More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2060 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2060  hypothetical protein  100 
 
 		 239 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00249342  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1554  hypothetical protein  71.5 
 
 		 246 aa  242  3e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0915  hypothetical protein  53.97 
 
 		 206 aa  185  5e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00745427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4992  SNARE associated Golgi protein  55.1 
 
 		 200 aa  175  5e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1394  SNARE associated Golgi protein  47.47 
 
 		 256 aa  157  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.527728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1818  SNARE associated Golgi protein  47.37 
 
 		 209 aa  142  5e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.685944  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0238  DedA family protein  44.44 
 
 		 211 aa  136  2e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4526  hypothetical protein  49.1 
 
 		 222 aa  135  8e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1164  SNARE associated Golgi protein  42.39 
 
 		 203 aa  120  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1764  SNARE associated Golgi protein  40.1 
 
 		 223 aa  116  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000231934 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0704  SNARE associated Golgi protein  29.38 
 
 		 202 aa  106  4e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.693025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1317  SNARE associated Golgi protein  41.77 
 
 		 223 aa  106  4e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0112006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0812  DedA family protein  32.3 
 
 		 204 aa  103  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000122435  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2482  dedA protein  37.58 
 
 		 198 aa  102  6e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.323289  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1883  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.55 
 
 		 702 aa  98.2  9e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.379542  normal  0.0602268 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0566  DedA family protein  34 
 
 		 206 aa  95.9  4e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.180728 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3131  hypothetical protein  35.63 
 
 		 471 aa  95.5  6e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1291  SNARE associated Golgi protein  40.67 
 
 		 212 aa  95.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.677756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3663  SNARE associated Golgi protein-like protein  34.59 
 
 		 209 aa  94.7  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0526  SNARE associated Golgi protein  31.07 
 
 		 204 aa  94  2e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.115863  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1260  SNARE associated Golgi protein  41.06 
 
 		 212 aa  94  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0628  hypothetical protein  38.32 
 
 		 199 aa  92.8  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1810  SNARE associated Golgi protein  30.38 
 
 		 206 aa  92.8  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2073  SNARE associated Golgi protein-like protein  43.43 
 
 		 231 aa  92.8  5e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.520648  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5678  SNARE associated Golgi protein  38.6 
 
 		 221 aa  92  7e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0010  hypothetical protein  39.22 
 
 		 208 aa  91.3  1e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.163704  normal  0.0549348 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2527  membrane protein, DedA family  36.94 
 
 		 215 aa  91.3  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2156  SNARE associated Golgi protein  36.94 
 
 		 215 aa  91.3  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000142104 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0575  DedA family protein  33.16 
 
 		 213 aa  91.3  1e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.684924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3359  SNARE associated Golgi protein  38.42 
 
 		 473 aa  90.5  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.703803  normal  0.0100959 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2579  hypothetical protein  28.97 
 
 		 256 aa  90.5  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00440757  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1497  SNARE associated Golgi protein-like protein  28.95 
 
 		 201 aa  90.1  3e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.330026  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0031  hypothetical protein  32.12 
 
 		 268 aa  88.2  9e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1595  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35.32 
 
 		 458 aa  87.8  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1076  hypothetical protein  28.57 
 
 		 221 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.313022  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0186  SNARE associated Golgi protein  34.57 
 
 		 209 aa  87  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4503  SNARE associated Golgi protein  37.95 
 
 		 214 aa  87  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.711425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4966  SNARE associated Golgi protein  37.95 
 
 		 214 aa  87  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.248557 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0017  SNARE associated Golgi protein  37.09 
 
 		 363 aa  87.4  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.447324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5019  SNARE associated Golgi protein  37.44 
 
 		 214 aa  86.7  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.432695  normal  0.972374 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2311  SNARE associated Golgi protein  25.62 
 
 		 259 aa  86.7  3e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000116146 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0592  DedA family protein  33.94 
 
 		 219 aa  86.7  3e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1452  hypothetical protein  31.97 
 
 		 237 aa  86.3  4e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.00552947  normal  0.0731246 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1142  SNARE associated Golgi protein  37.04 
 
 		 216 aa  85.9  5e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0132  SNARE associated Golgi protein  32.89 
 
 		 237 aa  85.9  6e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.365407  decreased coverage  0.0000235996 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4069  SNARE associated Golgi protein  27.96 
 
 		 219 aa  85.5  6e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00208186  hitchhiker  0.00137396 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1369  hypothetical protein  30.87 
 
 		 221 aa  85.9  6e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.25777  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1186  membrane-associated protein-like protein  36.92 
 
 		 355 aa  85.5  7e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3914  SNARE associated Golgi protein  36.92 
 
 		 213 aa  85.5  7e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.148472 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1530  hypothetical protein  28.86 
 
 		 220 aa  85.1  9e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1421  hypothetical protein  28.86 
 
 		 220 aa  85.1  9e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0360  hypothetical protein  28.86 
 
 		 220 aa  85.1  9e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0089  SNARE associated Golgi protein  30.07 
 
 		 214 aa  84.3  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.061617 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0191  hypothetical protein  27.89 
 
 		 220 aa  84.7  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18330  uncharacterized membrane-associated protein  35.8 
 
 		 230 aa  84.7  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11720  hypothetical protein  27.51 
 
 		 221 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3333  hypothetical protein  29.53 
 
 		 220 aa  84.7  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00119993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1987  SNARE associated Golgi protein  33.33 
 
 		 222 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.446526  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2069  hypothetical protein  37.5 
 
 		 209 aa  84.3  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.873256  normal  0.0385471 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0127  hypothetical protein  32.24 
 
 		 237 aa  84  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0232  phosphoesterase, PA-phosphatase related  41.94 
 
 		 457 aa  84.3  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1169  SNARE associated Golgi protein  28.1 
 
 		 217 aa  84  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.922899  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1312  SNARE associated Golgi protein  30.07 
 
 		 229 aa  84.3  0.000000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.192929 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2010  phosphoesterase, PA-phosphatase related  34.01 
 
 		 664 aa  84  0.000000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.362381  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0632  DedA family protein  33.11 
 
 		 202 aa  83.2  0.000000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1466  hypothetical protein  29.53 
 
 		 221 aa  82.4  0.000000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4907  SNARE associated Golgi protein  41.84 
 
 		 227 aa  82  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.703178 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2092  hypothetical protein  32.73 
 
 		 266 aa  81.3  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.613654  normal  0.0908171 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4889  SNARE associated Golgi protein-like protein  38.46 
 
 		 209 aa  81.6  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2799  hypothetical protein  29.53 
 
 		 220 aa  80.9  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1699  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  34.73 
 
 		 521 aa  80.9  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.422307  normal  0.249913 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1543  DedA family protein  32.43 
 
 		 202 aa  80.5  0.00000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.201859  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2081  putative integral membrane protein dedA-like protein  32.81 
 
 		 202 aa  80.5  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.253435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1148  hypothetical protein  30.52 
 
 		 211 aa  80.9  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0484  hypothetical protein  29.75 
 
 		 215 aa  80.9  0.00000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.849747  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1368  integral membrane protein  28.39 
 
 		 221 aa  80.1  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.377957  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2575  hypothetical protein  30.2 
 
 		 232 aa  80.1  0.00000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2124  hypothetical protein  35.12 
 
 		 260 aa  80.1  0.00000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2695  hypothetical protein  30.07 
 
 		 219 aa  79.7  0.00000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2866  hypothetical protein  29.53 
 
 		 219 aa  79.7  0.00000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.416299 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3379  SNARE associated Golgi protein-related protein  30.63 
 
 		 216 aa  79.3  0.00000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2509  hypothetical protein  28.19 
 
 		 219 aa  79  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2718  hypothetical protein  28.19 
 
 		 219 aa  79  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.261998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2597  hypothetical protein  28.19 
 
 		 219 aa  79  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.651507 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2555  hypothetical protein  28.19 
 
 		 219 aa  79  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4182  SNARE associated Golgi protein  37.5 
 
 		 207 aa  79  0.00000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.989097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2768  hypothetical protein  28.81 
 
 		 212 aa  79  0.00000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.375842  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2233  SNARE associated Golgi protein  32.12 
 
 		 266 aa  78.6  0.00000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.300911  normal  0.0707133 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2609  hypothetical protein  28.19 
 
 		 219 aa  79  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.36856  normal  0.051576 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2473  hypothetical protein  30.07 
 
 		 219 aa  78.6  0.00000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02242  conserved inner membrane protein  29.41 
 
 		 219 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1339  SNARE associated Golgi protein-like protein  29.41 
 
 		 219 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.217693  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3457  hypothetical protein  29.41 
 
 		 219 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2468  hypothetical protein  29.41 
 
 		 219 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0579  SNARE associated Golgi protein  33.54 
 
 		 255 aa  78.2  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0431109  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02202  hypothetical protein  29.41 
 
 		 219 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4049  alkaline phosphatase  29.55 
 
 		 213 aa  77.8  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.257312  hitchhiker  0.00220744 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1415  PAP2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 682 aa  78.2  0.0000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00547522  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1352  phosphatase  33.33 
 
 		 682 aa  77.8  0.0000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.304549  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1944  SNARE associated Golgi protein  36.65 
 
 		 199 aa  78.2  0.0000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>