More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1867 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_1513  Na+/H+ antiporter NhaA  61.89 
 
 		 624 aa  723    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0531977  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1867  Na+/H+ antiporter NhaA  100 
 
 		 616 aa  1191    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1696  Na+/H+ antiporter NhaA  61.33 
 
 		 600 aa  599  1e-170  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1802  cyclic nucleotide-binding protein  56.31 
 
 		 876 aa  570  1e-161  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668239  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0667  Na+/H+ antiporter NhaA  47.15 
 
 		 617 aa  477  1e-133  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.74457  normal  0.729695 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0475  Na+/H+ antiporter NhaA  48.1 
 
 		 613 aa  476  1e-133  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0486  Na+/H+ antiporter NhaA  48.1 
 
 		 613 aa  474  1e-132  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.913429  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0497  Na+/H+ antiporter NhaA  48.1 
 
 		 613 aa  474  1e-132  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.573213 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1658  Na+/H+ antiporter NhaA  46.39 
 
 		 652 aa  467  9.999999999999999e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.245406 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7481  putative sodium/proton antiporter  48.19 
 
 		 629 aa  464  1e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0238  Na+/H+ antiporter NhaA  46.85 
 
 		 617 aa  464  1e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1666  Na+/H+ antiporter NhaA  45.45 
 
 		 652 aa  440  9.999999999999999e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3517  Na+/H+ antiporter NhaA  43.28 
 
 		 630 aa  417  9.999999999999999e-116  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.761621 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0893  Na+/H+ antiporter NhaA  46.63 
 
 		 470 aa  329  7e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4950  Na+/H+ antiporter NhaA  46.19 
 
 		 465 aa  323  4e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.29184  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2414  Na+/H+ antiporter NhaA  50 
 
 		 426 aa  307  4.0000000000000004e-82  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0173976 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2307  Na+/H+ antiporter NhaA  39.82 
 
 		 455 aa  283  7.000000000000001e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2771  Na+/H+ antiporter NhaA  41.29 
 
 		 450 aa  279  9e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00813597  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5677  Na+/H+ antiporter NhaA  44.12 
 
 		 404 aa  278  2e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.575468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2962  Na+/H+ antiporter NhaA  41.81 
 
 		 481 aa  255  2.0000000000000002e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1861  Na+/H+ antiporter NhaA  38.1 
 
 		 451 aa  251  2e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.995313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2205  Na+/H+ antiporter NhaA  38.1 
 
 		 436 aa  251  3e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.29594  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3123  Na+/H+ antiporter NhaA  39.17 
 
 		 449 aa  250  5e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.158144  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3215  Na+/H+ antiporter NhaA  39.51 
 
 		 456 aa  250  6e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2456  Na+/H+ antiporter  40.56 
 
 		 438 aa  248  2e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00270708  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2570  Na+/H+ antiporter NhaA  38.31 
 
 		 472 aa  248  2e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2666  Na+/H+ antiporter NhaA  42.09 
 
 		 445 aa  244  3e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.657461  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0144  Na+/H+ antiporter NhaA  35.24 
 
 		 446 aa  242  1e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.174095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1784  Na+/H+ antiporter NhaA  33.41 
 
 		 444 aa  242  1e-62  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5554  Na+/H+ antiporter NhaA  38.44 
 
 		 451 aa  243  1e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.477487  normal  0.958846 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3958  sodium-proton antiporter, NhaA family  38.62 
 
 		 453 aa  240  5e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.529436 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1868  Na+/H+ antiporter NhaA  38.98 
 
 		 453 aa  240  5e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.138297 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0585  Na+/H+ antiporter NhaA  41.3 
 
 		 423 aa  239  1e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10430  Na+/H+ antiporter NhaA  39.04 
 
 		 444 aa  238  2e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.745936  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2616  Na+/H+ antiporter NhaA  38.08 
 
 		 391 aa  236  9e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.536675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6362  Na+/H+ antiporter NhaA  38.19 
 
 		 475 aa  236  1.0000000000000001e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2941  pH-dependent sodium/proton antiporter  36.45 
 
 		 394 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.135486  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2853  Na+/H+ antiporter NhaA  38.6 
 
 		 455 aa  235  2.0000000000000002e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3059  Na+/H+ antiporter NhaA  37.53 
 
 		 452 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0065  Na+/H+ antiporter NhaA  35.93 
 
 		 402 aa  234  4.0000000000000004e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000634714  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4069  Na+/H+ antiporter NhaA  35.48 
 
 		 455 aa  233  8.000000000000001e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.16071 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51740  Na+/H+ antiporter NhaA  37.38 
 
 		 446 aa  229  8e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.9845  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0868  pH-dependent sodium/proton antiporter  36.61 
 
 		 391 aa  228  4e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.128339 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1336  pH-dependent sodium/proton antiporter  36.45 
 
 		 389 aa  225  2e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1390  Na+/H+ antiporter NhaA  33.77 
 
 		 391 aa  225  2e-57  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2860  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.08 
 
 		 389 aa  225  2e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.611153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3038  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.19 
 
 		 389 aa  224  3e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.474949 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0842  pH-dependent sodium/proton antiporter  35.25 
 
 		 390 aa  224  4e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2942  pH-dependent sodium/proton antiporter  36.84 
 
 		 389 aa  224  4e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0919251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00573  Na+/H+ antiporter, NhaA  34.47 
 
 		 424 aa  224  4.9999999999999996e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1649  Na+/H+ antiporter NhaA  34.1 
 
 		 468 aa  223  9.999999999999999e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.349535  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1390  pH-dependent sodium/proton antiporter  36.13 
 
 		 391 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000519432  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0407  Na+/H+ antiporter NhaA  37.5 
 
 		 425 aa  221  1.9999999999999999e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05370  NA(+)/H(+) antiporter 1  32.78 
 
 		 435 aa  221  3e-56  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.765198  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0371  Na+/H+ antiporter NhaA  35.08 
 
 		 452 aa  221  3e-56  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0732  pH-dependent sodium/proton antiporter  33.74 
 
 		 409 aa  221  3.9999999999999997e-56  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0043  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.14 
 
 		 388 aa  220  5e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0042  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.14 
 
 		 388 aa  220  5e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.975088  hitchhiker  0.00613874 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0044  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.14 
 
 		 388 aa  220  5e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0043  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.14 
 
 		 388 aa  220  5e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.62168  normal  0.149849 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0044  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.14 
 
 		 388 aa  220  5e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1827  Na+/H+ antiporter NhaA  32.84 
 
 		 382 aa  220  6e-56  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1645  pH-dependent sodium/proton antiporter  33.76 
 
 		 389 aa  220  6e-56  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3828  Na+/H+ antiporter NhaA  38.81 
 
 		 457 aa  220  7e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0371269 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1646  Na+/H+ antiporter NhaA  32.84 
 
 		 382 aa  219  1e-55  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1042  pH-dependent sodium/proton antiporter  36.7 
 
 		 391 aa  218  2e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.12391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4842  Na+/H+ antiporter NhaA  39.41 
 
 		 413 aa  218  2.9999999999999998e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2016  Na+/H+ antiporter NhaA  32.84 
 
 		 382 aa  218  2.9999999999999998e-55  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1147  pH-dependent sodium/proton antiporter  35.96 
 
 		 391 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13458  putative Na+/H+ antiporter  31.55 
 
 		 427 aa  217  5e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.466525  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4662  Na+/H+ antiporter NhaA  34.62 
 
 		 438 aa  217  5.9999999999999996e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000933832 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1826  pH-dependent sodium/proton antiporter  33.25 
 
 		 389 aa  216  8e-55  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.243343  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1537  Na+/H+ antiporter NhaA  35.32 
 
 		 624 aa  216  8e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.192352  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07000  Na+/H+ antiporter NhaA  34.37 
 
 		 514 aa  216  9.999999999999999e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.107154  normal  0.0342501 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2015  pH-dependent sodium/proton antiporter  33.25 
 
 		 389 aa  215  1.9999999999999998e-54  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0694  pH-dependent sodium/proton antiporter  35.47 
 
 		 398 aa  214  2.9999999999999995e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000263731  hitchhiker  0.00301245 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1189  pH-dependent sodium/proton antiporter  35.22 
 
 		 389 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.685573  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00018  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.4 
 
 		 388 aa  214  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.89758  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0017  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.4 
 
 		 388 aa  214  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0016  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.4 
 
 		 388 aa  214  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000467126  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00019  hypothetical protein  37.4 
 
 		 388 aa  214  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.892896  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3638  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.4 
 
 		 388 aa  214  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0019  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.4 
 
 		 388 aa  214  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0237343  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0019  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.4 
 
 		 388 aa  214  3.9999999999999995e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.046286  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3464  pH-dependent sodium/proton antiporter  35.21 
 
 		 394 aa  214  4.9999999999999996e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000517181  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3124  pH-dependent sodium/proton antiporter  35.22 
 
 		 389 aa  214  4.9999999999999996e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.646901  normal  0.440513 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1233  pH-dependent sodium/proton antiporter  35.22 
 
 		 389 aa  214  4.9999999999999996e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0017  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.4 
 
 		 388 aa  213  7e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.453914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1756  Na+/H+ antiporter NhaA  33.5 
 
 		 394 aa  213  7e-54  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1136  pH-dependent sodium/proton antiporter  34.24 
 
 		 399 aa  213  9e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3592  pH-dependent sodium/proton antiporter  34.96 
 
 		 394 aa  213  9e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000151252  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0795  pH-dependent sodium/proton antiporter  35.21 
 
 		 394 aa  212  1e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000129218  normal  0.24433 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1266  pH-dependent sodium/proton antiporter  34.98 
 
 		 389 aa  213  1e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1488  Na+/H+ antiporter  30.88 
 
 		 386 aa  211  2e-53  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3578  Na+/H+ antiporter NhaA  37.14 
 
 		 388 aa  211  3e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00256476  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3129  Na+/H+ antiporter NhaA  44.17 
 
 		 422 aa  211  3e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1390  Na+/H+ antiporter NhaA  35.41 
 
 		 396 aa  210  7e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.168803  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4283  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.75 
 
 		 391 aa  210  7e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4210  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.76 
 
 		 392 aa  209  1e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.400142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2713  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.45 
 
 		 430 aa  209  1e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.532059  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>