More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1767 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_1767  FAD linked oxidase domain-containing protein  100 
 
 
484 aa  952    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.778905  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0061  FAD linked oxidase domain protein  58.37 
 
 
474 aa  487  1e-136  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1620  FAD linked oxidase domain protein  52.16 
 
 
465 aa  409  1e-113  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.600504  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1435  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.18 
 
 
462 aa  243  7e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.910534  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1417  FAD linked oxidase-like protein  36.18 
 
 
462 aa  243  7e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1816  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.07 
 
 
460 aa  242  1e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0655989  normal  0.012595 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1471  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.81 
 
 
462 aa  238  1e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6967  oxidoreductase, FAD-dependent  36.73 
 
 
460 aa  236  8e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.581883 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1883  FAD linked oxidase domain protein  35.11 
 
 
462 aa  230  4e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000001515  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4651  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.84 
 
 
462 aa  224  2e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.338628  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7186  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.02 
 
 
473 aa  223  8e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.73776  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1027  FAD/FMN-containing dehydrogenase  36 
 
 
436 aa  219  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.548155  normal  0.360167 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6811  FAD/FMN-containing dehydrogenase-like protein  33.92 
 
 
596 aa  207  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1621  FAD linked oxidase domain protein  36.02 
 
 
468 aa  207  3e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2430  FAD linked oxidase domain protein  35.54 
 
 
459 aa  196  6e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000620146  normal  0.138472 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2767  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.65 
 
 
461 aa  196  1e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0847094 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4754  FAD linked oxidase domain protein  35.23 
 
 
467 aa  194  4e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.13941 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1506  FAD linked oxidase-like  31.44 
 
 
461 aa  192  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.290263  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3122  FAD linked oxidase domain protein  34.03 
 
 
449 aa  189  7e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461384  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4422  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.22 
 
 
479 aa  187  4e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.344156  normal  0.908517 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2203  FAD linked oxidase domain protein  31.59 
 
 
479 aa  183  7e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.614292  normal  0.138199 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001560  putative oxidoreductase oxygen dependent FAD-dependent protein  29.01 
 
 
461 aa  182  1e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2907  FAD linked oxidase domain protein  33.55 
 
 
470 aa  181  2e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.777851  normal  0.173158 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2737  FAD linked oxidase domain protein  31.78 
 
 
459 aa  181  2e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000391962  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2408  FAD linked oxidase domain protein  32.89 
 
 
469 aa  180  4.999999999999999e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.359898  decreased coverage  0.00141792 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5365  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.87 
 
 
464 aa  178  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.874918 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1606  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.12 
 
 
472 aa  177  3e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.935495 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2459  FAD linked oxidase-like  31.46 
 
 
479 aa  175  1.9999999999999998e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.6744  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1085  FAD linked oxidase-like  29.7 
 
 
478 aa  172  2e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.439426  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1992  FAD linked oxidase domain protein  30.43 
 
 
479 aa  171  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.918522 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7882  FAD/FMN-containing dehydrogenase  31.7 
 
 
436 aa  169  9e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1864  FAD linked oxidase domain protein  29.84 
 
 
458 aa  168  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.105212  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1488  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.95 
 
 
461 aa  166  8e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2627  FAD linked oxidase domain protein  30.24 
 
 
468 aa  164  2.0000000000000002e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0898791  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3469  FAD linked oxidase-like protein  29.65 
 
 
463 aa  164  4.0000000000000004e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3750  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.71 
 
 
444 aa  164  4.0000000000000004e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.589145  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2335  FAD linked oxidase-like  28.07 
 
 
474 aa  161  3e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.822844  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1926  FAD linked oxidase domain protein  31.52 
 
 
476 aa  161  3e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47869  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1762  FAD linked oxidase domain protein  37.73 
 
 
499 aa  160  4e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000896481 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0394  FAD linked oxidase domain protein  32.24 
 
 
441 aa  160  4e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1824  FAD linked oxidase domain protein  33.26 
 
 
439 aa  157  5.0000000000000005e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1775  FAD linked oxidase-like protein  33.05 
 
 
463 aa  155  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.719303 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3377  FAD linked oxidase-like  28.76 
 
 
473 aa  154  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0469731  normal  0.191861 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4911  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.23 
 
 
465 aa  154  4e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0071  FAD linked oxidase domain protein  31.18 
 
 
466 aa  154  5e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4415  FAD linked oxidase, N-terminal  30.29 
 
 
456 aa  151  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3463  FAD linked oxidase domain protein  30.32 
 
 
465 aa  152  2e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0060  putative oxidoreductase, oxygen dependent, FAD-dependent protein  30.09 
 
 
465 aa  151  3e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2025  FAD-binding protein  26.32 
 
 
448 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5399  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.11 
 
 
478 aa  148  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4023  FAD linked oxidase domain protein  30.16 
 
 
602 aa  147  4.0000000000000006e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3666  FAD linked oxidase domain protein  31.74 
 
 
446 aa  147  4.0000000000000006e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.979447  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1025  FAD linked oxidase domain protein  29.89 
 
 
465 aa  147  6e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3564  FAD linked oxidase domain protein  34.2 
 
 
460 aa  146  7.0000000000000006e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.293473  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1637  FAD linked oxidase, N-terminal  28.51 
 
 
461 aa  146  7.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2915  FAD linked oxidase domain protein  34.31 
 
 
455 aa  146  8.000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000548663  hitchhiker  0.00007682 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2962  FAD linked oxidase domain protein  30.97 
 
 
465 aa  145  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0158537  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3657  FAD linked oxidase domain protein  31.34 
 
 
456 aa  145  2e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0260627  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11743  oxidoreductase  31.86 
 
 
461 aa  144  3e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0117669  normal  0.752588 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0426  FAD linked oxidase-like protein  30.2 
 
 
465 aa  142  9.999999999999999e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2688  FAD linked oxidase domain protein  31.05 
 
 
452 aa  140  4.999999999999999e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.70388  normal  0.409872 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1030  FAD linked oxidase domain protein  31.39 
 
 
477 aa  139  1e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2260  FAD linked oxidase domain protein  41.26 
 
 
466 aa  139  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00839199  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1360  FAD/FMN-containing dehydrogenase  27.45 
 
 
473 aa  137  4e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00315473  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2207  FAD linked oxidase domain protein  34.38 
 
 
456 aa  137  5e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4138  FAD linked oxidase domain protein  29.87 
 
 
470 aa  137  6.0000000000000005e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4454  FAD linked oxidase domain protein  31.07 
 
 
462 aa  136  9e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0421641  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1407  FAD linked oxidase-like  29.01 
 
 
460 aa  134  5e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0773  putative FAD/FMN-containing oxidoreductase  34.16 
 
 
462 aa  134  5e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.563549  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3339  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.33 
 
 
448 aa  133  9e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.235624  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1304  FAD linked oxidase domain protein  28.35 
 
 
456 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0717469  normal  0.684944 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04780  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  31.2 
 
 
469 aa  132  2.0000000000000002e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.62663  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1804  FAD linked oxidase-like  29.76 
 
 
473 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00332  FAD linked oxidase, N-terminal  30.99 
 
 
705 aa  129  1.0000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3462  FAD linked oxidase domain protein  29.66 
 
 
477 aa  127  6e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2731  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.3 
 
 
472 aa  126  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0114478  normal  0.981249 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3488  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.23 
 
 
474 aa  126  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.953836  normal  0.585034 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2149  FAD linked oxidase domain protein  31.28 
 
 
458 aa  121  3e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2398  FAD linked oxidase domain protein  29.65 
 
 
461 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.349533  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0351  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.54 
 
 
466 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1448  histidine kinase  29.76 
 
 
487 aa  114  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.253596 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2763  putative F420-dependent oxidoreductase  30.26 
 
 
758 aa  114  6e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1131  FAD linked oxidase domain protein  32.33 
 
 
447 aa  112  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4534  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.41 
 
 
490 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.021743 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1637  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.57 
 
 
449 aa  111  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4113  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.43 
 
 
492 aa  111  3e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.974698  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0426  FAD-dependent oxidase  28.32 
 
 
444 aa  108  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0166645  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4892  FAD-dependent oxidase  26.88 
 
 
444 aa  108  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.070023  normal  0.492965 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4344  FAD linked oxidase domain protein  29.82 
 
 
450 aa  103  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.577793 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6331  FAD linked oxidase domain protein  29.35 
 
 
480 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00000929143  hitchhiker  0.000833417 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0639  FAD linked oxidase domain protein  33.09 
 
 
454 aa  103  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3087  FAD linked oxidase-like protein  35.4 
 
 
752 aa  102  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4161  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.51 
 
 
481 aa  100  4e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.127366 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2543  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.05 
 
 
456 aa  100  4e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05846  FAD binding oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G14630)  30.82 
 
 
472 aa  100  6e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000469  probable oxidoreductase  26.53 
 
 
563 aa  100  7e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0940249  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6057  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.11 
 
 
451 aa  99.4  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0318  putative oxidoreductase, oxygen dependent, FAD-dependent protein  30.96 
 
 
491 aa  99.8  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000970405  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0347  FAD linked oxidase-like  35.27 
 
 
459 aa  99.4  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.604176  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0404  putative reticuline oxidase  30.77 
 
 
448 aa  98.2  3e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.993736  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>