More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2040 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_2040  hypothetical protein  100 
 
 
418 aa  812    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.923068  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1858  protein of unknown function DUF21  66.19 
 
 
434 aa  514  1e-144  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0148  protein of unknown function DUF21  63.74 
 
 
421 aa  511  1e-144  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.518809 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3237  protein of unknown function DUF21  63.43 
 
 
448 aa  493  9.999999999999999e-139  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.422703  normal  0.0333054 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0915  protein of unknown function DUF21  59.78 
 
 
460 aa  471  1e-132  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0280711  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0947  hypothetical protein  57.51 
 
 
432 aa  446  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1409  hemolysin-like protein  49.65 
 
 
447 aa  409  1e-113  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4410  protein of unknown function DUF21  53.88 
 
 
444 aa  404  1e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.938013  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0014  CBS domain protein  49.41 
 
 
431 aa  398  9.999999999999999e-111  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000513416 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02510  CBS domain-containing protein  53.04 
 
 
470 aa  392  1e-108  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1262  hypothetical protein  50.36 
 
 
533 aa  383  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7969  protein of unknown function DUF21  51.52 
 
 
555 aa  360  3e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0669  hypothetical protein  50.38 
 
 
439 aa  352  8e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0810091 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0389  hypothetical protein  49.16 
 
 
438 aa  351  1e-95  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5899  hypothetical protein  43.07 
 
 
430 aa  285  1.0000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.476132 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4979  protein of unknown function DUF21  46.04 
 
 
440 aa  283  6.000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0234  protein of unknown function DUF21  43.61 
 
 
425 aa  282  7.000000000000001e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1099  hypothetical protein  42.08 
 
 
425 aa  280  5e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1116  hypothetical protein  42.08 
 
 
425 aa  280  5e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1127  hypothetical protein  41.84 
 
 
425 aa  278  1e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.531176 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0026  protein of unknown function DUF21  43.06 
 
 
438 aa  275  9e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2633  protein of unknown function DUF21  42 
 
 
425 aa  264  2e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1487  protein of unknown function DUF21  41.56 
 
 
421 aa  263  4e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.121973  normal  0.308123 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1263  CBS  41.51 
 
 
425 aa  258  2e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2004  hypothetical protein  37.74 
 
 
431 aa  254  2.0000000000000002e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0247  protein of unknown function DUF21  35.31 
 
 
446 aa  237  3e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0252  protein of unknown function DUF21  31.5 
 
 
434 aa  231  2e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000514588  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0926  protein of unknown function DUF21  36.24 
 
 
441 aa  228  1e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0470  hypothetical protein  34.59 
 
 
432 aa  228  2e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000200568  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0064  protein of unknown function DUF21  34.16 
 
 
447 aa  225  1e-57  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1153  hypothetical protein  34.52 
 
 
447 aa  223  6e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000974304  normal  0.0417904 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3277  protein of unknown function DUF21  34.52 
 
 
437 aa  223  6e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000233033  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4979  hypothetical protein  38.77 
 
 
423 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.581997  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2233  protein of unknown function DUF21  34.79 
 
 
437 aa  221  1.9999999999999999e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3512  protein of unknown function DUF21  33.1 
 
 
431 aa  220  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.257501  normal  0.374436 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1422  hypothetical protein  37.25 
 
 
423 aa  220  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01240  CBS domain-containing protein  34.8 
 
 
443 aa  216  8e-55  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2870  hypothetical protein  32.94 
 
 
433 aa  216  8e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.221651  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0361  CBS domain-containing protein  28.6 
 
 
449 aa  215  9e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2766  hypothetical protein  34.3 
 
 
442 aa  214  2.9999999999999995e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6404  hypothetical protein  35.17 
 
 
452 aa  213  3.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3544  protein of unknown function DUF21  30.66 
 
 
446 aa  213  4.9999999999999996e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1072  hypothetical protein  35.28 
 
 
442 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.638225  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2925  hypothetical protein  36.04 
 
 
465 aa  213  5.999999999999999e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.221134  normal  0.412302 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0262  protein of unknown function DUF21  40.34 
 
 
421 aa  211  1e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.558818 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0819  protein of unknown function DUF21  29.91 
 
 
441 aa  211  2e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3597  protein of unknown function DUF21  32.93 
 
 
447 aa  210  3e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000988374 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1763  hypothetical protein  34.46 
 
 
446 aa  211  3e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1143  hypothetical protein  33.95 
 
 
432 aa  210  5e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000186322  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4087  protein of unknown function DUF21  33.41 
 
 
453 aa  209  1e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4282  hypothetical protein  35.32 
 
 
434 aa  207  3e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.789831  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3156  hypothetical protein  30.44 
 
 
442 aa  206  5e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3391  CBS domain protein  30.44 
 
 
442 aa  206  5e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3172  CBS domain-containing protein  30.21 
 
 
442 aa  205  1e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.903732  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2068  magnesium and cobalt efflux protein  28.54 
 
 
451 aa  205  1e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0953  membrane protein  31.46 
 
 
426 aa  205  1e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3396  CBS domain protein  30.44 
 
 
442 aa  205  1e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3392  CBS domain-containing protein  30.44 
 
 
442 aa  204  2e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2815  CBS domain-containing protein  29.36 
 
 
439 aa  204  2e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2134  CBS domain-containing protein  28.3 
 
 
451 aa  204  2e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2072  magnesium and cobalt efflux protein  28.3 
 
 
451 aa  204  2e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0473612  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3066  hypothetical protein  30.44 
 
 
442 aa  205  2e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.928407  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2288  CBS domain-containing protein  28.3 
 
 
451 aa  204  2e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.779019  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3370  CBS domain protein  30.21 
 
 
442 aa  205  2e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3095  hypothetical protein  29.47 
 
 
440 aa  204  3e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0877278  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2966  protein of unknown function DUF21  32.45 
 
 
439 aa  204  3e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1855  CBS domain protein  30.21 
 
 
442 aa  204  3e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0756  hypothetical protein  34.03 
 
 
436 aa  203  4e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0635919  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2138  hypothetical protein  29.91 
 
 
440 aa  203  4e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2397  CBS domain protein  28.33 
 
 
443 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3259  CBS domain protein  27.53 
 
 
435 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.698294 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0238  protein of unknown function DUF21  29.24 
 
 
417 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4403  hypothetical protein  31.62 
 
 
436 aa  201  1.9999999999999998e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0196704  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2313  CBS domain protein  28.33 
 
 
443 aa  201  3e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2050  CBS domain protein  27.29 
 
 
435 aa  201  3e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.202921  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3422  CBS domain-containing protein  30.09 
 
 
435 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0036  transporter, putative  31.62 
 
 
421 aa  200  3.9999999999999996e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0036  putative transporter  31.62 
 
 
421 aa  200  5e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2107  hypothetical protein  28.34 
 
 
451 aa  199  7.999999999999999e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1126  protein of unknown function DUF21  30.58 
 
 
428 aa  199  9e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.93664  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2159  protein of unknown function DUF21  29.37 
 
 
440 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.182374  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4622  protein of unknown function DUF21  31.25 
 
 
430 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2270  CBS domain protein  28.33 
 
 
443 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2000  hemolysin-like protein  32.13 
 
 
445 aa  198  2.0000000000000003e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0678745  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0676  CBS domain-containing protein  30.39 
 
 
432 aa  197  3e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3678  protein of unknown function DUF21  32.05 
 
 
443 aa  197  3e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.35091 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1467  protein of unknown function DUF21  32.13 
 
 
429 aa  197  3e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.211541  normal  0.989219 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2432  protein of unknown function DUF21  32.05 
 
 
443 aa  197  3e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0796  CBS domain-containing protein  49.15 
 
 
340 aa  197  3e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0742  hypothetical protein  28.22 
 
 
449 aa  197  3e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0726  hypothetical protein  28.22 
 
 
449 aa  197  3e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4103  protein of unknown function DUF21  29.27 
 
 
442 aa  197  4.0000000000000005e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00110623 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3197  hypothetical protein  34.13 
 
 
479 aa  197  4.0000000000000005e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.241932  normal  0.866715 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3282  protein of unknown function DUF21  33.98 
 
 
433 aa  196  6e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0735  CBS domain protein  30.16 
 
 
432 aa  196  7e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0521  protein of unknown function DUF21  28.84 
 
 
448 aa  196  7e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1441  protein of unknown function DUF21  32.14 
 
 
439 aa  196  9e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.114074  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1678  hypothetical protein  28.47 
 
 
444 aa  195  1e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.306047  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3055  CBS domain protein  27.62 
 
 
443 aa  195  1e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2160  CBS domain protein  26.35 
 
 
435 aa  194  2e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00238227  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>