More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1447 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1447  MgtE intracellular region  100 
 
 		 424 aa  843    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.202567  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1134  MgtE intracellular region  61.74 
 
 		 412 aa  486  1e-136  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.121056  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1190  MgtE intracellular region  58.8 
 
 		 445 aa  479  1e-134  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.067335  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1818  MgtE intracellular region  62.16 
 
 		 429 aa  481  1e-134  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.705628 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0802  MgtE intracellular region  58.05 
 
 		 416 aa  466  9.999999999999999e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8408  MgtE intracellular region  57.49 
 
 		 426 aa  467  9.999999999999999e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.879169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1158  MgtE intracellular region  57.21 
 
 		 435 aa  452  1.0000000000000001e-126  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.328594  normal  0.0567731 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0701  MgtE intracellular region  56.52 
 
 		 431 aa  453  1.0000000000000001e-126  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3817  MgtE intracellular region  57.32 
 
 		 447 aa  453  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.446632  normal  0.333957 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2510  MgtE intracellular region  52.91 
 
 		 427 aa  445  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000104929 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2483  MgtE intracellular region  57.77 
 
 		 435 aa  442  1e-123  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0317832 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3009  MgtE intracellular region  56.44 
 
 		 402 aa  442  1e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.315291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0664  MgtE intracellular region  55.26 
 
 		 427 aa  444  1e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.108649 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2208  MgtE intracellular region  54.11 
 
 		 432 aa  437  1e-121  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.55571 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0717  MgtE intracellular region  54.83 
 
 		 428 aa  434  1e-120  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.205021 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2790  MgtE intracellular region  51.52 
 
 		 427 aa  433  1e-120  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.045049  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0901  MgtE intracellular region  53.46 
 
 		 474 aa  430  1e-119  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.885625  normal  0.115332 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19370  Mg/Co/Ni transporter MgtE with CBS domain  54.37 
 
 		 440 aa  425  1e-118  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0503098  normal  0.0197915 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0122  MgtE intracellular region  54.79 
 
 		 454 aa  426  1e-118  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.522016 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4488  MgtE intracellular region  52.66 
 
 		 431 aa  428  1e-118  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.837041  normal  0.0679384 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27830  Mg/Co/Ni transporter MgtE with CBS domain  54.78 
 
 		 427 aa  422  1e-117  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.885994 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1681  MgtE intracellular region  54.01 
 
 		 431 aa  424  1e-117  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000106965  normal  0.399701 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4001  MgtE intracellular region  52.17 
 
 		 431 aa  421  1e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.114119  normal  0.413173 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0766  MgtE intracellular region  57.28 
 
 		 430 aa  421  1e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4061  MgtE intracellular region  52.17 
 
 		 431 aa  421  1e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.803121  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2913  MgtE intracellular region  56.27 
 
 		 430 aa  418  9.999999999999999e-116  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.553029  normal  0.0535058 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1864  MgtE intracellular region  52.9 
 
 		 438 aa  413  1e-114  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15330  Mg/Co/Ni transporter MgtE with CBS domain  50.99 
 
 		 422 aa  411  1e-113  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.346083  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3987  MgtE intracellular region  51.61 
 
 		 417 aa  406  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.576405  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1195  MgtE intracellular region  48.91 
 
 		 427 aa  386  1e-106  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.680204  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11257  hypothetical protein  50 
 
 		 435 aa  378  1e-104  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000354165 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11290  Mg/Co/Ni transporter MgtE with CBS domain  50.24 
 
 		 453 aa  375  1e-103  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.371515  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2338  MgtE intracellular region  35.04 
 
 		 421 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1738  MgtE intracellular region  30.07 
 
 		 430 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2041  MgtE intracellular region  29.38 
 
 		 426 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000239361  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1158  MgtE intracellular region  27.44 
 
 		 420 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0076  MgtE intracellular region  29.64 
 
 		 459 aa  147  5e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.740588  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3240  MgtE intracellular region  28.12 
 
 		 433 aa  140  4.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0069  MgtE intracellular region  27.68 
 
 		 625 aa  137  3.0000000000000003e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0656  MgtE intracellular region  26.85 
 
 		 417 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000076098  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7400  hypothetical protein  29.17 
 
 		 430 aa  127  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.090921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0595  CBS domain-containing protein  30.42 
 
 		 418 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.297001  normal  0.536913 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1530  CBS domain-containing protein  24.59 
 
 		 423 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000568419  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1323  CBS domain-containing protein  24.42 
 
 		 423 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000111673  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2168  magnesium transporter  34.36 
 
 		 453 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.571792  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0475  MgtE intracellular region  30.33 
 
 		 413 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.45499  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4217  magnesium transporter  35.74 
 
 		 452 aa  121  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1461  magnesium transporter  31.97 
 
 		 463 aa  117  5e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00122115  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2396  CBS domain-containing protein  25.19 
 
 		 425 aa  114  2.0000000000000002e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0809  magnesium transporter  31.49 
 
 		 542 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2720  magnesium transporter  30.09 
 
 		 453 aa  113  5e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.786081  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1172  divalent cation transporter  29.96 
 
 		 450 aa  110  5e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000987618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1832  magnesium transporter  33.79 
 
 		 460 aa  110  6e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0187947  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0891  magnesium transporter  32.13 
 
 		 449 aa  108  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00182098 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0876  magnesium transporter  31.93 
 
 		 465 aa  108  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0822  magnesium transporter  31.93 
 
 		 465 aa  108  2e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0481  magnesium transporter  32.22 
 
 		 450 aa  107  4e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000026878  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1689  magnesium transporter  26.8 
 
 		 449 aa  107  6e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1669  magnesium transporter  29.64 
 
 		 462 aa  106  7e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1642  magnesium transporter  29.25 
 
 		 462 aa  106  7e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0596  magnesium transporter  29.79 
 
 		 451 aa  106  9e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000141787  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2520  magnesium transporter  35.08 
 
 		 454 aa  105  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.624288 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2656  Mg/Co/Ni transporter MgtE  28.61 
 
 		 412 aa  105  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3303  magnesium transporter  31.09 
 
 		 461 aa  105  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1691  magnesium transporter  31.17 
 
 		 452 aa  105  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0276763 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1588  response regulator receiver protein  30.3 
 
 		 446 aa  103  4e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03755  magnesium transporter  28.68 
 
 		 449 aa  103  5e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.578894  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2786  magnesium transporter  35.34 
 
 		 463 aa  102  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1654  response regulator receiver protein  30.3 
 
 		 446 aa  102  1e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.399924  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2600  magnesium transporter  29.58 
 
 		 463 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0331  magnesium transporter  29.82 
 
 		 458 aa  102  2e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03198  Mg/Co/Ni transporter MgtE (contains CBS domain)  29.39 
 
 		 452 aa  101  3e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000340775  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4147  magnesium transporter  28.63 
 
 		 454 aa  100  5e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.235845 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1980  magnesium transporter  27.63 
 
 		 451 aa  100  5e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0681  transcriptional regulator  28.63 
 
 		 454 aa  100  5e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0092  MgtE intracellular region  25.06 
 
 		 425 aa  100  6e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0286357 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2899  magnesium transporter  28.3 
 
 		 480 aa  99.8  8e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2089  magnesium transporter  30 
 
 		 460 aa  99.8  9e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1436  MgtE intracellular region  22.27 
 
 		 425 aa  99  1e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00000684076  decreased coverage  0.0000760195 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6844  magnesium transporter  33.61 
 
 		 454 aa  99  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.724655 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1471  magnesium transporter  30.67 
 
 		 449 aa  98.6  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2430  divalent cation transporter  28.86 
 
 		 466 aa  99  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0143004 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2879  magnesium transporter  30.29 
 
 		 451 aa  98.6  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1567  magnesium transporter  29.66 
 
 		 481 aa  98.6  2e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0702  magnesium transporter  27.53 
 
 		 454 aa  98.2  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.952021 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3673  magnesium transporter  27.53 
 
 		 454 aa  98.2  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0193522  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25770  Mg2+ transporter MgtE  27.88 
 
 		 462 aa  97.4  4e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0681  magnesium transporter  27.87 
 
 		 454 aa  97.4  4e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.299447  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0667  magnesium transporter  28.33 
 
 		 454 aa  97.4  4e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0861056  normal  0.126448 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0711  magnesium transporter  27.87 
 
 		 454 aa  97.4  4e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.194916  normal  0.348771 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1269  magnesium transporter  30.07 
 
 		 465 aa  97.1  5e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0779643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2831  magnesium transporter  28.99 
 
 		 458 aa  97.1  6e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0965  magnesium transporter  30.52 
 
 		 481 aa  97.1  6e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.105361  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4471  magnesium transporter  28.84 
 
 		 480 aa  96.7  7e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.223346 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12500  magnesium transporter  27.31 
 
 		 442 aa  96.7  7e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3966  magnesium transporter  27.13 
 
 		 454 aa  96.7  7e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0668  magnesium transporter  28.33 
 
 		 454 aa  96.7  7e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.175865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3354  magnesium transporter  28.33 
 
 		 454 aa  96.7  7e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.399526  normal  0.0702195 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1444  magnesium transporter  28.84 
 
 		 480 aa  96.7  7e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0516873  normal  0.652895 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2506  divalent cation transporter  29.2 
 
 		 494 aa  96.3  8e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>