More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2050 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2050  response regulator receiver  100 
 
 		 250 aa  493  9.999999999999999e-139  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2924  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.21 
 
 		 265 aa  266  2e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3674  two component transcriptional regulator  49.15 
 
 		 246 aa  221  6e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.027909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0312  response regulator receiver  51.28 
 
 		 233 aa  220  1.9999999999999999e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0102436  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3782  response regulator receiver  50.2 
 
 		 297 aa  219  3e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5309  two component transcriptional regulator  49.15 
 
 		 246 aa  218  6e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.383621  normal  0.611504 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5700  two component transcriptional regulator  49.15 
 
 		 246 aa  218  6e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.663569  normal  0.593468 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2905  two component transcriptional regulator  51.9 
 
 		 263 aa  215  5e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2949  two component transcriptional regulator  51.9 
 
 		 263 aa  215  5e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.271765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2935  two component transcriptional regulator  51.9 
 
 		 263 aa  215  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.193911 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2604  response regulator receiver  49.15 
 
 		 244 aa  214  7e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.88392  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1834  two component transcriptional regulator  50.63 
 
 		 251 aa  215  7e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.131317  normal  0.194802 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4233  response regulator receiver  49.15 
 
 		 244 aa  214  7e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2782  two component transcriptional regulator  48.32 
 
 		 231 aa  214  9e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.92379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1316  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.68 
 
 		 232 aa  210  2e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4566  two component transcriptional regulator  49.19 
 
 		 248 aa  208  7e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.611556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4523  two component transcriptional regulator  49.36 
 
 		 251 aa  207  2e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0978  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.81 
 
 		 254 aa  206  3e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0385223 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3537  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.46 
 
 		 237 aa  206  4e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.555413 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3676  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.64 
 
 		 243 aa  205  4e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2838  two component transcriptional regulator  50.63 
 
 		 251 aa  206  4e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.692986  normal  0.315208 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0867  two component transcriptional regulator  49.8 
 
 		 250 aa  204  8e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0893  two component transcriptional regulator  49.36 
 
 		 251 aa  204  8e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1439  two component transcriptional regulator  48.31 
 
 		 265 aa  203  2e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.293954  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1457  two component transcriptional regulator  48.31 
 
 		 265 aa  203  2e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.701993 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1773  two component transcriptional regulator  47.95 
 
 		 260 aa  202  3e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.178114  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18360  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  49.57 
 
 		 239 aa  201  6e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2937  two component transcriptional regulator  48.58 
 
 		 255 aa  199  3e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.511337  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04920  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  49.13 
 
 		 222 aa  198  7.999999999999999e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0854  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.15 
 
 		 248 aa  194  8.000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0313558 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0093  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.62 
 
 		 232 aa  193  2e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1100  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.53 
 
 		 236 aa  192  5e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000182155 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2207  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.25 
 
 		 244 aa  191  7e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3887  two component transcriptional regulator  46.89 
 
 		 251 aa  191  8e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.243105 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3070  two component transcriptional regulator  48.26 
 
 		 230 aa  191  8e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000463151 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2652  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.82 
 
 		 264 aa  191  1e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0624  two component transcriptional regulator  48.72 
 
 		 240 aa  188  8e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3302  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.91 
 
 		 231 aa  187  9e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343135 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4699  DNA-binding response regulator PhoP  42.74 
 
 		 239 aa  186  2e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0539  DNA-binding response regulator PhoP  42.74 
 
 		 239 aa  186  2e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130788 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2983  two component transcriptional regulator  45.45 
 
 		 228 aa  186  4e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.51 
 
 		 235 aa  184  9e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2083  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.61 
 
 		 237 aa  184  1.0000000000000001e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.873655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2351  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.83 
 
 		 231 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.274912  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4419  two component transcriptional regulator  41.88 
 
 		 239 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2675  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.17 
 
 		 234 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.661044  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1256  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory protein PhoP  40.83 
 
 		 236 aa  182  5.0000000000000004e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.577358  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4125  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.12 
 
 		 230 aa  181  7e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.125271  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2566  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.06 
 
 		 229 aa  181  8.000000000000001e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000356007  hitchhiker  0.00345607 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4720  DNA-binding response regulator PhoP  41.88 
 
 		 239 aa  181  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2106  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.68 
 
 		 238 aa  181  9.000000000000001e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4484  DNA-binding response regulator PhoP  41.88 
 
 		 239 aa  181  1e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4319  alkaline phosphatase synthesis response regulator  41.88 
 
 		 239 aa  181  1e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4330  alkaline phosphatase synthesis response regulator  41.88 
 
 		 239 aa  181  1e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4704  DNA-binding response regulator PhoP  41.88 
 
 		 239 aa  181  1e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000673192 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4833  DNA-binding response regulator PhoP  41.88 
 
 		 239 aa  181  1e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0982965  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0997  two component transcriptional regulator  45.06 
 
 		 230 aa  181  1e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.679101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4714  DNA-binding response regulator PhoP  41.88 
 
 		 239 aa  181  1e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1903  two component transcriptional regulator  43.1 
 
 		 230 aa  181  1e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1538  phosphate regulon transcriptional regulatory protein  44.59 
 
 		 228 aa  180  2e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.280381 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5259  two component transcriptional regulator  40.34 
 
 		 235 aa  180  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000559572  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5346  DNA-binding response regulator YycF  40.34 
 
 		 235 aa  180  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000234523  hitchhiker  0.00000000000323141 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0987  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.55 
 
 		 233 aa  180  2e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.195539  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5589  DNA-binding response regulator YycF  40.34 
 
 		 235 aa  180  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  40.34 
 
 		 235 aa  180  2e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5572  DNA-binding response regulator YycF  40.34 
 
 		 235 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81316e-29 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5615  DNA-binding response regulator YycF  40.34 
 
 		 235 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5319  DNA-binding response regulator YycF  40.34 
 
 		 235 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.169223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5147  response regulator  40.34 
 
 		 235 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168683  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5163  response regulator  40.34 
 
 		 235 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00196509  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5650  DNA-binding response regulator YycF  40.34 
 
 		 235 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00563499  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5715  DNA-binding response regulator YycF  40.34 
 
 		 235 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.656882  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.69 
 
 		 235 aa  179  2.9999999999999997e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0646165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1181  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.09 
 
 		 234 aa  179  2.9999999999999997e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00335068 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0415  two component transcriptional regulator  45.19 
 
 		 231 aa  179  4e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.777838 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  43.1 
 
 		 226 aa  179  4e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4009  two component transcriptional regulator  43.51 
 
 		 230 aa  178  5.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00751412  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4151  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.28 
 
 		 230 aa  178  5.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0353  two component transcriptional regulator  46.52 
 
 		 230 aa  178  8e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.683455 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3274  two component transcriptional regulator  41.88 
 
 		 238 aa  178  9e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1085  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.91 
 
 		 235 aa  176  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3818  two component transcriptional regulator  44.21 
 
 		 230 aa  176  3e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.386967  normal  0.165932 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.4 
 
 		 237 aa  176  3e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2828  response regulator receiver  44.92 
 
 		 231 aa  176  4e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0804  two component transcriptional regulator  43.1 
 
 		 236 aa  176  4e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.324741  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1394  two component transcriptional regulator  39.41 
 
 		 236 aa  175  5e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000024965  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6310  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.36 
 
 		 261 aa  175  5e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.534044  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0984  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.16 
 
 		 246 aa  174  9.999999999999999e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0723779 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0700  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.42 
 
 		 226 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.768939  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1991  two component transcriptional regulator  44.87 
 
 		 235 aa  174  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0588  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.02 
 
 		 226 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.944339  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0444  DNA-binding response regulator  40.34 
 
 		 233 aa  174  9.999999999999999e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0088  two component transcriptional regulator  41.56 
 
 		 228 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0805  two component transcriptional regulator  43.91 
 
 		 229 aa  174  9.999999999999999e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1221  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.25 
 
 		 256 aa  174  9.999999999999999e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.655279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4046  response regulator receiver  41.63 
 
 		 225 aa  174  9.999999999999999e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1944  two component transcriptional regulator  40.59 
 
 		 238 aa  173  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2693  two component transcriptional regulator  39.75 
 
 		 226 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.575064 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0724  two component transcriptional regulator  41.28 
 
 		 226 aa  173  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3904  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.89 
 
 		 230 aa  173  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.144495  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>