154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1535 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1535  putative surface antigen protein  100 
 
 		 347 aa  688    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4601  hypothetical protein  41.36 
 
 		 335 aa  239  5e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.998258  normal  0.16736 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6194  hypothetical protein  38.82 
 
 		 348 aa  237  3e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.209099  hitchhiker  0.000235981 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1698  hypothetical protein  41.08 
 
 		 358 aa  231  2e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.555013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2034  hypothetical protein  41.08 
 
 		 358 aa  231  2e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.571695  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0079  hypothetical protein  40.42 
 
 		 345 aa  230  3e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0781813  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0062  hypothetical protein  40.42 
 
 		 345 aa  226  3e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4252  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  40.83 
 
 		 344 aa  224  2e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3441  hypothetical protein  29.51 
 
 		 331 aa  138  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.597257 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6734  hypothetical protein  25.76 
 
 		 338 aa  83.2  0.000000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.745861 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6377  hypothetical protein  26.12 
 
 		 340 aa  80.1  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.498537  normal  0.74546 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3772  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.44 
 
 		 406 aa  71.2  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3685  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  27.57 
 
 		 384 aa  71.6  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2124  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  23.42 
 
 		 320 aa  65.5  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0490929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3003  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.45 
 
 		 752 aa  65.1  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000481443  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2474  serine/threonine protein kinase  24.62 
 
 		 776 aa  63.5  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000122678  hitchhiker  0.00951365 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2094  hypothetical protein  22.69 
 
 		 343 aa  62.4  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.327538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  23.39 
 
 		 1094 aa  62  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1242  hypothetical protein  27.63 
 
 		 810 aa  61.2  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3937  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.64 
 
 		 334 aa  60.5  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.328417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5700  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.81 
 
 		 362 aa  59.7  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.851059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10998  PE-PGRS family protein  35 
 
 		 457 aa  59.7  0.00000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104383  normal  0.995085 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  22.61 
 
 		 1667 aa  59.3  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1471  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.01 
 
 		 348 aa  58.9  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0188  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  21.79 
 
 		 384 aa  58.9  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3149  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  21.79 
 
 		 336 aa  58.5  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.392869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1180  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.61 
 
 		 348 aa  58.2  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2846  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  23.9 
 
 		 333 aa  57  0.0000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0101  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  30 
 
 		 354 aa  57.4  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06180  YVTN family beta-propeller repeat protein  29.75 
 
 		 408 aa  57  0.0000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1651  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  22.75 
 
 		 366 aa  56.6  0.0000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0495995  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1167  hypothetical protein  19.06 
 
 		 355 aa  56.6  0.0000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5321  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.44 
 
 		 362 aa  56.6  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5410  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.44 
 
 		 362 aa  56.6  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.186249 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1435  hypothetical protein  21.86 
 
 		 335 aa  56.6  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.61404 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3143  cell surface protein  27.11 
 
 		 819 aa  55.5  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.302282  normal  0.566596 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4548  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.53 
 
 		 347 aa  55.8  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.433204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3230  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.68 
 
 		 517 aa  55.5  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.476229  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1839  hypothetical protein  23.95 
 
 		 330 aa  54.7  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.172437  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6515  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.77 
 
 		 385 aa  55.5  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.761865  normal  0.0861969 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2189  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  27.08 
 
 		 348 aa  55.1  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3533  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  25 
 
 		 488 aa  54.3  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.593407 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6158  hypothetical protein  23.08 
 
 		 335 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0312  hypothetical protein  22.27 
 
 		 332 aa  53.9  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.587452  normal  0.312586 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0108  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  26.39 
 
 		 354 aa  53.9  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3620  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.89 
 
 		 324 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.793181  normal  0.0342651 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3892  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.37 
 
 		 660 aa  53.5  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5463  hypothetical protein  24.68 
 
 		 329 aa  53.1  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0496  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  26.01 
 
 		 305 aa  53.1  0.000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.511755  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1749  hypothetical protein  23.35 
 
 		 330 aa  52.8  0.000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.472818  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2775  hypothetical protein  23.35 
 
 		 330 aa  52.8  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2258  hypothetical protein  23.35 
 
 		 330 aa  52.8  0.000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.61196  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3062  hypothetical protein  23.35 
 
 		 330 aa  52.8  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.0002291  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2696  hypothetical protein  23.35 
 
 		 330 aa  52.8  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0538504  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1529  hypothetical protein  23.35 
 
 		 330 aa  52.8  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.435429  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0028  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  22.22 
 
 		 340 aa  52.8  0.000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.828005  decreased coverage  0.000046618 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0029  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  22.22 
 
 		 340 aa  52.8  0.000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0027  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  22.22 
 
 		 340 aa  52.8  0.000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.802386 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2259  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  21.67 
 
 		 326 aa  52.8  0.000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.669403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2640  hypothetical protein  23.35 
 
 		 330 aa  52.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.388578  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0027  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  23.53 
 
 		 328 aa  52.4  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.804553 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2413  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.1 
 
 		 335 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.992934 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1536  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  26.21 
 
 		 362 aa  52  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8029  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  28.57 
 
 		 314 aa  52  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.882346  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26380  Twin-arginine translocation pathway signal  28.17 
 
 		 331 aa  51.6  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.933141  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1117  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.03 
 
 		 329 aa  52  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.472449  normal  0.949748 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4869  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  26 
 
 		 362 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.130812 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5923  hypothetical protein  24.03 
 
 		 329 aa  50.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2154  hypothetical protein  24.03 
 
 		 329 aa  50.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.305615  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2714  hypothetical protein  22.89 
 
 		 310 aa  51.2  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.375207 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2172  hypothetical protein  24.03 
 
 		 329 aa  50.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.928709 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4199  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.75 
 
 		 316 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13098  normal  0.347847 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2064  hypothetical protein  23.23 
 
 		 329 aa  50.1  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4136  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  21.74 
 
 		 345 aa  50.4  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0910022  normal  0.508786 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1516  hypothetical protein  21.94 
 
 		 339 aa  50.1  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.610036  normal  0.125347 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2191  hypothetical protein  23.23 
 
 		 329 aa  50.1  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5392  YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  21.76 
 
 		 377 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0101451 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0586  putative receptor  26.71 
 
 		 358 aa  49.3  0.00009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1892  hypothetical protein  24.43 
 
 		 334 aa  49.3  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.181009  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0162  hypothetical protein  22.3 
 
 		 387 aa  48.9  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2620  hypothetical protein  20 
 
 		 339 aa  48.9  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0272263  normal  0.878921 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1302  hypothetical protein  25.71 
 
 		 364 aa  48.9  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.127226  normal  0.259109 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1335  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.52 
 
 		 324 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.911892  normal  0.360031 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6378  hypothetical protein  27.21 
 
 		 556 aa  48.5  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.355816 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5134  hypothetical protein  25.51 
 
 		 384 aa  48.1  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0254476  normal  0.895353 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1486  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  21.57 
 
 		 337 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.814871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1241  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  22.22 
 
 		 320 aa  48.5  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0330167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1260  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.36 
 
 		 345 aa  48.1  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.226766  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1940  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  22.22 
 
 		 320 aa  48.5  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.960235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4621  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  26.79 
 
 		 318 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.70566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2583  hypothetical protein  22.22 
 
 		 312 aa  47.8  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7989  NHL repeat containing protein  22.96 
 
 		 335 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.575818  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2068  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.32 
 
 		 328 aa  47.8  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1984  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.19 
 
 		 464 aa  47.4  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.584863  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0104  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  22.39 
 
 		 353 aa  47.4  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2626  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.23 
 
 		 659 aa  47.8  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1253  hypothetical protein  23.91 
 
 		 679 aa  47  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.337339  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3134  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  23.45 
 
 		 329 aa  47  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4507  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  31.19 
 
 		 314 aa  47  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.790571  normal  0.70615 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2907  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.11 
 
 		 601 aa  47  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>