More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1790 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1790  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 268 aa  542  1e-153  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.911201  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5046  alpha/beta hydrolase fold protein  56.25 
 
 		 281 aa  256  3e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.186398  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2022  alpha/beta hydrolase fold protein  51.74 
 
 		 265 aa  242  5e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0500364  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15660  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  46.18 
 
 		 277 aa  221  8e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0398174  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14730  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  47.37 
 
 		 264 aa  212  5.999999999999999e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.31361 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5337  alpha/beta hydrolase fold protein  41.86 
 
 		 264 aa  185  8e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0345321  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2707  Alpha/beta hydrolase fold  43.08 
 
 		 264 aa  181  2e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0356  alpha/beta hydrolase fold  41.46 
 
 		 256 aa  177  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.122696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2781  alpha/beta hydrolase fold  45.74 
 
 		 261 aa  177  1e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2479  alpha/beta hydrolase fold  40.65 
 
 		 256 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.261597 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0821  esterase/lipase/thioesterase  40.65 
 
 		 256 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3436  alpha/beta hydrolase  41 
 
 		 256 aa  173  1.9999999999999998e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0918  alpha/beta hydrolase fold  40.78 
 
 		 255 aa  164  1.0000000000000001e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.891406  normal  0.241554 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04345  alpha/beta superfamily hydrolase  36.05 
 
 		 253 aa  162  5.0000000000000005e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.660124  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0820  alpha/beta hydrolase fold protein  44.72 
 
 		 255 aa  160  2e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1586  alpha/beta hydrolase fold  39.18 
 
 		 252 aa  160  3e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.869545 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2510  alpha/beta hydrolase fold protein  40.08 
 
 		 267 aa  160  3e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00182924  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3012  alpha/beta hydrolase fold protein  37.21 
 
 		 257 aa  158  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2849  alpha/beta hydrolase fold  39.84 
 
 		 254 aa  155  9e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1759  Alpha/beta hydrolase fold hydrolase or acyltransferase  35.89 
 
 		 265 aa  154  1e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.11889  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0351  putative hydrolase/acyltransferase  40.08 
 
 		 259 aa  154  2e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5071  alpha/beta hydrolase fold protein  35.11 
 
 		 258 aa  154  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.1456  normal  0.556154 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0507  alpha/beta hydrolase fold  34.87 
 
 		 264 aa  152  4e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1913  alpha/beta hydrolase fold  34.62 
 
 		 257 aa  151  1e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000359899  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1209  esterase/lipase  32.28 
 
 		 311 aa  149  5e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1239  alpha/beta hydrolase fold  38.06 
 
 		 257 aa  148  8e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000413614  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00325  alpha/beta hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G02390)  37.4 
 
 		 295 aa  147  1.0000000000000001e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3298  hypothetical protein  36 
 
 		 258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.24994 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2149  alpha/beta hydrolase fold  35.02 
 
 		 227 aa  146  3e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1030  alpha/beta hydrolase fold  38.7 
 
 		 264 aa  145  6e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1920  alpha/beta hydrolase fold  37.31 
 
 		 255 aa  142  7e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389314  unclonable  0.00000223856 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2334  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 258 aa  142  8e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000909068  hitchhiker  0.0000846948 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1935  alpha/beta hydrolase  36.58 
 
 		 268 aa  139  3.9999999999999997e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1699  alpha/beta hydrolase fold  32.68 
 
 		 254 aa  139  4.999999999999999e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004122  putative esterase/lipase ybfF  32.93 
 
 		 255 aa  139  6e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000112375  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2273  alpha/beta hydrolase fold  31.4 
 
 		 259 aa  138  7.999999999999999e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000254072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1201  hypothetical protein  35.94 
 
 		 257 aa  137  2e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000612925  hitchhiker  0.000217368 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2240  alpha/beta hydrolase fold protein  33.2 
 
 		 258 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000309374  hitchhiker  0.000000000781643 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1579  alpha/beta fold family hydrolase  32.41 
 
 		 265 aa  136  3.0000000000000003e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2033  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 266 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000295645  hitchhiker  0.000143979 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01088  hypothetical esterase/lipase ybfF  33.18 
 
 		 230 aa  136  4e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000642463  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1942  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 266 aa  136  4e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000178977  hitchhiker  0.00172948 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2054  alpha/beta hydrolase fold  32.93 
 
 		 252 aa  136  4e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0866141  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01343  hypothetical protein  32.66 
 
 		 255 aa  135  5e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2194  alpha/beta hydrolase fold  32.81 
 
 		 258 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000635452  unclonable  0.000004336 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2136  alpha/beta hydrolase fold  32.93 
 
 		 266 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000406984  decreased coverage  0.00000741326 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2227  alpha/beta hydrolase fold  32.81 
 
 		 258 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000690683  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_21912  predicted protein  34.38 
 
 		 261 aa  133  1.9999999999999998e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4513  hypothetical protein  32.81 
 
 		 258 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3121  hypothetical protein  34.43 
 
 		 259 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000331929  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2179  alpha/beta hydrolase fold protein  36 
 
 		 271 aa  133  3e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2144  alpha/beta hydrolase fold  32.81 
 
 		 258 aa  132  5e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000412012  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0837  putative esterase  30.12 
 
 		 258 aa  132  6e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0877  alpha/beta hydrolase fold  30.36 
 
 		 260 aa  132  6e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3762  alpha/beta hydrolase fold  35.74 
 
 		 260 aa  132  6.999999999999999e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.543729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3402  esterase/lipase  34.02 
 
 		 235 aa  132  6.999999999999999e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1210  hypothetical protein  34.02 
 
 		 259 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000115762  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1037  alpha/beta hydrolase fold  36.64 
 
 		 226 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1704  alpha/beta fold family hydrolase  33.2 
 
 		 262 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000659233  normal  0.0248748 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0817  hypothetical protein  33.73 
 
 		 256 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000104367  normal  0.28548 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3000  alpha/beta hydrolase fold  31.52 
 
 		 253 aa  130  3e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1683  hydrolase  35.2 
 
 		 257 aa  129  4.0000000000000003e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000746451  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0319  hypothetical protein  33.2 
 
 		 255 aa  129  5.0000000000000004e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000242239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1880  alpha/beta hydrolase fold  32.26 
 
 		 258 aa  129  6e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000336147  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0853  hypothetical protein  33.33 
 
 		 256 aa  129  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.000000437553  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1121  hypothetical protein  33.47 
 
 		 260 aa  128  8.000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.848062  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2986  hypothetical protein  33.2 
 
 		 255 aa  128  8.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.33197  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2898  hypothetical protein  33.2 
 
 		 255 aa  128  9.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000114451  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0804  hypothetical protein  33.33 
 
 		 256 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000284969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0756  hypothetical protein  33.33 
 
 		 256 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000320823  normal  0.242139 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0743  hypothetical protein  33.33 
 
 		 256 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.000000000000786446  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1987  alpha/beta hydrolase fold  33.08 
 
 		 253 aa  127  3e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000145275  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0708  hypothetical protein  32.93 
 
 		 254 aa  125  6e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000135641  normal  0.38067 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2935  hypothetical protein  33.88 
 
 		 260 aa  124  2e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.568847  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2333  alpha/beta fold family hydrolase  32.26 
 
 		 280 aa  123  3e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0714  hypothetical protein  32.52 
 
 		 254 aa  123  3e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000145499  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00643  hypothetical protein  32.52 
 
 		 254 aa  122  8e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000010714  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2970  hypothetical protein  32.52 
 
 		 254 aa  122  8e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000312971  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00634  hypothetical protein  32.52 
 
 		 254 aa  122  8e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000490791  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0733  hypothetical protein  32.52 
 
 		 254 aa  122  8e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  5.4403099999999995e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0781  hypothetical protein  32.11 
 
 		 254 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000454581  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2951  alpha/beta hydrolase fold protein  32.11 
 
 		 254 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000161502  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57391  predicted protein  35.23 
 
 		 306 aa  119  3.9999999999999996e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.209701  normal  0.500519 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0564  hypothetical protein  31.71 
 
 		 254 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000000107362  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA05610  mitochondrion protein, putative  32.05 
 
 		 356 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.372927  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0519  alpha/beta hydrolase fold protein  32.95 
 
 		 256 aa  114  1.0000000000000001e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1485  alpha/beta hydrolase fold  33.73 
 
 		 263 aa  109  5e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.188866 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0865  alpha/beta hydrolase fold  32.85 
 
 		 298 aa  103  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.320607 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6042  alpha/beta hydrolase fold  34.06 
 
 		 298 aa  102  8e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.567915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54655  predicted protein  27.82 
 
 		 293 aa  97.1  3e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5753  alpha/beta hydrolase fold  29.89 
 
 		 298 aa  86.3  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.766272  normal  0.921974 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5377  alpha/beta hydrolase fold  29.89 
 
 		 298 aa  86.3  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5466  alpha/beta hydrolase fold  29.89 
 
 		 298 aa  86.3  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0306241 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1720  thioesterase, menaquinone synthesis protein  27.66 
 
 		 265 aa  85.9  7e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  29.85 
 
 		 282 aa  85.9  7e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  31.11 
 
 		 299 aa  84.3  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  26.25 
 
 		 275 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0174  cyclic nucleotide-binding protein  29.93 
 
 		 456 aa  82.8  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000271627  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2432  alpha/beta hydrolase fold  27.64 
 
 		 277 aa  82  0.000000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10044  hydrolase  30.04 
 
 		 298 aa  80.1  0.00000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>