26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1866 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_1866  hypothetical protein  100 
 
 
305 aa  613  9.999999999999999e-175  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.786174  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1102  hypothetical protein  53.31 
 
 
313 aa  335  5e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.571582 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0101  hypothetical protein  53.64 
 
 
313 aa  333  3e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.170875  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2833  hypothetical protein  56.01 
 
 
294 aa  326  3e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000938747  normal  0.0171751 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2080  hypothetical protein  52.9 
 
 
313 aa  325  6e-88  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.246474  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3496  hypothetical protein  54.33 
 
 
315 aa  325  7e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1224  hypothetical protein  54.51 
 
 
313 aa  322  6e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1470  hypothetical protein  48.51 
 
 
318 aa  284  1.0000000000000001e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1804  hypothetical protein  50 
 
 
320 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.983819 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0722  hypothetical protein  52.19 
 
 
322 aa  278  6e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.480992  normal  0.605644 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0547  hypothetical protein  51.82 
 
 
318 aa  276  2e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.47713 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2490  hypothetical protein  46.96 
 
 
321 aa  266  5e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1972  hypothetical protein  46.13 
 
 
298 aa  265  5e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0561  hypothetical protein  46.45 
 
 
314 aa  235  9e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0532  hypothetical protein  46.13 
 
 
314 aa  232  5e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.276404  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0564  hypothetical protein  45.98 
 
 
314 aa  231  8.000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2529  hypothetical protein  39.22 
 
 
337 aa  215  9e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0158591  normal  0.0615713 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0491  hypothetical protein  43.38 
 
 
303 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.106811  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4098  hypothetical protein  39.27 
 
 
319 aa  198  7e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.513296  normal  0.84222 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2601  hypothetical protein  40.98 
 
 
313 aa  192  9e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00160673  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5413  hypothetical protein  38.82 
 
 
322 aa  178  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0414957  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8237  hypothetical protein  34.78 
 
 
331 aa  147  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1972  hypothetical protein  31.99 
 
 
307 aa  139  3.9999999999999997e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.238545 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3033  hypothetical protein  28.57 
 
 
295 aa  115  7.999999999999999e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00644621  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1603  hypothetical protein  26.21 
 
 
298 aa  105  1e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0178539  hitchhiker  0.0000000381472 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0048  hypothetical protein  51.11 
 
 
53 aa  50.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>