More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2215 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2215  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 111 aa  222  1e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3902  regulatory protein, ArsR  71.57 
 
 		 109 aa  150  5e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.894762 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3317  transcriptional regulator, TrmB  66.67 
 
 		 108 aa  137  3.9999999999999997e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4310  transcriptional regulator, TrmB  65.66 
 
 		 118 aa  136  1e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0416057  normal  0.35783 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4551  regulatory protein ArsR  64.81 
 
 		 110 aa  136  1e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4542  regulatory protein ArsR  72.22 
 
 		 111 aa  134  4e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.436444 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3937  regulatory protein, ArsR  64.71 
 
 		 109 aa  134  4e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5082  transcriptional regulator, ArsR family  74.16 
 
 		 107 aa  134  5e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.657053 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4189  ArsR family transcriptional regulator  61.68 
 
 		 117 aa  134  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.519791  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4255  ArsR family transcriptional regulator  61.68 
 
 		 117 aa  134  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316159  normal  0.071217 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4416  ArsR family transcriptional regulator  61.68 
 
 		 117 aa  134  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.381445  normal  0.906592 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4237  ArsR family transcriptional regulator  74.73 
 
 		 113 aa  132  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0889801  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4571  regulatory protein ArsR  72.22 
 
 		 168 aa  130  3.9999999999999996e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11840  transcriptional regulator, ArsR family  63 
 
 		 119 aa  127  4.0000000000000003e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2599  ArsR family transcriptional regulator  63.64 
 
 		 151 aa  125  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.341777 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4982  putative transcriptional regulator, ArsR family  57.94 
 
 		 111 aa  123  8.000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2717  ArsR family transcriptional regulator  56.07 
 
 		 111 aa  122  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4445  ArsR family transcriptional regulator  61.29 
 
 		 125 aa  115  3e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.586673  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20650  transcriptional regulator, ArsR family  60.42 
 
 		 119 aa  114  3e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25700  transcriptional regulator, ArsR family  61.46 
 
 		 119 aa  114  5e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0349  transcriptional regulator, ArsR family  57.14 
 
 		 119 aa  114  6e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2439  ArsR family transcriptional regulator  69.23 
 
 		 134 aa  113  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.561619  normal  0.883646 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0539  transcriptional regulator, ArsR family  58.06 
 
 		 124 aa  111  4.0000000000000004e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22920  transcriptional regulator, ArsR family  58.06 
 
 		 119 aa  108  3e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0777  transcriptional regulator, ArsR family  55.88 
 
 		 119 aa  107  5e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12026  transcriptional regulator  58.24 
 
 		 118 aa  105  2e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000227381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2299  ArsR family transcriptional regulator  58.14 
 
 		 115 aa  100  6e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0526  transcriptional regulator, ArsR family  56.18 
 
 		 112 aa  96.3  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.608045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5742  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 136 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3896  ArsR family transcriptional regulator  43.68 
 
 		 118 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3904  ArsR family transcriptional regulator  43.68 
 
 		 118 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.53534 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19620  transcriptional regulator, ArsR family  38.04 
 
 		 127 aa  60.5  0.000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00139009  normal  0.0620554 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5393  transcriptional regulator, ArsR family  38.27 
 
 		 120 aa  60.1  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497989 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2653  regulatory protein ArsR  35.71 
 
 		 129 aa  59.7  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.696132  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25840  transcriptional regulator, ArsR family  44.62 
 
 		 142 aa  60.1  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3640  regulatory protein, ArsR  36.84 
 
 		 134 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3359  ArsR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 107 aa  59.3  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0605  regulatory protein, ArsR  40.79 
 
 		 129 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.208863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3178  regulatory protein, ArsR  40.79 
 
 		 129 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.150405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1730  transcriptional regulator, ArsR family  37.65 
 
 		 113 aa  58.2  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3243  regulatory protein, ArsR  35.79 
 
 		 135 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0422  transcriptional regulator, ArsR family  39.44 
 
 		 121 aa  58.2  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2077  transcriptional regulator, ArsR family  39.53 
 
 		 122 aa  57.8  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2609  regulatory protein ArsR  41.1 
 
 		 127 aa  57.8  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2650  regulatory protein ArsR  37.33 
 
 		 125 aa  57.8  0.00000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2865  regulatory protein, ArsR  38.04 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2331  ArsR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 133 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5293  ArsR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 127 aa  57  0.00000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1516  transcriptional regulator, ArsR family  40.48 
 
 		 399 aa  56.2  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5370  regulatory protein, ArsR  40.74 
 
 		 127 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.56529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1568  ArsR family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00153678  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2463  transcriptional regulator, TrmB  36.78 
 
 		 110 aa  55.5  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.473489  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5055  transcriptional regulator, ArsR family  43.75 
 
 		 124 aa  55.1  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5371  transcriptional regulator, TrmB  35.96 
 
 		 129 aa  54.7  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4431  ArsR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 128 aa  54.7  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.653801  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5412  regulatory protein, ArsR  42.47 
 
 		 125 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0257152 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5392  regulatory protein, ArsR  42.47 
 
 		 125 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0506  regulatory protein, ArsR  42.47 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.156017  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0470  transcriptional regulator, ArsR family  34 
 
 		 134 aa  54.3  0.0000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2205  ArsR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 115 aa  53.9  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.273096  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4475  ArsR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 124 aa  53.9  0.0000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4306  ArsR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 124 aa  53.9  0.0000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4206  ArsR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 124 aa  53.9  0.0000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.938952  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0248  regulatory protein ArsR  40.79 
 
 		 109 aa  53.9  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0065  ArsR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 99 aa  53.5  0.0000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.487326 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1371  ArsR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 117 aa  53.9  0.0000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1155  ArsR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 122 aa  53.5  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1005  ArsR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 116 aa  53.5  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0103223  normal  0.0233709 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1770  ArsR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 125 aa  53.5  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83595  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3967  ArsR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 116 aa  53.1  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.45892  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2988  transcriptional regulator, ArsR family  37.66 
 
 		 106 aa  51.2  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3867  regulatory protein ArsR  44.44 
 
 		 118 aa  50.1  0.000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.248206  normal  0.706318 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2300  transcriptional regulator, ArsR family  35.16 
 
 		 99 aa  49.7  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.290076  hitchhiker  0.000322902 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2848  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 118 aa  49.7  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000188384  normal  0.0300767 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5219  transcriptional regulator, ArsR family  38.96 
 
 		 118 aa  50.1  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0245  transcriptional regulator, ArsR family  34.85 
 
 		 114 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.13897  normal  0.794809 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2928  transcriptional regulator, TrmB  40.26 
 
 		 130 aa  49.7  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14670  transcriptional regulator, ArsR family  34.52 
 
 		 132 aa  48.9  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.475992  normal  0.15189 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3050  transcriptional regulator, ArsR family  38.71 
 
 		 106 aa  49.3  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.157425 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1535  ArsR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0449302 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3446  ArsR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 120 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196879  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3509  ArsR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 120 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.800819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2507  transcriptional regulator, ArsR family  42.25 
 
 		 245 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.539832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3457  ArsR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 120 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.446106  normal  0.218482 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3225  regulatory protein ArsR  30.68 
 
 		 104 aa  48.5  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.151023  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0241  ArsR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 119 aa  48.5  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000436096 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3634  regulatory protein, ArsR  38.16 
 
 		 94 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4480  transcriptional regulator, ArsR family  47.76 
 
 		 152 aa  48.5  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0872  ArsR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 114 aa  48.1  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2209  ArsR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 130 aa  48.1  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5506  regulatory protein, ArsR  34.83 
 
 		 107 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0473729 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1667  ArsR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 117 aa  47.8  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.214813  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1057  transcriptional regulator, ArsR family  47.27 
 
 		 111 aa  47.8  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.543137 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1262  transcriptional regulator, ArsR family  37.04 
 
 		 133 aa  47.8  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2471  regulatory protein ArsR  35.44 
 
 		 113 aa  47.8  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.411264  normal  0.730529 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0344  transcriptional regulator, ArsR family  45.59 
 
 		 118 aa  47.4  0.00006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0509  ArsR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 125 aa  47.4  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12384  ArsR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 135 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2195  ArsR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 100 aa  47.4  0.00007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000138755  normal  0.370986 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1372  ArsR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 109 aa  47.4  0.00007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.792915 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>