More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1595 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_1595  phosphoesterase, PA-phosphatase related  100 
 
 
458 aa  886    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2311  SNARE associated Golgi protein  47.85 
 
 
259 aa  181  2.9999999999999997e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000116146 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0031  hypothetical protein  48.91 
 
 
268 aa  179  7e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2579  hypothetical protein  47.31 
 
 
256 aa  179  8e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00440757  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0017  SNARE associated Golgi protein  42.5 
 
 
363 aa  178  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.447324  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0132  SNARE associated Golgi protein  48.65 
 
 
237 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.365407  decreased coverage  0.0000235996 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0127  hypothetical protein  48.65 
 
 
237 aa  175  1.9999999999999998e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35260  uncharacterized membrane-associated protein  43.24 
 
 
277 aa  172  7.999999999999999e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6926  SNARE associated Golgi protein  40.93 
 
 
249 aa  172  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2971  SNARE associated Golgi protein-related protein  43.59 
 
 
286 aa  159  9e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2201  hypothetical protein  42.41 
 
 
218 aa  159  1e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2173  hypothetical protein  43.01 
 
 
218 aa  159  1e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30240  uncharacterized membrane-associated protein  43.01 
 
 
228 aa  158  2e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.397546 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5157  SNARE associated Golgi protein  40.7 
 
 
235 aa  154  2e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2799  hypothetical protein  41.03 
 
 
220 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2597  hypothetical protein  39.49 
 
 
219 aa  153  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.651507 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1169  SNARE associated Golgi protein  37.37 
 
 
217 aa  153  5e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.922899  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2555  hypothetical protein  39.49 
 
 
219 aa  153  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2509  hypothetical protein  39.49 
 
 
219 aa  153  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2718  hypothetical protein  39.49 
 
 
219 aa  153  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.261998  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2866  hypothetical protein  42.13 
 
 
219 aa  153  7e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.416299 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1466  hypothetical protein  41.03 
 
 
221 aa  152  8.999999999999999e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02242  conserved inner membrane protein  40.82 
 
 
219 aa  151  2e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1339  SNARE associated Golgi protein-like protein  40.82 
 
 
219 aa  151  2e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.217693  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02202  hypothetical protein  40.82 
 
 
219 aa  151  2e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4065  SNARE associated Golgi protein-like protein  42.79 
 
 
240 aa  151  2e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1335  hypothetical protein  40.82 
 
 
219 aa  151  2e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.64425 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2609  hypothetical protein  38.97 
 
 
219 aa  152  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.36856  normal  0.051576 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2468  hypothetical protein  40.82 
 
 
219 aa  151  2e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3457  hypothetical protein  40.82 
 
 
219 aa  151  2e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1369  hypothetical protein  41.5 
 
 
221 aa  149  9e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.25777  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1148  hypothetical protein  37.88 
 
 
211 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3395  SNARE associated Golgi protein  44.1 
 
 
216 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0005  integral membrane protein; DedA family protein  38.92 
 
 
218 aa  147  3e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.695694  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2695  hypothetical protein  39.8 
 
 
219 aa  147  3e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3333  hypothetical protein  38.46 
 
 
220 aa  147  4.0000000000000006e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00119993  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2611  hypothetical protein  39.8 
 
 
219 aa  147  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2715  SNARE associated Golgi protein  39.9 
 
 
221 aa  146  7.0000000000000006e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.65306 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1301  DedA protein (DSG-1 protein)  42.31 
 
 
230 aa  146  9e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0955835  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2473  hypothetical protein  38.78 
 
 
219 aa  144  2e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0237  hypothetical protein  39.81 
 
 
236 aa  144  3e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4068  SNARE associated Golgi protein  38.8 
 
 
220 aa  144  3e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.379921  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3163  hypothetical protein  39.9 
 
 
213 aa  144  4e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1076  hypothetical protein  39.2 
 
 
221 aa  144  5e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.313022  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11720  hypothetical protein  38.69 
 
 
221 aa  143  5e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2029  DedA protein (DSG-1 protein)  41.21 
 
 
218 aa  143  5e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1150  SNARE associated Golgi protein  37.62 
 
 
224 aa  143  6e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.66321e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0668  hypothetical protein  40.38 
 
 
232 aa  143  6e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.791744 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4180  SNARE associated Golgi protein  45.08 
 
 
246 aa  143  7e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.531841  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1312  SNARE associated Golgi protein  39.04 
 
 
229 aa  143  8e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.192929 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2073  SNARE associated Golgi protein-like protein  41.54 
 
 
231 aa  142  9e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.520648  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1368  integral membrane protein  42.21 
 
 
221 aa  142  9.999999999999999e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.377957  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1987  SNARE associated Golgi protein  40.51 
 
 
222 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.446526  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2156  SNARE associated Golgi protein  43.08 
 
 
215 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000142104 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2527  membrane protein, DedA family  43.08 
 
 
215 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1317  SNARE associated Golgi protein  47.02 
 
 
223 aa  140  3e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0112006  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1467  SNARE associated Golgi protein  41.21 
 
 
213 aa  141  3e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4444  SNARE associated Golgi protein  35.86 
 
 
218 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5129  SNARE associated Golgi protein  41.08 
 
 
244 aa  140  3.9999999999999997e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.958225 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0575  DedA family protein  38.12 
 
 
213 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.684924  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1127  SNARE associated Golgi protein  39.56 
 
 
219 aa  140  4.999999999999999e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.325402 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2575  hypothetical protein  38.46 
 
 
232 aa  140  6e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0509  SNARE associated Golgi protein-related protein  42.35 
 
 
239 aa  140  6e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0086  SNARE associated Golgi protein  37.44 
 
 
216 aa  139  7.999999999999999e-32  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.862215  hitchhiker  0.00916794 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3465  SNARE associated Golgi protein  39.46 
 
 
222 aa  139  8.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.133962  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27115  predicted protein  39.5 
 
 
252 aa  139  1e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000197052  normal  0.0145567 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4224  DedA protein (DSG-1 protein)  38.92 
 
 
220 aa  139  1e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0539738  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1759  hypothetical protein  39.7 
 
 
213 aa  138  2e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.335415  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0667  DedA family protein  42.21 
 
 
227 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.385755  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1943  DedA protein  36.41 
 
 
220 aa  138  3.0000000000000003e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.777005  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0895  SNARE associated Golgi protein  40.11 
 
 
220 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4379  hypothetical protein  49.68 
 
 
234 aa  138  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.76296  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0980  DedA protein (DSG-1 protein)  39.56 
 
 
220 aa  137  4e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.275118  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4069  SNARE associated Golgi protein  41.89 
 
 
219 aa  137  6.0000000000000005e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00208186  hitchhiker  0.00137396 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0360  hypothetical protein  38.97 
 
 
220 aa  136  7.000000000000001e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1421  hypothetical protein  38.97 
 
 
220 aa  136  7.000000000000001e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1530  hypothetical protein  38.97 
 
 
220 aa  136  7.000000000000001e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1474  SNARE associated Golgi protein  41.53 
 
 
214 aa  136  9.999999999999999e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1142  SNARE associated Golgi protein  41.97 
 
 
216 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4066  SNARE associated Golgi protein-like protein  42.86 
 
 
248 aa  134  1.9999999999999998e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10369  transmembrane protein  43.27 
 
 
227 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.702136 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1497  SNARE associated Golgi protein-like protein  38.92 
 
 
201 aa  134  3e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.330026  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0602  SNARE associated Golgi protein  39.29 
 
 
279 aa  134  3e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.688276 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3233  SNARE associated Golgi protein  33.64 
 
 
230 aa  134  3e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0801636 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2482  dedA protein  46.36 
 
 
198 aa  134  3.9999999999999996e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.323289  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0585  SNARE associated Golgi protein  39.15 
 
 
215 aa  133  5e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.654254 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2559  DEDA DSG-1 protein transmembrane  38.89 
 
 
218 aa  133  7.999999999999999e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0105855  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2768  hypothetical protein  39.3 
 
 
212 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.375842  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1922  hypothetical protein  39.34 
 
 
218 aa  131  2.0000000000000002e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000155723  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2835  SNARE associated Golgi protein  37.88 
 
 
215 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.691658  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2429  SNARE associated Golgi protein  37.88 
 
 
215 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2907  hypothetical protein  37.81 
 
 
219 aa  130  6e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1299  hypothetical protein  38.04 
 
 
241 aa  130  6e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.724707  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3663  SNARE associated Golgi protein-like protein  36.6 
 
 
209 aa  129  8.000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0592  SNARE associated Golgi protein  39.15 
 
 
215 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0706  SNARE associated Golgi protein-like protein  36.41 
 
 
213 aa  129  9.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.240923  normal  0.524025 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1321  hypothetical protein  37.86 
 
 
253 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.777218  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01570  uncharacterized membrane-associated protein  39.08 
 
 
235 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00544447 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0540  SNARE associated Golgi protein  38.62 
 
 
215 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4994  hypothetical protein  37.95 
 
 
216 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.579773 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>