42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2068 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2068  putative ABC transporter solute-binding protein  100 
 
 		 424 aa  853    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.730242  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4231  putative ABC transporter solute-binding protein  46.63 
 
 		 410 aa  318  9e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2122  putative ABC transporter solute-binding protein  38.15 
 
 		 409 aa  277  2e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1236  hypothetical protein  36.95 
 
 		 429 aa  273  4.0000000000000004e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0532  putative ABC transporter solute-binding protein  37.31 
 
 		 439 aa  258  2e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.96386  normal  0.487675 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1199  putative ABC transporter solute-binding protein  39.07 
 
 		 430 aa  257  3e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.134978 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0791  putative ABC transporter solute-binding protein  38.35 
 
 		 403 aa  257  3e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0759  putative ABC transporter solute-binding protein  35.26 
 
 		 429 aa  251  1e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3278  putative ABC transporter solute-binding protein  38.4 
 
 		 408 aa  242  1e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1832  putative ABC transporter solute-binding protein  39.84 
 
 		 401 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.563171 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2251  putative ABC transporter solute-binding protein  37.43 
 
 		 399 aa  238  1e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0200  putative ABC transporter solute-binding protein  38.7 
 
 		 401 aa  236  9e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.91232  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1446  putative ABC transporter solute-binding protein  38.98 
 
 		 401 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.50777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3226  putative ABC transporter solute-binding protein  38.36 
 
 		 401 aa  233  6e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0901142  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4046  putative ABC transporter solute-binding protein  37.67 
 
 		 406 aa  231  3e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2153  extracellular solute-binding protein  37.87 
 
 		 404 aa  216  5.9999999999999996e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000427732 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2438  hypothetical protein  33.01 
 
 		 409 aa  209  6e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.557423  normal  0.459913 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1693  putative ABC transporter solute-binding protein  35.71 
 
 		 390 aa  187  2e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.949015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2959  putative ABC transporter solute-binding protein  33.03 
 
 		 419 aa  184  3e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0976  putative ABC transporter solute-binding protein  34.77 
 
 		 435 aa  178  2e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0656307 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1878  putative ABC transporter solute-binding protein  34.48 
 
 		 388 aa  176  5e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000418187 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1888  extracellular solute-binding protein family 1  34.48 
 
 		 388 aa  177  5e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00824785  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1838  putative ABC transporter solute-binding protein  34.48 
 
 		 388 aa  177  5e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01723  hypothetical protein  34.48 
 
 		 388 aa  177  5e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01711  hypothetical protein  34.48 
 
 		 388 aa  177  5e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2768  putative ABC transporter solute-binding protein  31.11 
 
 		 381 aa  176  5e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.211813  normal  0.195627 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2473  putative ABC transporter solute-binding protein  34.22 
 
 		 388 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1977  putative ABC transporter solute-binding protein  33.6 
 
 		 388 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.942474  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1436  putative ABC transporter solute-binding protein  33.95 
 
 		 388 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.463512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0361  putative ABC transporter solute-binding protein  32.59 
 
 		 380 aa  173  3.9999999999999995e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.083844  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2003  putative ABC transporter solute-binding protein  33.6 
 
 		 388 aa  171  2e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.203142  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02678  putative ABC transporter solute-binding protein  30.21 
 
 		 403 aa  169  1e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003793  ABC transporter substrate-binding protein YnjB  29.91 
 
 		 386 aa  167  4e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000277117  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1269  putative ABC transporter solute-binding protein  31.45 
 
 		 382 aa  166  1.0000000000000001e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000820878  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01789  putative ABC-type transport system, periplasmic component  30.5 
 
 		 384 aa  158  1e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0393  putative ABC transporter solute-binding protein  25.15 
 
 		 373 aa  131  3e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.235452  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5613  ABC transporter substrate binding protein  26.5 
 
 		 395 aa  79  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6580  extracellular solute-binding protein family 1  26.15 
 
 		 381 aa  61.6  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.384654  normal  0.213985 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7450  extracellular solute-binding protein  25.62 
 
 		 380 aa  61.2  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2094  putative spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  22.44 
 
 		 377 aa  57.4  0.0000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1874  extracellular solute-binding protein family 1  20.47 
 
 		 375 aa  49.3  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.58176  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3703  extracellular solute-binding protein  22.34 
 
 		 377 aa  45.8  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>