197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1804 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1804  thioredoxin domain-containing protein  100 
 
 		 314 aa  610  1e-173  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09500  thioredoxin domain-containing protein  40.06 
 
 		 346 aa  191  1e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.460116  normal  0.88242 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1092  Thioredoxin domain protein  47.13 
 
 		 310 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.509026  normal  0.582988 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2327  thioredoxin domain protein  38.75 
 
 		 334 aa  182  7e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000128937 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2594  thioredoxin domain-containing protein  41.12 
 
 		 339 aa  182  7e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.238157  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1282  Thioredoxin domain  48.24 
 
 		 319 aa  180  2.9999999999999997e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00790933  normal  0.585558 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1333  Thioredoxin domain protein  41.46 
 
 		 311 aa  176  5e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1704  thioredoxin domain protein  39.27 
 
 		 310 aa  176  7e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.143587 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2422  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  42.06 
 
 		 319 aa  170  3e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1730  putative thioredoxin domain-containing protein  38.54 
 
 		 313 aa  169  8e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28500  thioredoxin  39.04 
 
 		 299 aa  165  1.0000000000000001e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.173246 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1276  thioredoxin domain protein  38.77 
 
 		 337 aa  160  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10300  thioredoxin domain-containing protein  41.48 
 
 		 313 aa  157  3e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0675  thioredoxin domain-containing protein  36.86 
 
 		 297 aa  156  6e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.357396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3886  Thioredoxin domain protein  40.14 
 
 		 312 aa  155  7e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.54182  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6079  thioredoxin domain protein  41.09 
 
 		 326 aa  152  7e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0921  thioredoxin domain-containing protein  36.25 
 
 		 301 aa  149  5e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.460441 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0364  putative thioredoxin  40.64 
 
 		 320 aa  144  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.163537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19060  thioredoxin domain-containing protein  38.64 
 
 		 299 aa  144  3e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.595284  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4105  Thioredoxin domain protein  42.91 
 
 		 321 aa  143  4e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.118303  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08240  thioredoxin domain-containing protein  39.3 
 
 		 324 aa  140  3.9999999999999997e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3607  thioredoxin domain-containing protein  38.61 
 
 		 300 aa  138  1e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.150797 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1925  Thioredoxin domain-containing protein  33.46 
 
 		 299 aa  137  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3988  thioredoxin domain-containing protein  38.36 
 
 		 300 aa  136  5e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000709703 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1954  Thioredoxin domain protein  34.8 
 
 		 313 aa  135  9.999999999999999e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0686118  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1048  thioredoxin domain-containing protein  38.76 
 
 		 331 aa  134  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.157412  normal  0.991017 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2342  thioredoxin domain-containing protein  37.46 
 
 		 298 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.299917  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2392  putative thioredoxin  37.54 
 
 		 309 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4303  thioredoxin domain-containing protein  37.5 
 
 		 297 aa  129  8.000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.408854  normal  0.611787 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0139  hypothetical protein  30.52 
 
 		 340 aa  125  9e-28  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3683  thioredoxin-related  37.23 
 
 		 329 aa  122  7e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.418332  normal  0.641891 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11356  thioredoxin  33.23 
 
 		 304 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000675127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3862  thioredoxin domain-containing protein  37.45 
 
 		 299 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3936  thioredoxin domain-containing protein  37.45 
 
 		 299 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.201216 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3848  thioredoxin domain-containing protein  37.45 
 
 		 299 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00807359 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1268  Thioredoxin domain protein  34.72 
 
 		 323 aa  108  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3098  thioredoxin  38.44 
 
 		 333 aa  105  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000000032408  hitchhiker  0.0000022841 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1117  thioredoxin-related protein  33.09 
 
 		 324 aa  94.7  2e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0726  thioredoxin  31.45 
 
 		 281 aa  89.7  6e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0681266  normal  0.772091 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3775  thioredoxin  28.06 
 
 		 324 aa  89.4  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.467472 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4099  thioredoxin  27.74 
 
 		 324 aa  89  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.809641  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0796  thioredoxin  29.79 
 
 		 281 aa  87.4  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0505807  normal  0.147714 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1818  thioredoxin  27.93 
 
 		 293 aa  87.4  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0314014 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0779  putative thioredoxin protein  31.1 
 
 		 280 aa  84.3  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.297357  decreased coverage  0.00262303 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2527  thioredoxin  26.9 
 
 		 293 aa  82  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0179199 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3161  thioredoxin domain-containing protein  26.1 
 
 		 289 aa  78.2  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.324735  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1269  putative thioredoxin  26.1 
 
 		 289 aa  78.2  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.204367 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3023  putative thioredoxin  26.1 
 
 		 289 aa  78.2  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4245  thioredoxin  25.5 
 
 		 334 aa  77.8  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.902531  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0822  thioredoxin  30.53 
 
 		 310 aa  77.4  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.606093  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3667  thioredoxin domain-containing protein  26.33 
 
 		 298 aa  77.4  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1155  thioredoxin domain-containing protein  26.55 
 
 		 294 aa  74.3  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.155818  hitchhiker  0.00000315771 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0519  thioredoxin  30.58 
 
 		 280 aa  73.9  0.000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4464  thioredoxin  29.68 
 
 		 302 aa  73.2  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.980457  hitchhiker  0.00575685 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0318  thioredoxin  30.14 
 
 		 287 aa  72.8  0.000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3711  thioredoxin-related  26.98 
 
 		 312 aa  71.2  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0296  thioredoxin  27.02 
 
 		 306 aa  71.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0166723 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3045  thioredoxin  25.17 
 
 		 330 aa  71.2  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004149  thioredoxin domain-containing protein  23.53 
 
 		 284 aa  70.9  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4590  thioredoxin  25.16 
 
 		 304 aa  70.1  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.315091 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2636  thioredoxin  30.58 
 
 		 280 aa  69.3  0.00000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5188  thioredoxin  29.23 
 
 		 302 aa  68.9  0.00000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0306  putative thioredoxin  26.64 
 
 		 305 aa  68.6  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.351153 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3219  thioredoxin  29.97 
 
 		 282 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0268  thioredoxin  26.02 
 
 		 306 aa  67.8  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.223768  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2254  Thioredoxin domain  26.89 
 
 		 338 aa  67.8  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.708544  normal  0.526752 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01318  hypothetical protein  24.41 
 
 		 334 aa  67.8  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0456  thioredoxin  26.58 
 
 		 306 aa  67  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.666195  normal  0.0589835 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1331  putative thioredoxin  23.61 
 
 		 285 aa  66.6  0.0000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5898  thioredoxin  30.58 
 
 		 282 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.769716  normal  0.516195 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0551  thioredoxin domain protein  25.35 
 
 		 293 aa  65.9  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2251  thioredoxin domain-containing protein  28.38 
 
 		 302 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.285443 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0743  thioredoxin  28.92 
 
 		 282 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.328705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2526  Thioredoxin domain  29.47 
 
 		 302 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0422  thioredoxin-related  26.35 
 
 		 306 aa  64.3  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3195  Thioredoxin domain protein  27.4 
 
 		 286 aa  64.7  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.64186  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2894  thioredoxin  27.56 
 
 		 304 aa  64.7  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.225286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0612  thioredoxin domain-containing protein  25.44 
 
 		 293 aa  63.9  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.557632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0560  Thioredoxin domain protein  25.08 
 
 		 272 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0596  protein YbbN  28.04 
 
 		 284 aa  64.3  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0577  thioredoxin domain protein  25.08 
 
 		 272 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0541  protein YbbN  28.04 
 
 		 284 aa  64.3  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0427  protein YbbN  28.04 
 
 		 284 aa  64.3  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0558  thioredoxin domain protein  35.24 
 
 		 293 aa  63.9  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0571  protein YbbN  28.04 
 
 		 284 aa  64.3  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0531  protein YbbN  28.04 
 
 		 284 aa  64.3  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.735174  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0553  thioredoxin domain-containing protein  25.44 
 
 		 293 aa  63.9  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0568  thioredoxin domain protein  25.44 
 
 		 293 aa  63.9  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2485  thioredoxin  27.08 
 
 		 282 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.194267 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0516  thioredoxin  27.4 
 
 		 282 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.695523 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1041  thioredoxin  28.86 
 
 		 289 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0893  thioredoxin  26.27 
 
 		 324 aa  63.2  0.000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2614  thioredoxin  27.08 
 
 		 282 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00443  predicted thioredoxin domain-containing protein  27.36 
 
 		 284 aa  63.2  0.000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3118  Thioredoxin domain protein  27.36 
 
 		 284 aa  63.2  0.000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3124  thioredoxin domain-containing protein  27.36 
 
 		 284 aa  63.2  0.000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000112242 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1982  thioredoxin  28.24 
 
 		 317 aa  63.2  0.000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00653306  normal  0.106397 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00448  hypothetical protein  27.36 
 
 		 284 aa  63.2  0.000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3284  thioredoxin  25.78 
 
 		 320 aa  62.4  0.000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0266  thioredoxin  26.33 
 
 		 301 aa  62  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>