207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1774 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_1774  Ferritin, Dps family protein  100 
 
 
174 aa  349  8.999999999999999e-96  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1471  Ferritin Dps family protein  66.67 
 
 
174 aa  244  6e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5518  Ferritin Dps family protein  66.46 
 
 
177 aa  216  1e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0082  Ferritin Dps family protein  53.99 
 
 
187 aa  174  5e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0171  Ferritin Dps family protein  50.88 
 
 
183 aa  171  5e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5666  Ferritin, Dps family protein  48.82 
 
 
196 aa  163  9e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324809  normal  0.0103566 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2235  Ferritin Dps family protein  51.59 
 
 
184 aa  161  5.0000000000000005e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000308738  normal  0.753428 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00970  ferritin-like protein  46.47 
 
 
182 aa  157  1e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13875  bacterioferritin bfrB  48.24 
 
 
181 aa  155  3e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000321537  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3490  Ferritin Dps family protein  46.86 
 
 
176 aa  155  4e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1141  Ferritin, Dps family protein  49.35 
 
 
187 aa  154  6e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.406209  normal  0.0967189 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5419  Ferritin, Dps family protein  48.08 
 
 
181 aa  150  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.920475  normal  0.703804 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5039  Ferritin and Dps  47.44 
 
 
181 aa  149  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.869277  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5127  Ferritin, Dps family protein  47.44 
 
 
181 aa  149  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3258  Ferritin, Dps family protein  45.91 
 
 
196 aa  143  1e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000744438  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3193  Ferritin Dps family protein  43.5 
 
 
192 aa  138  3.9999999999999997e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.827708  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0917  Ferritin Dps family protein  42.86 
 
 
165 aa  120  8e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.076232 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0573  Ferritin Dps family protein  34.12 
 
 
171 aa  102  4e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2260  Ferritin Dps family protein  38.12 
 
 
170 aa  97.1  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739627  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1381  ferroxidase  31.29 
 
 
162 aa  97.1  1e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000220076  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2555  cytoplasmic ferritin (an iron storage protein)  34.69 
 
 
174 aa  96.3  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000856866  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3808  Ferroxidase  36.23 
 
 
166 aa  96.3  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.057799  normal  0.375951 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6539  Ferritin Dps family protein  38.02 
 
 
176 aa  93.2  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.973659  normal  0.877089 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3287  ferroxidase  34.88 
 
 
167 aa  90.1  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.492648 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2683  Ferritin Dps family protein  34.97 
 
 
168 aa  89.7  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000192038  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1120  Ferritin and Dps  34.62 
 
 
176 aa  87.4  9e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0794  Ferritin, Dps family protein  36.29 
 
 
162 aa  86.7  1e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.413552  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0668  Ferritin, Dps family protein  33.11 
 
 
173 aa  87  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000253889  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0514  Ferroxidase  36.92 
 
 
171 aa  86.3  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0298672  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1580  Ferroxidase  37.98 
 
 
161 aa  85.9  2e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0301  Ferritin Dps family protein  36.43 
 
 
171 aa  85.9  2e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.384105 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1855  ferroxidase  34.06 
 
 
167 aa  86.7  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.185397  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0183  Ferroxidase  33.33 
 
 
171 aa  83.2  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000415099 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2947  ferritin-1  31.88 
 
 
175 aa  83.2  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1570  Ferritin Dps family protein  30.97 
 
 
170 aa  82.8  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3795  Ferritin Dps family protein  33.33 
 
 
164 aa  82  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1047  ferritin family protein  31.29 
 
 
170 aa  81.6  0.000000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000219081  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0556  Ferroxidase  33.33 
 
 
164 aa  81.3  0.000000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.729145 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2055  Ferritin, Dps family protein  28.81 
 
 
180 aa  81.3  0.000000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1617  ferroxidase  35.61 
 
 
163 aa  80.9  0.000000000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1286  ferritin  35.66 
 
 
160 aa  80.1  0.00000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2915  Ferritin Dps family protein  36.51 
 
 
172 aa  80.9  0.00000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4070  Ferroxidase  29.71 
 
 
163 aa  80.5  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000582999  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0136  ferroxidase  30.6 
 
 
163 aa  80.5  0.00000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1417  Ferritin, Dps family protein  33.33 
 
 
477 aa  79.7  0.00000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.672338  normal  0.285216 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4374  ferroxidase  33.85 
 
 
175 aa  79  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0134844  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7185  Ferroxidase  32.06 
 
 
165 aa  79  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1983  Ferritin Dps family protein  30.43 
 
 
172 aa  79  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0282013  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01880  ferritin-like protein  32.56 
 
 
171 aa  79.3  0.00000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0449  ferritin, putative  32.09 
 
 
160 aa  79  0.00000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000133256  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0715  nonheme iron-containing ferritin  32.58 
 
 
167 aa  78.6  0.00000000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1965  Ferritin, Dps family protein  29.25 
 
 
177 aa  78.6  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0804  ferritin  28.48 
 
 
164 aa  78.6  0.00000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0641  nonheme iron-containing ferritin  32.58 
 
 
167 aa  78.6  0.00000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5201  ferritin  34.97 
 
 
168 aa  78.2  0.00000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000941544  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0046  ferritin  34.97 
 
 
168 aa  78.2  0.00000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000030835  hitchhiker  1.9165399999999998e-20 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2507  Ferritin Dps family protein  34.71 
 
 
174 aa  78.2  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000415587  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0596  Ferritin, Dps family protein  33.33 
 
 
164 aa  78.2  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1058  nonheme iron-containing ferritin  32.58 
 
 
167 aa  78.2  0.00000000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5196  ferritin  34.97 
 
 
168 aa  78.2  0.00000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00124859  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4919  ferritin  34.97 
 
 
168 aa  78.2  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4764  ferritin  34.97 
 
 
168 aa  78.2  0.00000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000763521  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4783  ferritin  34.97 
 
 
168 aa  77.8  0.00000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31249  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5296  ferritin  34.97 
 
 
168 aa  78.2  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0123556  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5164  ferritin  34.97 
 
 
168 aa  78.2  0.00000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.57868e-47 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0328  ferroxidase  28.99 
 
 
170 aa  77.8  0.00000000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.962185  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4880  Ferritin Dps family protein  34.97 
 
 
168 aa  77.8  0.00000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00199979  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1236  ferritin family protein  29.93 
 
 
170 aa  77.4  0.00000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000720561  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1683  ferroxidase  34.85 
 
 
163 aa  77.8  0.00000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0042  Ferritin, Dps family protein  33.08 
 
 
174 aa  77.8  0.00000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.97905  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5211  ferritin  34.27 
 
 
168 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000025071  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001945  ferritin-like protein 2  31.16 
 
 
175 aa  77  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1947  Ferritin, Dps family protein  35.37 
 
 
166 aa  77.4  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0631394  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1981  Ferritin Dps family protein  35.37 
 
 
166 aa  77.4  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1431  ferritin family protein  33.33 
 
 
166 aa  76.3  0.0000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.858938  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0129  ferroxidase  32.31 
 
 
175 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0921  ferritin like protein 2  31.16 
 
 
165 aa  76.3  0.0000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.454183  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0866  ferroxidase  29.71 
 
 
172 aa  76.3  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.761126  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3978  Ferritin Dps family protein  36.36 
 
 
167 aa  75.5  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.445069  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4766  ferroxidase  33.08 
 
 
175 aa  75.5  0.0000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.266112  unclonable  0.0000000121988 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0016  Ferritin and Dps  33.86 
 
 
159 aa  75.5  0.0000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1860  Ferritin Dps family protein  31.2 
 
 
164 aa  75.1  0.0000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00316362  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0043  Ferritin Dps family protein  31.88 
 
 
171 aa  75.1  0.0000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0690  Ferritin, Dps family protein  34.71 
 
 
172 aa  74.7  0.0000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0177  Ferritin and Dps  27.33 
 
 
166 aa  74.3  0.0000000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0132  Ferritin, Dps family protein  31.54 
 
 
178 aa  74.3  0.0000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0137  ferroxidase  30.77 
 
 
178 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0136  Ferroxidase  30.77 
 
 
178 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00534  ferritin  31.88 
 
 
175 aa  73.9  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0118  Ferritin, Dps family protein  31.03 
 
 
172 aa  73.9  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.38357  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4222  ferroxidase  30.77 
 
 
178 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0132  ferroxidase  30.77 
 
 
178 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2519  Ferritin Dps family protein  30.77 
 
 
172 aa  73.9  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00323772  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1199  ferroxidase  27.34 
 
 
169 aa  73.9  0.000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0733743  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0139  ferritin  30.77 
 
 
178 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0617  Ferritin Dps family protein  34.11 
 
 
165 aa  72.8  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.433385 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1700  Ferroxidase  30.77 
 
 
172 aa  73.2  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000548628 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2437  ferritin  30.43 
 
 
181 aa  72.8  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30880  ferritin-like protein  36.72 
 
 
173 aa  72.8  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1703  Ferroxidase  34.62 
 
 
164 aa  72.8  0.000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.428586  hitchhiker  0.0000000000044787 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>