
 
 
198 aa  125  2e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000733059 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2748  Dihydrofolate reductase  43.75 
 
 
162 aa  124  4e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0888  Dihydrofolate reductase  45.77 
 
 
167 aa  124  4e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.733276  normal  0.450678 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0932  dihydrofolate reductase  44.53 
 
 
163 aa  124  5e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1009  dihydrofolate reductase  45.19 
 
 
160 aa  124  5e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.415728  hitchhiker  2.43395e-05 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2267  dihydrofolate reductase  39.01 
 
 
162 aa  124  6e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00982117  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0900  dihydrofolate reductase  44.2 
 
 
160 aa  124  6e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.131279  normal  0.732147 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3786  dihydrofolate reductase  47.95 
 
 
162 aa  124  7e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.852274  normal  0.1214 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2542  Dihydrofolate reductase  45.39 
 
 
172 aa  123  8e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.929799 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0959  dihydrofolate reductase  41.84 
 
 
160 aa  123  9e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1926  dihydrofolate reductase  48.48 
 
 
171 aa  123  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000147298  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2264  dihydrofolate reductase  39.01 
 
 
162 aa  123  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.24191e-31 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2729  dihydrofolate reductase  45.71 
 
 
172 aa  123  1e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0802679  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4209  dihydrofolate reductase  44.22 
 
 
176 aa  123  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2021  dihydrofolate reductase  39.01 
 
 
162 aa  123  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2021  dihydrofolate reductase  39.01 
 
 
162 aa  123  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.981299  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2083  dihydrofolate reductase  39.01 
 
 
162 aa  123  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.25981  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2062  dihydrofolate reductase  39.01 
 
 
162 aa  123  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000278641  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2237  dihydrofolate reductase  39.01 
 
 
162 aa  123  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.044685  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2349  dihydrofolate reductase  39.01 
 
 
162 aa  123  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  1.30652e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0603  Dihydrofolate reductase  48.53 
 
 
174 aa  123  1e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.052544 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0817  Dihydrofolate reductase  45.07 
 
 
167 aa  122  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2947  dihydrofolate reductase  47.92 
 
 
161 aa  123  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.631471  normal  0.0218136 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0579  dihydrofolate reductase  44.76 
 
 
163 aa  122  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4737  dihydrofolate reductase  42.95 
 
 
170 aa  122  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.153856 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3104  dihydrofolate reductase  38.3 
 
 
162 aa  122  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.172131  hitchhiker  1.00648e-11 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1793  dihydrofolate reductase  46.21 
 
 
174 aa  122  3e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.928797  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0096  dihydrofolate reductase  39.16 
 
 
161 aa  121  3e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.987213  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2090  dihydrofolate reductase  39.16 
 
 
161 aa  121  3e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.475399  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2220  dihydrofolate reductase  38.3 
 
 
162 aa  121  4e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.151366  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03728  dihydrofolate reductase type I, trimethoprim resistance  40.54 
 
 
167 aa  121  4e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.794995  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0874  dihydrofolate reductase  41.96 
 
 
160 aa  121  5e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0789491  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2025  dihydrofolate reductase  46.79 
 
 
173 aa  120  6e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.517984  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6452  Dihydrofolate reductase  38.73 
 
 
164 aa  120  7e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.816768  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1750  dihydrofolate reductase  44.06 
 
 
167 aa  120  9e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.175283  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2048  dihydrofolate reductase  52.35 
 
 
164 aa  120  9e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0857  dihydrofolate reductase  42.96 
 
 
160 aa  120  1e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.535024  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0437  dihydrofolate reductase  42.28 
 
 
170 aa  119  1e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0925  dihydrofolate reductase  42.45 
 
 
169 aa  119  1e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4006  Dihydrofolate reductase  48.55 
 
 
180 aa  119  1e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.813687  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0571  dihydrofolate reductase  46.9 
 
 
160 aa  120  1e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13348  dihydrofolate reductase  39.31 
 
 
160 aa  119  2e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.704546  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2988  Dihydrofolate reductase  42.17 
 
 
183 aa  119  2e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.302882  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1591  Dihydrofolate reductase  45.77 
 
 
164 aa  119  2e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00889611  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3741  dihydrofolate reductase  44.36 
 
 
169 aa  119  2e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.674026  hitchhiker  0.000322893 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1045  dihydrofolate reductase  39.04 
 
 
163 aa  119  2e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.46602  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6098  dihydrofolate reductase  41.89 
 
 
170 aa  119  2e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4505  dihydrofolate reductase  39.16 
 
 
170 aa  118  3e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.13858  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3084  dihydrofolate reductase  43.7 
 
 
160 aa  119  3e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00805  hypothetical protein  40.82 
 
 
159 aa  118  3e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1398  dihydrofolate reductase  44.14 
 
 
172 aa  118  3e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2773  dihydrofolate reductase  48.63 
 
 
166 aa  117  4e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0219199 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1020  dihydrofolate reductase  42.66 
 
 
166 aa  118  4e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.831665  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0189  dihydrofolate reductase  38.03 
 
 
161 aa  117  6e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0443  dihydrofolate reductase  41.5 
 
 
168 aa  117  6e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1115  Dihydrofolate reductase  46.31 
 
 
164 aa  117  7e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>