28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2243 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2243  ATP-binding protein  100 
 
 		 512 aa  1040    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0687  ATP-binding protein  59.88 
 
 		 502 aa  581  1e-164  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4709  hypothetical protein  52.85 
 
 		 511 aa  525  1e-148  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0831911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1572  ATP-binding protein  53.39 
 
 		 496 aa  523  1e-147  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.160192  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5435  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  38.66 
 
 		 515 aa  301  2e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.62909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8941  hypothetical protein  38.49 
 
 		 505 aa  300  4e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.57395  normal  0.334134 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00150  hypothetical protein  31.35 
 
 		 495 aa  149  9e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06770  hypothetical protein  31.58 
 
 		 495 aa  148  2.0000000000000003e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0034  Type IV secretory pathway VirB4 components-like  31.87 
 
 		 711 aa  145  1e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.694512 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5522  hypothetical protein  29.71 
 
 		 516 aa  143  7e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.349353  normal  0.675999 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0805  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  30.86 
 
 		 495 aa  143  8e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7298  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  31.55 
 
 		 696 aa  142  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.910736  normal  0.0433123 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0444  hypothetical protein  28.54 
 
 		 509 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06480  type IV secretory pathway VirB4 component-like protein  29.48 
 
 		 500 aa  129  1.0000000000000001e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.132231  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4215  hypothetical protein  28.88 
 
 		 518 aa  97.1  7e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4502  hypothetical protein  28.02 
 
 		 528 aa  94.4  5e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.689738  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0368  ATPase  25.99 
 
 		 532 aa  92.4  2e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0513969  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4277  hypothetical protein  25.76 
 
 		 539 aa  92.4  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4559  hypothetical protein  27.55 
 
 		 485 aa  80.9  0.00000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.168528 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1342  ATP-binding protein  27.04 
 
 		 461 aa  77  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4943  hypothetical protein  24.23 
 
 		 624 aa  76.3  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0731  AAA ATPase  25.31 
 
 		 569 aa  69.7  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0912969  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8298  hypothetical protein  24.73 
 
 		 575 aa  63.9  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.237745 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3322  putative ATP-binding protein  24.68 
 
 		 480 aa  60.8  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.540198 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2528  AAA ATPase  23.41 
 
 		 621 aa  55.8  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0301  hypothetical protein  24.43 
 
 		 818 aa  45.4  0.002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0733022  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6849  type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  27.82 
 
 		 608 aa  43.9  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0610151  normal  0.925039 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1816  truncated type IV secretory pathway VirB4 component protein  27.48 
 
 		 668 aa  43.9  0.007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>