More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2194 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2194  regulatory protein, TetR  100 
 
 		 218 aa  443  1e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1510  transcriptional regulator, TetR family  58.37 
 
 		 240 aa  212  2.9999999999999995e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.116924  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1543  TetR family transcriptional regulator  47.66 
 
 		 236 aa  205  3e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.470889 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1559  transcriptional regulator, TetR family  55.21 
 
 		 221 aa  196  2.0000000000000003e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.286529  normal  0.011068 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2443  transcriptional regulator, TetR family  54.79 
 
 		 229 aa  186  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0220439  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2186  regulatory protein, TetR  47.64 
 
 		 237 aa  169  4e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3849  transcriptional regulator, TetR family  42.29 
 
 		 211 aa  162  4.0000000000000004e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.782429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3736  transcriptional regulator, TetR family  47.85 
 
 		 210 aa  161  7e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1059  TetR family transcriptional regulator  42.16 
 
 		 217 aa  151  8.999999999999999e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4743  transcriptional regulator, TetR family  40.74 
 
 		 213 aa  144  8.000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.832036  normal  0.727268 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5792  transcriptional regulator, TetR family  43.52 
 
 		 216 aa  142  5e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5106  putative transcriptional regulator, TetR family  45.51 
 
 		 229 aa  139  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0586714 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1060  TetR family transcriptional regulator  37.57 
 
 		 227 aa  133  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0403  transcriptional regulator, TetR family  39.67 
 
 		 213 aa  132  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.472446  normal  0.522596 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0401  transcriptional regulator, TetR family  38.34 
 
 		 245 aa  126  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0464223  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3302  transcriptional regulator, TetR family  36.68 
 
 		 220 aa  120  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4255  transcriptional regulator, TetR family  37.11 
 
 		 223 aa  119  3e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.228182 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0256  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 227 aa  119  3.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.968825 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4614  transcriptional regulator, TetR family  32.84 
 
 		 222 aa  119  4.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27910  transcriptional regulator, tetR family  44.68 
 
 		 194 aa  118  7e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.839534  normal  0.794272 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2647  transcriptional regulator, TetR family  37.37 
 
 		 217 aa  111  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4087  transcriptional regulator, TetR family  34.8 
 
 		 228 aa  107  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.98142 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8507  putative transcriptional regulator, TetR family  33.5 
 
 		 199 aa  106  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4108  regulatory protein TetR  41.83 
 
 		 189 aa  105  8e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0946  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 223 aa  104  9e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.123031  normal  0.934208 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4782  transcriptional regulator, TetR family  34 
 
 		 205 aa  101  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.682663 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0143  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 266 aa  99  5e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170765  normal  0.0134311 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2165  transcriptional regulator, TetR family  33.91 
 
 		 188 aa  89.4  4e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.289199  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2583  TetR family transcriptional regulator  36.77 
 
 		 184 aa  89.4  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4423  regulatory protein TetR  35.18 
 
 		 223 aa  89  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.310024  normal  0.345836 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0331  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 211 aa  88.6  6e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3012  transcriptional regulator, TetR family  32.16 
 
 		 219 aa  88.2  9e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.367148  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2572  transcriptional regulator, TetR family  31.55 
 
 		 208 aa  87.8  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0528  TetR family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 192 aa  86.7  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5174  putative transcriptional regulator, TetR family  37.58 
 
 		 199 aa  86.7  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107413  hitchhiker  0.00860579 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19730  transcriptional regulator, tetR family  37.24 
 
 		 182 aa  85.9  5e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.453369  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2527  transcriptional regulator, TetR family  33.68 
 
 		 207 aa  85.1  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0551  transcriptional regulator, TetR family  34.02 
 
 		 213 aa  84.7  9e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2868  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 184 aa  84.3  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0239599 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5811  transcriptional regulator, TetR family  34.52 
 
 		 222 aa  84.3  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.78864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5248  putative transcriptional regulator, TetR family  34.46 
 
 		 227 aa  84.3  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.66171 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4348  TetR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 174 aa  83.6  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2557  transcriptional regulator, TetR family  35.12 
 
 		 186 aa  82.4  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4464  transcriptional regulator, TetR family  34.59 
 
 		 188 aa  82  0.000000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129958  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4122  TetR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 204 aa  81.6  0.000000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.937449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5586  TetR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 191 aa  82  0.000000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5011  putative transcriptional regulator, TetR family  35.46 
 
 		 203 aa  81.6  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_003296  RS05498  putative transcription regulator protein  34.05 
 
 		 197 aa  80.9  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.806773 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2402  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 259 aa  81.3  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0404395  hitchhiker  0.00830545 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0257  transcriptional regulator, TetR family  31.38 
 
 		 188 aa  81.3  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2209  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 202 aa  79.7  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.594451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6635  TetR family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 214 aa  79.7  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2095  transcriptional regulator, TetR family  32.97 
 
 		 194 aa  79.7  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.546455  normal  0.514839 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5157  transcriptional regulator, TetR family  34.67 
 
 		 193 aa  79.3  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5172  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 188 aa  79.3  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3964  regulatory protein, TetR  31.61 
 
 		 174 aa  79.3  0.00000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3643  TetR family transcriptional regulator  35.98 
 
 		 193 aa  79.3  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.259475 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4514  TetR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 202 aa  79  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.603185  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3089  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 194 aa  79  0.00000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7965  transcriptional regulator, TetR family  32.73 
 
 		 192 aa  78.6  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0512  TetR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 201 aa  78.2  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 196 aa  78.2  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3327  transcriptional regulator, TetR family  37.33 
 
 		 185 aa  77.8  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.11213  normal  0.13372 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6123  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 232 aa  77  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.417481  normal  0.0113351 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6201  transcriptional regulator, TetR family  33.92 
 
 		 189 aa  77.4  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0829103  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2460  transcriptional regulator TetR family  29.35 
 
 		 231 aa  76.6  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.337543  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0877  transcriptional regulator, TetR family  31.68 
 
 		 222 aa  77  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6198  transcriptional regulator, TetR family  34.04 
 
 		 193 aa  76.6  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.533125  normal  0.545762 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2371  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 219 aa  76.3  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0164383  normal  0.061065 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8897  transcriptional regulator, TetR family  30.57 
 
 		 222 aa  76.6  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1574  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 195 aa  76.6  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0394993 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2539  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 223 aa  76.3  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.480569  hitchhiker  0.0000324052 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7119  putative transcriptional regulator, TetR family  30.65 
 
 		 204 aa  75.5  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00221905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4496  TetR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 199 aa  75.5  0.0000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4437  TetR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 192 aa  75.5  0.0000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4583  TetR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 199 aa  75.5  0.0000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.204371 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4879  TetR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 199 aa  75.5  0.0000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.089814 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1452  transcriptional regulator, TetR family  33.97 
 
 		 199 aa  74.3  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6450  putative transcriptional regulator, TetR family  33.12 
 
 		 188 aa  74.3  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000363867  normal  0.0147922 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3313  transcriptional regulator, TetR family  29.57 
 
 		 209 aa  74.7  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137945 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0329  transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 		 196 aa  74.3  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.330162  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4064  regulatory protein TetR  32.26 
 
 		 190 aa  74.7  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.3318 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3360  putative transcriptional regulator, TetR family  41.75 
 
 		 195 aa  73.9  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0575014  normal  0.0807522 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0387  regulatory protein TetR  33.94 
 
 		 211 aa  73.9  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.618226  normal  0.0295427 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5170  TetR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 195 aa  72.8  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5259  TetR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 195 aa  72.8  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.532008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2753  transcriptional regulator, TetR family  30.73 
 
 		 197 aa  73.2  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.920315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5551  TetR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 195 aa  72.8  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5119  transcriptional regulator, TetR family  30.38 
 
 		 189 aa  72.8  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.891225  normal  0.419875 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3889  transcriptional regulator, TetR family  30.91 
 
 		 299 aa  72  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110513  normal  0.292317 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4327  regulatory protein, TetR  33.14 
 
 		 182 aa  71.6  0.000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.809003  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2182  transcriptional regulator, TetR family  50.68 
 
 		 207 aa  72  0.000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2145  regulatory protein TetR  40.19 
 
 		 202 aa  71.2  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5863  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 186 aa  70.9  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.602897  normal  0.34108 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5801  regulatory protein TetR  51.43 
 
 		 190 aa  70.9  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.813515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1133  transcriptional regulator, TetR family  31.63 
 
 		 206 aa  70.5  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.660169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3163  putative transcriptional regulator, TetR family  33.1 
 
 		 223 aa  70.5  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4153  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 201 aa  70.5  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0444312  normal  0.572162 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0570  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 188 aa  70.1  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1469  regulatory protein TetR  44.95 
 
 		 209 aa  69.7  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.520835 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>