221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1769 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1769  major facilitator transporter  100 
 
 		 388 aa  740    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.632189  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2537  major facilitator transporter  49.35 
 
 		 404 aa  303  3.0000000000000004e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.274022  normal  0.434493 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2534  major facilitator transporter  50.9 
 
 		 417 aa  290  3e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.441567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4261  major facilitator superfamily MFS_1  45.74 
 
 		 427 aa  287  2.9999999999999996e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.426527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0602  major facilitator superfamily MFS_1  47.41 
 
 		 413 aa  278  2e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.101866  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3179  major facilitator superfamily MFS_1  46.97 
 
 		 413 aa  271  1e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0130031 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3060  major facilitator superfamily MFS_1  48.53 
 
 		 402 aa  262  6e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.154269  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2714  major facilitator transporter  49.74 
 
 		 404 aa  259  4e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.773773  hitchhiker  0.00188089 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0666  major facilitator superfamily MFS_1  49.57 
 
 		 409 aa  259  4e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0347459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3874  major facilitator superfamily MFS_1  55 
 
 		 397 aa  251  1e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.369996  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3917  major facilitator superfamily MFS_1  45.04 
 
 		 397 aa  249  7e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3025  major facilitator transporter  45.34 
 
 		 433 aa  247  3e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4139  major facilitator transporter  43.08 
 
 		 400 aa  246  4e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.896136  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2689  major facilitator superfamily MFS_1  48.36 
 
 		 433 aa  245  9.999999999999999e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1875  hypothetical protein  39.29 
 
 		 397 aa  241  2e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3079  major facilitator transporter  38.06 
 
 		 397 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0284057  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0566  major facilitator superfamily MFS_1  40.4 
 
 		 425 aa  238  1e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00689697 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2780  major facilitator superfamily MFS_1  42.7 
 
 		 395 aa  236  4e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.109964  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2690  major facilitator superfamily MFS_1  40.94 
 
 		 464 aa  227  3e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3154  hypothetical protein  36.27 
 
 		 397 aa  225  8e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000811574  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3401  hypothetical protein  36.27 
 
 		 397 aa  225  8e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0773641  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3180  major facilitator superfamily MFS_1  44.05 
 
 		 446 aa  226  8e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0150137 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3376  hypothetical protein  36.43 
 
 		 397 aa  225  1e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2737  major facilitator superfamily MFS_1  45.29 
 
 		 423 aa  218  1e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00369572 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31500  fucose permease  41.1 
 
 		 404 aa  213  3.9999999999999995e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4303  major facilitator superfamily MFS_1  39.1 
 
 		 433 aa  209  6e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.530625  normal  0.111618 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2374  major facilitator superfamily MFS_1  36.32 
 
 		 401 aa  208  1e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2088  major facilitator superfamily MFS_1  34.78 
 
 		 398 aa  206  5e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3706  major facilitator superfamily transporter  35.32 
 
 		 390 aa  205  1e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.62913 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0049  major facilitator superfamily MFS_1  37.5 
 
 		 480 aa  204  2e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.200181  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00812  predicted transporter  35.92 
 
 		 402 aa  199  5e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.490752  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2797  major facilitator superfamily MFS_1  35.92 
 
 		 402 aa  199  5e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.354207  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00829  hypothetical protein  35.92 
 
 		 402 aa  199  5e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.48628  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0998  transporter, major facilitator family  35.4 
 
 		 402 aa  199  5e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.207413 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07710  Major Facilitator Superfamily transporter  34.7 
 
 		 502 aa  199  5e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.18857  normal  0.036031 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0917  major facilitator transporter  35.92 
 
 		 402 aa  199  5e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0972  inner membrane protein YbjJ  35.26 
 
 		 403 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.929819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0907  major facilitator transporter  35.66 
 
 		 402 aa  199  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.379242  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0872  major facilitator transporter  35.66 
 
 		 402 aa  199  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2500  transporter, major facilitator family  35.66 
 
 		 402 aa  197  3e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0940  inner membrane protein YbjJ  35.26 
 
 		 403 aa  197  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0904  inner membrane protein YbjJ  34.76 
 
 		 403 aa  196  8.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1001  hypothetical protein  34.76 
 
 		 403 aa  196  8.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.705543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0565  major facilitator superfamily MFS_1  37.23 
 
 		 443 aa  195  1e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.308939  normal  0.0136421 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1020  inner membrane protein YbjJ  34.76 
 
 		 403 aa  195  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.241467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3724  major facilitator superfamily MFS_1  43.04 
 
 		 391 aa  195  1e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.830199  normal  0.0194681 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1336  major facilitator transporter  34.52 
 
 		 404 aa  194  2e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18420  fucose permease  36.54 
 
 		 414 aa  194  3e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.29199 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2797  major facilitator transporter  35.73 
 
 		 375 aa  193  4e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.569839  normal  0.408376 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2654  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 391 aa  192  6e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0704  integral membrane protein  39.84 
 
 		 282 aa  162  7e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.64582  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2159  major facilitator superfamily MFS_1  32.41 
 
 		 391 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0853792  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0923  major facilitator superfamily MFS_1  30.83 
 
 		 385 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2244  major facilitator transporter  36.1 
 
 		 400 aa  137  3.0000000000000003e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.802988 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3048  sugar (and other) transporter, C-terminal region  40.45 
 
 		 182 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00412524  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18660  hypothetical protein  30.56 
 
 		 383 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.166024 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1853  putative transporter  32.91 
 
 		 417 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117056  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3134  major facilitator transporter  32 
 
 		 396 aa  130  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0461  major facilitator superfamily MFS_1  33.96 
 
 		 381 aa  130  5.0000000000000004e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6975  major facilitator transporter  32.9 
 
 		 385 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.868376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1165  major facilitator superfamily MFS_1  28.9 
 
 		 387 aa  129  8.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.104586 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4331  MFS permease  30.79 
 
 		 384 aa  128  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.611947  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3832  major facilitator superfamily MFS_1  30.08 
 
 		 397 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2151  major facilitator superfamily MFS_1  27.3 
 
 		 388 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000894415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4432  major facilitator transporter  34.54 
 
 		 388 aa  128  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00669065 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1615  hypothetical protein  30 
 
 		 383 aa  127  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1715  putative transporter  28.18 
 
 		 397 aa  126  7e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1121  major facilitator transporter  27.65 
 
 		 397 aa  126  8.000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1512  major facilitator transporter  32.39 
 
 		 385 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6317  major facilitator transporter  32.39 
 
 		 385 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.384124 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2285  major facilitator transporter  25.9 
 
 		 386 aa  124  3e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15630  hypothetical protein  29.81 
 
 		 432 aa  123  5e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0399318  hitchhiker  3.8947399999999994e-20 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0840  major facilitator superfamily MFS_1  30.28 
 
 		 405 aa  122  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4160  major facilitator superfamily MFS_1  28.21 
 
 		 396 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1167  major facilitator transporter  24.93 
 
 		 405 aa  120  6e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2464  major facilitator superfamily MFS_1  25.97 
 
 		 387 aa  119  7e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.163506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1552  major facilitator superfamily MFS_1  28.61 
 
 		 386 aa  119  7.999999999999999e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1047  major facilitator superfamily MFS_1  34.32 
 
 		 387 aa  119  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.743504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3423  major facilitator superfamily MFS_1  28.77 
 
 		 402 aa  118  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30800  fucose permease  31.2 
 
 		 414 aa  115  1.0000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2868  major facilitator transporter  30.19 
 
 		 399 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2912  major facilitator superfamily transporter  30.19 
 
 		 399 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.452412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2898  major facilitator transporter  30.19 
 
 		 399 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.681989 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7621  major facilitator superfamily permease  30.13 
 
 		 398 aa  115  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.262333 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3086  major facilitator superfamily MFS_1  34.19 
 
 		 391 aa  114  3e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.269541 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04660  Major Facilitator Superfamily transporter  30.03 
 
 		 393 aa  113  5e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4432  major facilitator transporter  31.01 
 
 		 419 aa  113  5e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2808  major facilitator superfamily MFS_1  30.13 
 
 		 398 aa  112  8.000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.794185  normal  0.146653 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2952  major facilitator superfamily MFS_1  32.81 
 
 		 379 aa  112  9e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.105005 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3174  major facilitator superfamily transporter  31.47 
 
 		 396 aa  112  9e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.273368  normal  0.04307 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1162  major facilitator transporter  31.32 
 
 		 384 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.019331  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8644  major facilitator superfamily MFS_1  31.44 
 
 		 407 aa  109  7.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.700499 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5723  major facilitator superfamily MFS_1  29.26 
 
 		 378 aa  109  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.871136 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8112  major facilitator transporter  30.18 
 
 		 396 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.743041 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2626  putative major facilitator superfamily (MFS) transporter  31.44 
 
 		 392 aa  108  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.686935  hitchhiker  0.0081174 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3330  major facilitator transporter  29.33 
 
 		 391 aa  108  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1109  major facilitator superfamily MFS_1  31.92 
 
 		 389 aa  106  8e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0848827  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6269  major facilitator superfamily MFS_1  26.85 
 
 		 394 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.280386  normal  0.421192 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1509  major facilitator superfamily MFS_1  25.28 
 
 		 387 aa  105  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.553774  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5733  major facilitator superfamily MFS_1  28.05 
 
 		 394 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.594753  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>