222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1497 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_5341  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  75.47 
 
 
633 aa  944    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1877  Hydantoinase B/oxoprolinase  77.11 
 
 
613 aa  951    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6594  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  75.91 
 
 
624 aa  931    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1497  hydantoinase B/oxoprolinase  100 
 
 
659 aa  1328    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00877273  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20950  N-methylhydantoinase B/acetone carboxylase, alpha subunit  85.02 
 
 
647 aa  1122    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0800854 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0123  Hydantoinase B/oxoprolinase  76.39 
 
 
623 aa  946    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.242495  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2225  5-oxoprolinase  74.57 
 
 
611 aa  915    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.113832  normal  0.624978 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3090  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  34.73 
 
 
645 aa  313  7.999999999999999e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0547803  hitchhiker  0.000201646 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3492  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  34.24 
 
 
645 aa  305  2.0000000000000002e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3602  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  34.33 
 
 
597 aa  296  6e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0175  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  32.91 
 
 
628 aa  279  1e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3415  Hydantoinase B/oxoprolinase  33.39 
 
 
578 aa  278  3e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.41537  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4192  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  33.22 
 
 
580 aa  277  5e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4582  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  33.01 
 
 
577 aa  277  6e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6261  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.54 
 
 
577 aa  272  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0857847  normal  0.425917 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1695  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  33.12 
 
 
632 aa  267  4e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2859  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.96 
 
 
629 aa  263  6e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.832595  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01100  hypothetical 5-oxoprolinase (Eurofung)  30.1 
 
 
1355 aa  248  2e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0381114 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4144  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.21 
 
 
601 aa  245  1.9999999999999999e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.969544  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6535  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.5 
 
 
582 aa  242  1e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.479598 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00009  hypothetical N-methylhydantoinase (Eurofung)  31.96 
 
 
1362 aa  239  8e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00000169521 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3764  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.1 
 
 
564 aa  238  2e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5647  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.08 
 
 
582 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.753702  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9149  hydantoin utilization protein  30.28 
 
 
566 aa  233  8.000000000000001e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.288319  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2446  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.08 
 
 
583 aa  223  9e-57  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3732  hydantoinase B/oxoprolinase  31.34 
 
 
674 aa  221  3.9999999999999997e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0476  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  33.45 
 
 
579 aa  220  6e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0372  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.54 
 
 
616 aa  219  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.014712  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1718  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.61 
 
 
556 aa  218  4e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1474  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.55 
 
 
660 aa  211  3e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.468362 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0692  hydantoin utilization protein B  31.47 
 
 
565 aa  209  1e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.755562  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9129  hydantoin utilization protein  30.73 
 
 
640 aa  205  2e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2708  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.07 
 
 
527 aa  203  8e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1062  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.91 
 
 
519 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0859035  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1981  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.41 
 
 
562 aa  201  3e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.307299  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2646  hydantoinase B/oxoprolinase  27.36 
 
 
647 aa  199  1.0000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4352  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.53 
 
 
594 aa  197  6e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3921  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.64 
 
 
534 aa  197  7e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.710611  normal  0.101565 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2300  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.22 
 
 
585 aa  196  2e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.56332  normal  0.0979902 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3956  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.3 
 
 
681 aa  194  3e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5219  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.87 
 
 
568 aa  195  3e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.667486  normal  0.287509 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1966  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.74 
 
 
589 aa  194  5e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2633  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.34 
 
 
577 aa  193  8e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.286418 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2941  5-oxoprolinase  30.1 
 
 
579 aa  193  9e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8319  hydantoin utilization protein  29.88 
 
 
574 aa  191  4e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.113582  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8174  hydantoin utilization protein  29.2 
 
 
585 aa  189  1e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.246451  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3648  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.52 
 
 
564 aa  189  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.101613  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0080  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.92 
 
 
572 aa  187  4e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.740516  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3663  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.43 
 
 
586 aa  187  4e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0156041 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4973  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.58 
 
 
652 aa  187  6e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.175977 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3569  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.96 
 
 
575 aa  186  1.0000000000000001e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8487  Hydantoinase B/oxoprolinase  28.07 
 
 
671 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0561  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.54 
 
 
524 aa  185  2.0000000000000003e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.899145  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2569  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.45 
 
 
1382 aa  184  4.0000000000000006e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0376  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  25.95 
 
 
657 aa  183  9.000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0791  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.2 
 
 
670 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.549712 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2411  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.72 
 
 
515 aa  181  4e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.381663  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0037  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.46 
 
 
531 aa  180  5.999999999999999e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1968  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.87 
 
 
528 aa  180  9e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.302268  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5989  N-methylhydantoinase B (Hydantoin utilization protein B)  30.63 
 
 
577 aa  179  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0982181 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4027  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.8 
 
 
558 aa  178  2e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5473  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.02 
 
 
552 aa  179  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.691063  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4429  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.73 
 
 
581 aa  178  3e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28701  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3306  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.57 
 
 
561 aa  178  3e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.32832  normal  0.98941 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1934  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.82 
 
 
561 aa  177  4e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2849  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.3 
 
 
628 aa  177  7e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5833  hydantoin utilization protein  30.34 
 
 
563 aa  176  9e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2528  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.1 
 
 
629 aa  172  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165308  normal  0.701277 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0727  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.11 
 
 
513 aa  170  8e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3642  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.73 
 
 
557 aa  170  1e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0467  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.21 
 
 
514 aa  170  1e-40  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.011841  hitchhiker  0.0000000457573 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1578  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.95 
 
 
541 aa  168  2.9999999999999998e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3534  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.47 
 
 
519 aa  168  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0275589 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1059  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.52 
 
 
599 aa  167  4e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.331843  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0802  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.37 
 
 
561 aa  167  5.9999999999999996e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.36294  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1560  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.56 
 
 
584 aa  167  8e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0126981  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2084  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.88 
 
 
587 aa  166  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.81629  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5965  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.27 
 
 
597 aa  165  3e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744958  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5330  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.86 
 
 
708 aa  164  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.288616 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7017  hydantoin utilization protein  27.11 
 
 
571 aa  162  1e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5621  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.86 
 
 
708 aa  163  1e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.99583 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1128  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.02 
 
 
510 aa  162  2e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4825  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.09 
 
 
586 aa  161  3e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.308896  normal  0.0497189 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0424  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.92 
 
 
514 aa  161  3e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5631  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.99 
 
 
598 aa  160  6e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0685105 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3096  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.6 
 
 
775 aa  159  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.16642  normal  0.217723 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1513  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.2 
 
 
1230 aa  159  1e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.706946  normal  0.501464 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4926  Hydantoin utilization protein B  28.77 
 
 
551 aa  158  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.253759  normal  0.500561 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2496  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.63 
 
 
521 aa  158  4e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0398  hydantoinase/oxoprolinase  26.72 
 
 
1277 aa  157  5.0000000000000005e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0414  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.24 
 
 
513 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2414  hydantoinase B/oxoprolinase  27.76 
 
 
581 aa  156  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.49373  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2462  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.47 
 
 
515 aa  156  1e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3807  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.42 
 
 
1206 aa  154  5e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3345  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  25.79 
 
 
1258 aa  154  7e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0277673 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5242  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.69 
 
 
646 aa  153  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.860523  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3514  hydantoinase B/oxoprolinase  27.6 
 
 
581 aa  153  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3104  N-methylhydantoinase B/acetone carboxylase, alpha subunit  29.77 
 
 
537 aa  152  1e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0131  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.68 
 
 
517 aa  153  1e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.367473  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3116  Hydantoinase B/oxoprolinase  27.85 
 
 
548 aa  153  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.708743  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>