More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1974 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_1974  chemotaxis sensory transducer  100 
 
 
535 aa  1026    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0109  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.1 
 
 
528 aa  358  1.9999999999999998e-97  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.268294  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2984  chemotaxis sensory transducer  44.23 
 
 
545 aa  332  1e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.660626  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1293  chemotaxis sensory transducer  54.57 
 
 
542 aa  284  3.0000000000000004e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.320257  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36630  methyl-accepting chemotaxis protein  52.01 
 
 
540 aa  273  4.0000000000000004e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3602  chemotaxis sensory transducer  47 
 
 
518 aa  273  5.000000000000001e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36620  methyl-accepting chemotaxis protein  54.01 
 
 
543 aa  271  2e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0835028  normal  0.811978 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2323  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.6 
 
 
545 aa  271  2e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4449  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.84 
 
 
538 aa  267  2.9999999999999995e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.018308  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1751  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.15 
 
 
547 aa  263  6.999999999999999e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2095  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.33 
 
 
538 aa  261  2e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03110  methyl-accepting chemotaxis protein  48.55 
 
 
347 aa  259  1e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0123169  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06110  methyl-accepting chemotaxis protein  51.86 
 
 
533 aa  258  2e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.232988  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0651  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.93 
 
 
535 aa  256  9e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.406234  normal  0.0260089 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30970  methyl-accepting chemotaxis protein  48.82 
 
 
562 aa  254  3e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32360  methyl-accepting chemotaxis protein  52.13 
 
 
530 aa  253  5.000000000000001e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2197  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.7 
 
 
522 aa  250  5e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05890  methyl-accepting chemotaxis protein  41.44 
 
 
538 aa  249  6e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.383381 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1613  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.92 
 
 
523 aa  248  1e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00385179  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0421  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.2 
 
 
623 aa  248  2e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.308823 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32370  methyl-accepting chemotaxis protein  50.15 
 
 
531 aa  248  3e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0359  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.65 
 
 
542 aa  247  4e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1755  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.88 
 
 
538 aa  246  4.9999999999999997e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5010  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.75 
 
 
538 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5009  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.76 
 
 
537 aa  243  5e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0375  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.06 
 
 
544 aa  242  1e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30950  methyl-accepting chemotaxis protein  38.46 
 
 
540 aa  239  1e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.664181  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4077  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.51 
 
 
545 aa  236  8e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07600  methyl-accepting chemotaxis protein  48.54 
 
 
533 aa  233  7.000000000000001e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0696595 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1995  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.6 
 
 
394 aa  232  2e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30940  methyl-accepting chemotaxis protein  45.67 
 
 
407 aa  231  2e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.682285  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4229  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.9 
 
 
1150 aa  231  3e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.591053 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1961  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.85 
 
 
535 aa  231  4e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.286616  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5008  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.75 
 
 
546 aa  230  5e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1672  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.69 
 
 
904 aa  230  6e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.707022 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27420  methyl-accepting chemotaxis protein  47.62 
 
 
540 aa  227  4e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.141989  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3321  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.41 
 
 
702 aa  224  2e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.105528  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1526  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.58 
 
 
858 aa  224  3e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.787952  normal  0.35844 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0199  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.11 
 
 
532 aa  223  9.999999999999999e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.570256  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3504  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.11 
 
 
657 aa  221  3e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.193477  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3089  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.85 
 
 
526 aa  220  6e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30960  methyl-accepting chemotaxis protein  48.42 
 
 
540 aa  219  7e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0344  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.74 
 
 
529 aa  215  1.9999999999999998e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.363581  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1935  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.11 
 
 
530 aa  214  3.9999999999999995e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.376441  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30920  methyl-accepting chemotaxis protein  48.8 
 
 
583 aa  214  3.9999999999999995e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0198  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.14 
 
 
715 aa  213  5.999999999999999e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.419669  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1606  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.42 
 
 
545 aa  213  7e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0156977  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2460  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.5 
 
 
531 aa  211  2e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4271  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.63 
 
 
535 aa  210  5e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.79817  normal  0.653673 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0360  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48 
 
 
544 aa  210  5e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4184  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.15 
 
 
536 aa  209  1e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.483396  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1914  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.15 
 
 
550 aa  208  2e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.37871  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0969  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.05 
 
 
562 aa  206  6e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.956339  normal  0.570918 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6483  methyl-accepting chemotaxis protein  35.41 
 
 
565 aa  205  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.877741  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30820  putative methyl-accepting chemotaxis transducer  32.66 
 
 
535 aa  205  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0142633  hitchhiker  0.0000000000042709 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4464  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.67 
 
 
573 aa  205  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.610641  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1913  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.83 
 
 
524 aa  205  2e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0934644  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0049  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.05 
 
 
539 aa  204  4e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0550535  normal  0.228084 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1002  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.86 
 
 
529 aa  203  6e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00624598 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1388  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.06 
 
 
656 aa  202  8e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0527529  normal  0.207734 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4280  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.57 
 
 
563 aa  202  9e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1148  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  38.04 
 
 
650 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.605213  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4407  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.41 
 
 
566 aa  201  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.365939 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4406  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.11 
 
 
566 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.341232 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1064  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.4 
 
 
573 aa  200  5e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.223413  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0127  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.45 
 
 
397 aa  199  7e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.362921  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2744  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.19 
 
 
572 aa  199  7e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.696609  normal  0.585687 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1783  chemotaxis sensory transducer  45.03 
 
 
515 aa  199  1.0000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.552405  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0153  chemotaxis sensory transducer  38.07 
 
 
602 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2366  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.43 
 
 
560 aa  197  5.000000000000001e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.196109  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2983  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.1 
 
 
561 aa  196  1e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0323515 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6635  methyl-accepting chemotaxis protein  38.42 
 
 
565 aa  196  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.459746  normal  0.104137 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4783  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.57 
 
 
730 aa  195  2e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7508  putative methyl-accepting chemotaxis protein (with a HAMP region)  33.75 
 
 
552 aa  195  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.692825  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0994  chemotaxis sensory transducer  35.92 
 
 
656 aa  194  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.357708  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0250  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.13 
 
 
554 aa  192  1e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000234986  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6717  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.31 
 
 
741 aa  192  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.447835  normal  0.587139 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3598  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.52 
 
 
672 aa  192  1e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0026  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.74 
 
 
686 aa  192  1e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4191  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.3 
 
 
538 aa  192  2e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1802  chemotaxis sensory transducer  45.1 
 
 
438 aa  191  2e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2484  chemotaxis sensory transducer  40.43 
 
 
563 aa  192  2e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.1562  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2908  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  38.7 
 
 
561 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.07018 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2904  putative methyl-accepting chemotaxis protein  37.06 
 
 
568 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481458  normal  0.283558 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3804  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.63 
 
 
655 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.772812  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5172  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.2 
 
 
656 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2646  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.85 
 
 
625 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0995  chemotaxis sensory transducer  35.96 
 
 
656 aa  190  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.880627  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3824  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.99 
 
 
561 aa  188  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4580  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.89 
 
 
563 aa  188  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.174371  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2757  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.23 
 
 
561 aa  187  3e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0630329  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3161  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.25 
 
 
731 aa  186  6e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.072786  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2905  putative methyl-accepting chemotaxis protein  39.34 
 
 
542 aa  186  8e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.234112  normal  0.211145 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2653  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.68 
 
 
691 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00184965  normal  0.0777916 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3380  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.77 
 
 
567 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.689596 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2903  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.99 
 
 
568 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.335645  normal  0.0996392 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2471  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.38 
 
 
718 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0242034  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3610  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.09 
 
 
563 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735593  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1867  chemotaxis sensory transducer  36.57 
 
 
714 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.133032 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4931  putative methyl-accepting chemotaxis protein  37.11 
 
 
567 aa  184  3e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>